RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412161.1

SYNE1-AS1-201, SYNE1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SYNE1-AS1, Length 553 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PRDM1O75626 825 aa10.12□□□□□ -0.79
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SLC25A27O95847 323 aa10.12□□□□□ -0.79
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GRK4P32298 578 aa10.12□□□□□ -0.79
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RGS19P49795 217 aa10.12□□□□□ -0.79
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KLRC3Q07444 240 aa10.12□□□□□ -0.79
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 IQCA1Q86XH1 822 aa10.12□□□□□ -0.79
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZNF333Q96JL9 665 aa10.12□□□□□ -0.79
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NUDT12Q9BQG2 462 aa10.12□□□□□ -0.79
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PAGR1Q9BTK6 254 aa10.12□□□□□ -0.79
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KRT23Q9C075 422 aa10.12□□□□□ -0.79
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa10.12□□□□□ -0.79
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MROH8Q9H579 483 aa10.12□□□□□ -0.79
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RBPJLQ9UBG7 517 aa10.12□□□□□ -0.79
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CLIP2Q9UDT6 1046 aa10.12□□□□□ -0.79
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FEM1BQ9UK73 627 aa10.12□□□□□ -0.79
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PNMA2Q9UL42 364 aa10.12□□□□□ -0.79
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa10.12□□□□□ -0.79
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa10.12□□□□□ -0.79
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa10.12□□□□□ -0.79
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SMIM22K7EJ46 135 aa10.11□□□□□ -0.79
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PITPNM1O00562 1244 aa10.11□□□□□ -0.79
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 STRNO43815 780 aa10.11□□□□□ -0.79
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NDUFB10O96000 172 aa10.11□□□□□ -0.79
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TOP1P11387 765 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RGS2P41220 211 aa10.11□□□□□ -0.79
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FLT3LGP49771 235 aa10.11□□□□□ -0.79
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 OAZ1P54368 228 aa10.11□□□□□ -0.79
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PRKCZQ05513 592 aa10.11□□□□□ -0.79
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CTDSPL2Q05D32 466 aa10.11□□□□□ -0.79
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TRDNQ13061 729 aa10.11□□□□□ -0.79
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa10.11□□□□□ -0.79
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PLEKHH3Q7Z736 793 aa10.11□□□□□ -0.79
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FAM160B2Q86V87 743 aa10.11□□□□□ -0.79
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ABRAQ8N0Z2 381 aa10.11□□□□□ -0.79
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NKX2-3Q8TAU0 364 aa10.11□□□□□ -0.79
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CHURC1Q8WUH1 139 aa10.11□□□□□ -0.79
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SLF1Q9BQI6 1058 aa10.11□□□□□ -0.79
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TMEM106CQ9BVX2 250 aa10.11□□□□□ -0.79
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TOMM22Q9NS69 142 aa10.11□□□□□ -0.79
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SLC5A4Q9NY91 659 aa10.11□□□□□ -0.79
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 STX8Q9UNK0 236 aa10.11□□□□□ -0.79
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PLXNB2O15031 1838 aa10.11□□□□□ -0.79
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SLC15A5A6NIM6 579 aa10.1□□□□□ -0.79
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ATP2A1O14983 1001 aa10.1□□□□□ -0.79
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ADCY3O60266 1144 aa10.1□□□□□ -0.79
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 HMGCRP04035 888 aa10.1□□□□□ -0.79
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 BMP3P12645 472 aa10.1□□□□□ -0.79
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CTGFP29279 349 aa10.1□□□□□ -0.79
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 STAT2P52630 851 aa10.1□□□□□ -0.79
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GPR142Q7Z601 462 aa10.1□□□□□ -0.79
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DGKHQ86XP1 1220 aa10.1□□□□□ -0.79
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CLEC10AQ8IUN9 316 aa10.1□□□□□ -0.79
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SPICE1Q8N0Z3 855 aa10.1□□□□□ -0.79
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DCAF4Q8WV16 495 aa10.1□□□□□ -0.79
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 APBA2Q99767 749 aa10.1□□□□□ -0.79
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SPATC1LQ9H0A9 340 aa10.1□□□□□ -0.79
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TXNRD2Q9NNW7 524 aa10.1□□□□□ -0.79
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PPP4R2Q9NY27 417 aa10.1□□□□□ -0.79
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 VWA5AO00534 786 aa10.09□□□□□ -0.79
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CNMDO75829 334 aa10.09□□□□□ -0.79
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 HOXC6P09630 235 aa10.09□□□□□ -0.79
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SLC1A4P43007 532 aa10.09□□□□□ -0.79
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 HAND2P61296 217 aa10.09□□□□□ -0.79
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CAP1Q01518 475 aa10.09□□□□□ -0.79
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GRB14Q14449 540 aa10.09□□□□□ -0.79
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FAM47AQ5JRC9 791 aa10.09□□□□□ -0.79
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FAM83BQ5T0W9 1011 aa10.09□□□□□ -0.79
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SLFN13Q68D06 897 aa10.09□□□□□ -0.79
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP10.09□□□□□ -0.79
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TBC1D10CQ8IV04 446 aa10.09□□□□□ -0.79
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 STK11IPQ8N1F8 1099 aa10.09□□□□□ -0.79
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ATG4CQ96DT6 458 aa10.09□□□□□ -0.79
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MTA3Q9BTC8 594 aa10.09□□□□□ -0.79
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TEX13BQ9BXU2 312 aa10.09□□□□□ -0.79
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FBXO40Q9UH90 709 aa10.09□□□□□ -0.79
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GJD2Q9UKL4 321 aa10.09□□□□□ -0.79
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RAD21O60216 631 aa10.08□□□□□ -0.8
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZBED4O75132 1171 aa10.08□□□□□ -0.8
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CDC45O75419 566 aa10.08□□□□□ -0.8
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PTPREP23469 700 aa10.08□□□□□ -0.8
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MAP2K5Q13163 448 aa10.08□□□□□ -0.8
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SART3Q15020 963 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TKFCQ3LXA3 575 aa10.08□□□□□ -0.8
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa10.08□□□□□ -0.8
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MORN1Q5T089 497 aa10.08□□□□□ -0.8
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RIOX2Q8IUF8 465 aa10.08□□□□□ -0.8
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ANKS1AQ92625 1134 aa10.08□□□□□ -0.8
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 USP6NLQ92738 828 aa10.08□□□□□ -0.8
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MAP4K1Q92918 833 aa10.08□□□□□ -0.8
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa10.08□□□□□ -0.8
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 UBAC1Q9BSL1 405 aa10.08□□□□□ -0.8
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.7 ms