RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411083.1

RNU6-1135P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1135, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1135P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1135P-201ENST00000411083 ZNF20P17024 532 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-1135P-201ENST00000411083 ARL4AP40617 200 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-1135P-201ENST00000411083 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP3.61□□□□□ -1.83
RNU6-1135P-201ENST00000411083 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP3.61□□□□□ -1.83
RNU6-1135P-201ENST00000411083 LIMS1P48059 325 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-1135P-201ENST00000411083 SERPINB4P48594 390 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-1135P-201ENST00000411083 ERVFRD-1P60508 538 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-1135P-201ENST00000411083 CAP1Q01518 475 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-1135P-201ENST00000411083 RAB3GAP1Q15042 981 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-1135P-201ENST00000411083 USP51Q70EK9 711 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-1135P-201ENST00000411083 WAPLQ7Z5K2 1190 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-1135P-201ENST00000411083 SUSD2Q9UGT4 822 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-1135P-201ENST00000411083 EGFL7Q9UHF1 273 aa3.61□□□□□ -1.83
RNU6-1135P-201ENST00000411083 PFKLP17858 780 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-1135P-201ENST00000411083 ACVRL1P37023 503 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-1135P-201ENST00000411083 CHST13Q8NET6 341 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-1135P-201ENST00000411083 DMRTB1Q96MA1 342 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-1135P-201ENST00000411083 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-1135P-201ENST00000411083 ZNF281Q9Y2X9 895 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-1135P-201ENST00000411083 TACC3Q9Y6A5 838 aa3.6□□□□□ -1.83
RNU6-1135P-201ENST00000411083 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1135P-201ENST00000411083 NUDT19A8MXV4 375 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1135P-201ENST00000411083 FZD7O75084 574 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1135P-201ENST00000411083 CELA3AP09093 270 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1135P-201ENST00000411083 RTP1P59025 263 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1135P-201ENST00000411083 LIPIQ6XZB0 460 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1135P-201ENST00000411083 SPRED1Q7Z699 444 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1135P-201ENST00000411083 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1135P-201ENST00000411083 Q8N1X5 172 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1135P-201ENST00000411083 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1135P-201ENST00000411083 MAP6Q96JE9 813 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1135P-201ENST00000411083 SAMD11Q96NU1 681 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1135P-201ENST00000411083 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1135P-201ENST00000411083 PLCD4Q9BRC7 762 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1135P-201ENST00000411083 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1135P-201ENST00000411083 PPM1HQ9ULR3 514 aa3.59□□□□□ -1.83
RNU6-1135P-201ENST00000411083 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
RNU6-1135P-201ENST00000411083 SHISA3A0PJX4 238 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-1135P-201ENST00000411083 GFRA2O00451 464 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-1135P-201ENST00000411083 SLC24A1O60721 1099 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-1135P-201ENST00000411083 LMNB1P20700 586 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-1135P-201ENST00000411083 TGM1P22735 817 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-1135P-201ENST00000411083 PDE4BQ07343 736 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-1135P-201ENST00000411083 RNF111Q6ZNA4 994 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-1135P-201ENST00000411083 USHBP1Q8N6Y0 703 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-1135P-201ENST00000411083 GAL3ST3Q96A11 431 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-1135P-201ENST00000411083 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
RNU6-1135P-201ENST00000411083 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
RNU6-1135P-201ENST00000411083 HHIPL1Q96JK4 782 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-1135P-201ENST00000411083 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa3.58□□□□□ -1.84
RNU6-1135P-201ENST00000411083 TNNI2P48788 182 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-1135P-201ENST00000411083 GJA9P57773 515 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-1135P-201ENST00000411083 LAPTM5Q13571 262 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-1135P-201ENST00000411083 KIR3DS1Q14943 382 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-1135P-201ENST00000411083 VWA3BQ502W6 1294 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-1135P-201ENST00000411083 GALNT18Q6P9A2 607 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-1135P-201ENST00000411083 TTC9BQ8N6N2 239 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-1135P-201ENST00000411083 FNIP1Q8TF40 1166 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-1135P-201ENST00000411083 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
RNU6-1135P-201ENST00000411083 RNF141Q8WVD5 230 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-1135P-201ENST00000411083 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
RNU6-1135P-201ENST00000411083 FOXP3Q9BZS1 431 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-1135P-201ENST00000411083 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa3.57□□□□□ -1.84
RNU6-1135P-201ENST00000411083 IRS2Q9Y4H2 1338 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-1135P-201ENST00000411083 UPK3BL1B0FP48 263 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-1135P-201ENST00000411083 UPK3BL2E5RIL1 263 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-1135P-201ENST00000411083 NOBOXO60393 691 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-1135P-201ENST00000411083 PRKCAP17252 672 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-1135P-201ENST00000411083 FBLN1P23142 703 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-1135P-201ENST00000411083 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
RNU6-1135P-201ENST00000411083 FOXO4P98177 505 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-1135P-201ENST00000411083 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
RNU6-1135P-201ENST00000411083 CYP4F8P98187 520 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-1135P-201ENST00000411083 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
RNU6-1135P-201ENST00000411083 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
RNU6-1135P-201ENST00000411083 CRIP3Q6Q6R5 217 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-1135P-201ENST00000411083 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-1135P-201ENST00000411083 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
RNU6-1135P-201ENST00000411083 LNPKQ9C0E8 428 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-1135P-201ENST00000411083 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-1135P-201ENST00000411083 TAF6LQ9Y6J9 622 aa3.56□□□□□ -1.84
RNU6-1135P-201ENST00000411083 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-1135P-201ENST00000411083 FKTNO75072 461 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-1135P-201ENST00000411083 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-1135P-201ENST00000411083 MSL3P1P0C860 447 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-1135P-201ENST00000411083 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-1135P-201ENST00000411083 SEPT6Q14141 434 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-1135P-201ENST00000411083 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-1135P-201ENST00000411083 TTBK2Q6IQ55 1244 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-1135P-201ENST00000411083 RPTNQ6XPR3 784 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-1135P-201ENST00000411083 SAPCD2Q86UD0 394 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-1135P-201ENST00000411083 FAM13CQ8NE31 585 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-1135P-201ENST00000411083 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
RNU6-1135P-201ENST00000411083 PRDM14Q9GZV8 571 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-1135P-201ENST00000411083 PCED1AQ9H1Q7 454 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-1135P-201ENST00000411083 SERPINA10Q9UK55 444 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-1135P-201ENST00000411083 TCFL5Q9UL49 500 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-1135P-201ENST00000411083 FAN1Q9Y2M0 1017 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-1135P-201ENST00000411083 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa3.55□□□□□ -1.84
RNU6-1135P-201ENST00000411083 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa3.54□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.8 ms