RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409441.5

LIMS1-204, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LIMS1, Length 1,627 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-204ENST00000409441 ME3Q16798 604 aa15.61■□□□□ 0.09
LIMS1-204ENST00000409441 SGMS1Q86VZ5 419 aa15.61■□□□□ 0.09
LIMS1-204ENST00000409441 PNMA1Q8ND90 353 aa15.61■□□□□ 0.09
LIMS1-204ENST00000409441 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
LIMS1-204ENST00000409441 EMILIN3Q9NT22 766 aa15.61■□□□□ 0.09
LIMS1-204ENST00000409441 BRPF3Q9ULD4 1205 aa15.61■□□□□ 0.09
LIMS1-204ENST00000409441 OTOFQ9HC10 1997 aa15.6■□□□□ 0.09
LIMS1-204ENST00000409441 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
LIMS1-204ENST00000409441 SYT1P21579 422 aa15.6■□□□□ 0.09
LIMS1-204ENST00000409441 USP14P54578 494 aa15.6■□□□□ 0.09
LIMS1-204ENST00000409441 HMGCS2P54868 508 aa15.6■□□□□ 0.09
LIMS1-204ENST00000409441 SNAPC2Q13487 334 aa15.6■□□□□ 0.09
LIMS1-204ENST00000409441 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa15.6■□□□□ 0.09
LIMS1-204ENST00000409441 CYP4F22Q6NT55 531 aa15.6■□□□□ 0.09
LIMS1-204ENST00000409441 USP17L2Q6R6M4 530 aa15.6■□□□□ 0.09
LIMS1-204ENST00000409441 CATIPQ7Z7H3 387 aa15.6■□□□□ 0.09
LIMS1-204ENST00000409441 TMEM87AQ8NBN3 555 aa15.6■□□□□ 0.09
LIMS1-204ENST00000409441 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa15.6■□□□□ 0.09
LIMS1-204ENST00000409441 CHMP4CQ96CF2 233 aa15.6■□□□□ 0.09
LIMS1-204ENST00000409441 VCPKMTQ9H867 229 aa15.6■□□□□ 0.09
LIMS1-204ENST00000409441 GOPCQ9HD26 462 aa15.6■□□□□ 0.09
LIMS1-204ENST00000409441 TPCN1Q9ULQ1 816 aa15.6■□□□□ 0.09
LIMS1-204ENST00000409441 MTMR7Q9Y216 660 aa15.6■□□□□ 0.09
LIMS1-204ENST00000409441 SLC12A7Q9Y666 1083 aa15.6■□□□□ 0.09
LIMS1-204ENST00000409441 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
LIMS1-204ENST00000409441 SLC10A3P09131 477 aa15.59■□□□□ 0.09
LIMS1-204ENST00000409441 GJB2P29033 226 aa15.59■□□□□ 0.09
LIMS1-204ENST00000409441 GTF2A2P52657 109 aa15.59■□□□□ 0.09
LIMS1-204ENST00000409441 APOBRQ0VD83 1088 aa15.59■□□□□ 0.09
LIMS1-204ENST00000409441 GRM1Q13255 1194 aa15.59■□□□□ 0.09
LIMS1-204ENST00000409441 DGKZQ13574 1117 aa15.59■□□□□ 0.09
LIMS1-204ENST00000409441 SH3D19Q5HYK7 790 aa15.59■□□□□ 0.09
LIMS1-204ENST00000409441 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
LIMS1-204ENST00000409441 SLFN13Q68D06 897 aa15.59■□□□□ 0.09
LIMS1-204ENST00000409441 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa15.59■□□□□ 0.09
LIMS1-204ENST00000409441 SPICE1Q8N0Z3 855 aa15.59■□□□□ 0.09
LIMS1-204ENST00000409441 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
LIMS1-204ENST00000409441 MS4A4AQ96JQ5 239 aa15.59■□□□□ 0.09
LIMS1-204ENST00000409441 TMOD4Q9NZQ9 345 aa15.59■□□□□ 0.09
LIMS1-204ENST00000409441 ATAD5Q96QE3 1844 aa15.59■□□□□ 0.09
LIMS1-204ENST00000409441 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.09
LIMS1-204ENST00000409441 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa15.58■□□□□ 0.09
LIMS1-204ENST00000409441 NDUFB10O96000 172 aa15.58■□□□□ 0.09
LIMS1-204ENST00000409441 HSPA6P17066 643 aa15.58■□□□□ 0.09
LIMS1-204ENST00000409441 EVCP57679 992 aa15.58■□□□□ 0.09
LIMS1-204ENST00000409441 ST3GAL1Q11201 340 aa15.58■□□□□ 0.09
LIMS1-204ENST00000409441 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.09
LIMS1-204ENST00000409441 ZNF654Q8IZM8 581 aa15.58■□□□□ 0.09
LIMS1-204ENST00000409441 GPT2Q8TD30 523 aa15.58■□□□□ 0.09
LIMS1-204ENST00000409441 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.09
LIMS1-204ENST00000409441 F13A1P00488 732 aa15.57■□□□□ 0.08
LIMS1-204ENST00000409441 CETPP11597 493 aa15.57■□□□□ 0.08
LIMS1-204ENST00000409441 NCLP19338 710 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
LIMS1-204ENST00000409441 PDCP20941 246 aa15.57■□□□□ 0.08
LIMS1-204ENST00000409441 TROAPQ12815 778 aa15.57■□□□□ 0.08
LIMS1-204ENST00000409441 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
LIMS1-204ENST00000409441 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
LIMS1-204ENST00000409441 NUP133Q8WUM0 1156 aa15.57■□□□□ 0.08
LIMS1-204ENST00000409441 LPAR1Q92633 364 aa15.57■□□□□ 0.08
LIMS1-204ENST00000409441 CAPNS2Q96L46 248 aa15.57■□□□□ 0.08
LIMS1-204ENST00000409441 MYL10Q9BUA6 226 aa15.57■□□□□ 0.08
LIMS1-204ENST00000409441 PDHBP11177 359 aa15.57■□□□□ 0.08
LIMS1-204ENST00000409441 SLC1A4P43007 532 aa15.57■□□□□ 0.08
LIMS1-204ENST00000409441 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa15.57■□□□□ 0.08
LIMS1-204ENST00000409441 APOA5Q6Q788 366 aa15.57■□□□□ 0.08
LIMS1-204ENST00000409441 GADL1Q6ZQY3 521 aa15.57■□□□□ 0.08
LIMS1-204ENST00000409441 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa15.57■□□□□ 0.08
LIMS1-204ENST00000409441 GMCL1Q96IK5 515 aa15.57■□□□□ 0.08
LIMS1-204ENST00000409441 C12orf42Q96LP6 360 aa15.57■□□□□ 0.08
LIMS1-204ENST00000409441 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
LIMS1-204ENST00000409441 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa15.56■□□□□ 0.08
LIMS1-204ENST00000409441 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
LIMS1-204ENST00000409441 ZBTB43O43298 467 aa15.56■□□□□ 0.08
LIMS1-204ENST00000409441 CALM1P0DP23 149 aa15.56■□□□□ 0.08
LIMS1-204ENST00000409441 CALM2P0DP24 149 aa15.56■□□□□ 0.08
LIMS1-204ENST00000409441 CALM3P0DP25 149 aa15.56■□□□□ 0.08
LIMS1-204ENST00000409441 SNHG28P0DPA3 235 aa15.56■□□□□ 0.08
LIMS1-204ENST00000409441 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
LIMS1-204ENST00000409441 MOGSQ13724 837 aa15.56■□□□□ 0.08
LIMS1-204ENST00000409441 CCL15Q16663 113 aa15.56■□□□□ 0.08
LIMS1-204ENST00000409441 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa15.56■□□□□ 0.08
LIMS1-204ENST00000409441 GAS2L3Q86XJ1 694 aa15.56■□□□□ 0.08
LIMS1-204ENST00000409441 FANCBQ8NB91 859 aa15.56■□□□□ 0.08
LIMS1-204ENST00000409441 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
LIMS1-204ENST00000409441 DCAF4Q8WV16 495 aa15.56■□□□□ 0.08
LIMS1-204ENST00000409441 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
LIMS1-204ENST00000409441 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
LIMS1-204ENST00000409441 MTMR6Q9Y217 621 aa15.56■□□□□ 0.08
LIMS1-204ENST00000409441 PHIPQ8WWQ0 1821 aa15.55■□□□□ 0.08
LIMS1-204ENST00000409441 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
LIMS1-204ENST00000409441 DDAH1O94760 285 aa15.55■□□□□ 0.08
LIMS1-204ENST00000409441 BMP3P12645 472 aa15.55■□□□□ 0.08
LIMS1-204ENST00000409441 VCAM1P19320 739 aa15.55■□□□□ 0.08
LIMS1-204ENST00000409441 RXRAP19793 462 aa15.55■□□□□ 0.08
LIMS1-204ENST00000409441 INHBEP58166 350 aa15.55■□□□□ 0.08
LIMS1-204ENST00000409441 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
LIMS1-204ENST00000409441 FAM83BQ5T0W9 1011 aa15.55■□□□□ 0.08
LIMS1-204ENST00000409441 RASGRP2Q7LDG7 609 aa15.55■□□□□ 0.08
LIMS1-204ENST00000409441 MICU3Q86XE3 530 aa15.55■□□□□ 0.08
LIMS1-204ENST00000409441 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.8 ms