RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000401498.6

PKDCC-202, Transcript of protein kinase domain containing, cytoplasmic, humanhuman

TSL 5

Gene PKDCC, Length 1,550 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCC-202ENST00000401498 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa35.32■■■■□ 3.25
PKDCC-202ENST00000401498 FLOT1O75955 427 aa35.32■■■■□ 3.24
PKDCC-202ENST00000401498 BMP3P12645 472 aa35.32■■■■□ 3.24
PKDCC-202ENST00000401498 SART3Q15020 963 aaKnown RBP35.32■■■■□ 3.24
PKDCC-202ENST00000401498 PNMA1Q8ND90 353 aa35.32■■■■□ 3.24
PKDCC-202ENST00000401498 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP35.32■■■■□ 3.24
PKDCC-202ENST00000401498 MTA3Q9BTC8 594 aa35.32■■■■□ 3.24
PKDCC-202ENST00000401498 ERICH2A1L162 156 aa35.31■■■■□ 3.24
PKDCC-202ENST00000401498 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP35.31■■■■□ 3.24
PKDCC-202ENST00000401498 BCRP11274 1271 aa35.31■■■■□ 3.24
PKDCC-202ENST00000401498 SLC1A4P43007 532 aa35.31■■■■□ 3.24
PKDCC-202ENST00000401498 TMEM67Q5HYA8 995 aa35.31■■■■□ 3.24
PKDCC-202ENST00000401498 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP35.31■■■■□ 3.24
PKDCC-202ENST00000401498 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP35.31■■■■□ 3.24
PKDCC-202ENST00000401498 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP35.3■■■■□ 3.24
PKDCC-202ENST00000401498 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP35.3■■■■□ 3.24
PKDCC-202ENST00000401498 WTAPQ15007 396 aa35.3■■■■□ 3.24
PKDCC-202ENST00000401498 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP35.3■■■■□ 3.24
PKDCC-202ENST00000401498 HOXC10Q9NYD6 342 aa35.3■■■■□ 3.24
PKDCC-202ENST00000401498 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa35.3■■■■□ 3.24
PKDCC-202ENST00000401498 TMEM87BQ96K49 555 aa35.3■■■■□ 3.24
PKDCC-202ENST00000401498 LRRC2Q9BYS8 371 aa35.3■■■■□ 3.24
PKDCC-202ENST00000401498 PDHBP11177 359 aa35.29■■■■□ 3.24
PKDCC-202ENST00000401498 DSG3P32926 999 aa35.29■■■■□ 3.24
PKDCC-202ENST00000401498 LBX2Q6XYB7 198 aa35.29■■■■□ 3.24
PKDCC-202ENST00000401498 DCAF4Q8WV16 495 aa35.29■■■■□ 3.24
PKDCC-202ENST00000401498 LY9Q9HBG7 655 aa35.29■■■■□ 3.24
PKDCC-202ENST00000401498 RBPJLQ9UBG7 517 aa35.29■■■■□ 3.24
PKDCC-202ENST00000401498 PEX10O60683 326 aa35.28■■■■□ 3.24
PKDCC-202ENST00000401498 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP35.28■■■■□ 3.24
PKDCC-202ENST00000401498 SNHG28P0DPA3 235 aa35.28■■■■□ 3.24
PKDCC-202ENST00000401498 CPA1P15085 419 aa35.28■■■■□ 3.24
PKDCC-202ENST00000401498 SP3Q02447 781 aa35.28■■■■□ 3.24
PKDCC-202ENST00000401498 KCTD1Q719H9 257 aa35.28■■■■□ 3.24
PKDCC-202ENST00000401498 TCEANC2Q96MN5 208 aa35.28■■■■□ 3.24
PKDCC-202ENST00000401498 TXNRD2Q9NNW7 524 aa35.28■■■■□ 3.24
PKDCC-202ENST00000401498 WDR19Q8NEZ3 1342 aa35.27■■■■□ 3.24
PKDCC-202ENST00000401498 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP35.27■■■■□ 3.24
PKDCC-202ENST00000401498 FKTNO75072 461 aa35.27■■■■□ 3.24
PKDCC-202ENST00000401498 MYPNQ86TC9 1320 aa35.26■■■■□ 3.24
PKDCC-202ENST00000401498 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP35.26■■■■□ 3.24
PKDCC-202ENST00000401498 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP35.26■■■■□ 3.24
PKDCC-202ENST00000401498 ATG4CQ96DT6 458 aa35.26■■■■□ 3.24
PKDCC-202ENST00000401498 FEM1BQ9UK73 627 aa35.26■■■■□ 3.24
PKDCC-202ENST00000401498 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa35.26■■■■□ 3.24
PKDCC-202ENST00000401498 TMEM232C9JQI7 657 aa35.25■■■■□ 3.23
PKDCC-202ENST00000401498 PSMA5P28066 241 aa35.25■■■■□ 3.23
PKDCC-202ENST00000401498 FAM110CQ1W6H9 321 aa35.25■■■■□ 3.23
PKDCC-202ENST00000401498 SLF1Q9BQI6 1058 aa35.25■■■■□ 3.23
PKDCC-202ENST00000401498 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa35.25■■■■□ 3.23
PKDCC-202ENST00000401498 A0A0G2JMZ2 1700 aa35.25■■■■□ 3.23
PKDCC-202ENST00000401498 CCDC96Q2M329 555 aa35.25■■■■□ 3.23
PKDCC-202ENST00000401498 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa35.25■■■■□ 3.23
PKDCC-202ENST00000401498 MORF4L1Q9UBU8 362 aa35.25■■■■□ 3.23
PKDCC-202ENST00000401498 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP35.25■■■■□ 3.23
PKDCC-202ENST00000401498 CNMDO75829 334 aa35.24■■■■□ 3.23
PKDCC-202ENST00000401498 CASTP20810 708 aaKnown RBP35.24■■■■□ 3.23
PKDCC-202ENST00000401498 PAGR1Q9BTK6 254 aa35.24■■■■□ 3.23
PKDCC-202ENST00000401498 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP35.23■■■■□ 3.23
PKDCC-202ENST00000401498 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP35.23■■■■□ 3.23
PKDCC-202ENST00000401498 LIFRP42702 1097 aa35.23■■■■□ 3.23
PKDCC-202ENST00000401498 ZNF543Q08ER8 600 aa35.23■■■■□ 3.23
PKDCC-202ENST00000401498 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP35.23■■■■□ 3.23
PKDCC-202ENST00000401498 BTBD7Q9P203 1132 aa35.23■■■■□ 3.23
PKDCC-202ENST00000401498 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa35.23■■■■□ 3.23
PKDCC-202ENST00000401498 PLA2G6O60733 806 aa35.22■■■■□ 3.23
PKDCC-202ENST00000401498 STAT2P52630 851 aa35.22■■■■□ 3.23
PKDCC-202ENST00000401498 ANAPC15P60006 121 aa35.22■■■■□ 3.23
PKDCC-202ENST00000401498 CAP1Q01518 475 aa35.22■■■■□ 3.23
PKDCC-202ENST00000401498 Q3C1V9 767 aa35.22■■■■□ 3.23
PKDCC-202ENST00000401498 TTBK2Q6IQ55 1244 aa35.22■■■■□ 3.23
PKDCC-202ENST00000401498 TM6SF1Q9BZW5 370 aa35.22■■■■□ 3.23
PKDCC-202ENST00000401498 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa35.22■■■■□ 3.23
PKDCC-202ENST00000401498 PRDM10Q9NQV6 1147 aa35.22■■■■□ 3.23
PKDCC-202ENST00000401498 RPS6KB1P23443 525 aa35.21■■■■□ 3.23
PKDCC-202ENST00000401498 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP35.21■■■■□ 3.23
PKDCC-202ENST00000401498 TMTC2Q8N394 836 aa35.21■■■■□ 3.23
PKDCC-202ENST00000401498 GPCPD1Q9NPB8 672 aa35.21■■■■□ 3.23
PKDCC-202ENST00000401498 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa35.21■■■■□ 3.23
PKDCC-202ENST00000401498 VWA5AO00534 786 aa35.21■■■■□ 3.23
PKDCC-202ENST00000401498 TROAPQ12815 778 aa35.21■■■■□ 3.23
PKDCC-202ENST00000401498 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa35.21■■■■□ 3.23
PKDCC-202ENST00000401498 CD99L2Q8TCZ2 262 aa35.21■■■■□ 3.23
PKDCC-202ENST00000401498 CHURC1Q8WUH1 139 aa35.21■■■■□ 3.23
PKDCC-202ENST00000401498 KIFC2Q96AC6 838 aa35.21■■■■□ 3.23
PKDCC-202ENST00000401498 GOLGA8HP0CJ92 632 aa35.2■■■■□ 3.23
PKDCC-202ENST00000401498 ERVK-9P63128 1117 aa35.2■■■■□ 3.23
PKDCC-202ENST00000401498 ERVK-24P63145 666 aa35.2■■■■□ 3.23
PKDCC-202ENST00000401498 RUFY3Q7L099 469 aa35.2■■■■□ 3.23
PKDCC-202ENST00000401498 FAM160B2Q86V87 743 aa35.2■■■■□ 3.23
PKDCC-202ENST00000401498 IL17RAQ96F46 866 aa35.2■■■■□ 3.23
PKDCC-202ENST00000401498 CTGFP29279 349 aa35.19■■■■□ 3.22
PKDCC-202ENST00000401498 IKQ13123 557 aaPredicted RBP35.19■■■■□ 3.22
PKDCC-202ENST00000401498 BTNL9Q6UXG8 535 aa35.19■■■■□ 3.22
PKDCC-202ENST00000401498 SGMS1Q86VZ5 419 aa35.19■■■■□ 3.22
PKDCC-202ENST00000401498 MB21D1Q8N884 522 aa35.19■■■■□ 3.22
PKDCC-202ENST00000401498 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa35.19■■■■□ 3.22
PKDCC-202ENST00000401498 SLC16A2P36021 539 aa35.18■■■■□ 3.22
PKDCC-202ENST00000401498 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP35.18■■■■□ 3.22
PKDCC-202ENST00000401498 NFXL1Q6ZNB6 911 aa35.18■■■■□ 3.22
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