RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393537.4

ANKRD39-201, Transcript of ankyrin repeat domain 39, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD39, Length 976 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39-201ENST00000393537 TTLL1O95922 423 aa24.02■■□□□ 1.44
ANKRD39-201ENST00000393537 NDUFB10O96000 172 aa24.02■■□□□ 1.44
ANKRD39-201ENST00000393537 PTPREP23469 700 aa24.02■■□□□ 1.44
ANKRD39-201ENST00000393537 KLRC3Q07444 240 aa24.02■■□□□ 1.44
ANKRD39-201ENST00000393537 TRIM32Q13049 653 aa24.02■■□□□ 1.44
ANKRD39-201ENST00000393537 PLS1Q14651 629 aa24.02■■□□□ 1.44
ANKRD39-201ENST00000393537 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
ANKRD39-201ENST00000393537 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
ANKRD39-201ENST00000393537 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa24.02■■□□□ 1.44
ANKRD39-201ENST00000393537 SLC15A5A6NIM6 579 aa24.01■■□□□ 1.43
ANKRD39-201ENST00000393537 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
ANKRD39-201ENST00000393537 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
ANKRD39-201ENST00000393537 MAP2K5Q13163 448 aa24.01■■□□□ 1.43
ANKRD39-201ENST00000393537 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
ANKRD39-201ENST00000393537 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
ANKRD39-201ENST00000393537 MKL1Q969V6 931 aa24.01■■□□□ 1.43
ANKRD39-201ENST00000393537 APBA2Q99767 749 aa24.01■■□□□ 1.43
ANKRD39-201ENST00000393537 TACC3Q9Y6A5 838 aa24.01■■□□□ 1.43
ANKRD39-201ENST00000393537 TSPY2A6NKD2 308 aa24■■□□□ 1.43
ANKRD39-201ENST00000393537 HIP1O00291 1037 aa24■■□□□ 1.43
ANKRD39-201ENST00000393537 SHCBP1Q8NEM2 672 aa24■■□□□ 1.43
ANKRD39-201ENST00000393537 DEFB118Q96PH6 123 aa24■■□□□ 1.43
ANKRD39-201ENST00000393537 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
ANKRD39-201ENST00000393537 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa24■■□□□ 1.43
ANKRD39-201ENST00000393537 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa24■■□□□ 1.43
ANKRD39-201ENST00000393537 ZMYM6O95789 1325 aa24■■□□□ 1.43
ANKRD39-201ENST00000393537 SGPL1O95470 568 aa23.99■■□□□ 1.43
ANKRD39-201ENST00000393537 ERCC3P19447 782 aa23.99■■□□□ 1.43
ANKRD39-201ENST00000393537 CCL14Q16627 93 aa23.99■■□□□ 1.43
ANKRD39-201ENST00000393537 TTC22Q5TAA0 569 aa23.99■■□□□ 1.43
ANKRD39-201ENST00000393537 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
ANKRD39-201ENST00000393537 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP23.99■■□□□ 1.43
ANKRD39-201ENST00000393537 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa23.99■■□□□ 1.43
ANKRD39-201ENST00000393537 ORC4O43929 436 aa23.98■■□□□ 1.43
ANKRD39-201ENST00000393537 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
ANKRD39-201ENST00000393537 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
ANKRD39-201ENST00000393537 HAND2P61296 217 aa23.98■■□□□ 1.43
ANKRD39-201ENST00000393537 GRB14Q14449 540 aa23.98■■□□□ 1.43
ANKRD39-201ENST00000393537 TMEM132BQ14DG7 1078 aa23.98■■□□□ 1.43
ANKRD39-201ENST00000393537 SLF1Q9BQI6 1058 aa23.98■■□□□ 1.43
ANKRD39-201ENST00000393537 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
ANKRD39-201ENST00000393537 TOMM22Q9NS69 142 aa23.98■■□□□ 1.43
ANKRD39-201ENST00000393537 RPTORQ8N122 1335 aa23.98■■□□□ 1.43
ANKRD39-201ENST00000393537 VWA5AO00534 786 aa23.97■■□□□ 1.43
ANKRD39-201ENST00000393537 FGRP09769 529 aa23.97■■□□□ 1.43
ANKRD39-201ENST00000393537 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
ANKRD39-201ENST00000393537 NCAPG2Q86XI2 1143 aa23.97■■□□□ 1.43
ANKRD39-201ENST00000393537 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa23.97■■□□□ 1.43
ANKRD39-201ENST00000393537 MROH8Q9H579 483 aa23.97■■□□□ 1.43
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNF236Q9UL36 1845 aa23.97■■□□□ 1.43
ANKRD39-201ENST00000393537 NMT2O60551 498 aa23.96■■□□□ 1.43
ANKRD39-201ENST00000393537 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
ANKRD39-201ENST00000393537 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa23.96■■□□□ 1.43
ANKRD39-201ENST00000393537 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa23.96■■□□□ 1.43
ANKRD39-201ENST00000393537 SLFN13Q68D06 897 aa23.96■■□□□ 1.43
ANKRD39-201ENST00000393537 IL17RBQ9NRM6 502 aa23.96■■□□□ 1.43
ANKRD39-201ENST00000393537 STX8Q9UNK0 236 aa23.96■■□□□ 1.43
ANKRD39-201ENST00000393537 STRNO43815 780 aa23.95■■□□□ 1.42
ANKRD39-201ENST00000393537 TFRCP02786 760 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.42
ANKRD39-201ENST00000393537 HOXC6P09630 235 aa23.95■■□□□ 1.42
ANKRD39-201ENST00000393537 NBPF3Q9H094 633 aa23.95■■□□□ 1.42
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
ANKRD39-201ENST00000393537 LAMA4Q16363 1823 aa23.94■■□□□ 1.42
ANKRD39-201ENST00000393537 BRCA2P51587 3418 aa23.94■■□□□ 1.42
ANKRD39-201ENST00000393537 SLC25A27O95847 323 aa23.94■■□□□ 1.42
ANKRD39-201ENST00000393537 ADORA2AP29274 412 aa23.94■■□□□ 1.42
ANKRD39-201ENST00000393537 STAT3P40763 770 aa23.94■■□□□ 1.42
ANKRD39-201ENST00000393537 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
ANKRD39-201ENST00000393537 DPP9Q86TI2 863 aa23.94■■□□□ 1.42
ANKRD39-201ENST00000393537 RIOX2Q8IUF8 465 aa23.94■■□□□ 1.42
ANKRD39-201ENST00000393537 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
ANKRD39-201ENST00000393537 REPS2Q8NFH8 660 aa23.94■■□□□ 1.42
ANKRD39-201ENST00000393537 NPLOC4Q8TAT6 608 aa23.94■■□□□ 1.42
ANKRD39-201ENST00000393537 FLRT1Q9NZU1 646 aa23.94■■□□□ 1.42
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
ANKRD39-201ENST00000393537 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
ANKRD39-201ENST00000393537 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
ANKRD39-201ENST00000393537 BMP3P12645 472 aa23.93■■□□□ 1.42
ANKRD39-201ENST00000393537 AKNAD1Q5T1N1 836 aa23.93■■□□□ 1.42
ANKRD39-201ENST00000393537 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
ANKRD39-201ENST00000393537 TBC1D10CQ8IV04 446 aa23.93■■□□□ 1.42
ANKRD39-201ENST00000393537 CHMP4CQ96CF2 233 aa23.93■■□□□ 1.42
ANKRD39-201ENST00000393537 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa23.93■■□□□ 1.42
ANKRD39-201ENST00000393537 FEM1BQ9UK73 627 aa23.93■■□□□ 1.42
ANKRD39-201ENST00000393537 MFSD14CQ5VZR4 134 aa23.92■■□□□ 1.42
ANKRD39-201ENST00000393537 MFSD6Q6ZSS7 791 aa23.92■■□□□ 1.42
ANKRD39-201ENST00000393537 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa23.92■■□□□ 1.42
ANKRD39-201ENST00000393537 STAG1Q8WVM7 1258 aa23.92■■□□□ 1.42
ANKRD39-201ENST00000393537 KIFC2Q96AC6 838 aa23.92■■□□□ 1.42
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNF213O14771 459 aa23.91■■□□□ 1.42
ANKRD39-201ENST00000393537 PCP11498 1178 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
ANKRD39-201ENST00000393537 FCER1AP12319 257 aa23.91■■□□□ 1.42
ANKRD39-201ENST00000393537 CAPN2P17655 700 aa23.91■■□□□ 1.42
ANKRD39-201ENST00000393537 SLC1A4P43007 532 aa23.91■■□□□ 1.42
ANKRD39-201ENST00000393537 ABRAQ8N0Z2 381 aa23.91■■□□□ 1.42
ANKRD39-201ENST00000393537 GMCL1Q96IK5 515 aa23.91■■□□□ 1.42
ANKRD39-201ENST00000393537 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
ANKRD39-201ENST00000393537 TMEM232C9JQI7 657 aa23.9■■□□□ 1.42
ANKRD39-201ENST00000393537 COBLO75128 1261 aa23.9■■□□□ 1.42
ANKRD39-201ENST00000393537 ZBED4O75132 1171 aa23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.6 ms