RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380828.6

RABGEF1-202, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Gene RABGEF1, Length 3,864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-202ENST00000380828 PYCARDQ9ULZ3 195 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 ALS2Q96Q42 1657 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 ADGRB1O14514 1584 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 GRXCR2A6NFK2 248 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 TEX28O15482 410 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 NLRP12P59046 1061 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 KLHL40Q2TBA0 621 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 CFAP70Q5T0N1 1121 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 WLSQ5T9L3 541 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 TLDC1Q6P9B6 456 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 ERC1Q8IUD2 1116 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 GCC1Q96CN9 775 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
RABGEF1-202ENST00000380828 CCSER1Q9C0I3 900 aa7.65□□□□□ -1.18
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RABGEF1-202ENST00000380828 ADAM21Q9UKJ8 722 aa7.65□□□□□ -1.18
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RABGEF1-202ENST00000380828 GPR108Q9NPR9 543 aa7.65□□□□□ -1.18
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RABGEF1-202ENST00000380828 GALNT8Q9NY28 637 aa7.65□□□□□ -1.18
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RABGEF1-202ENST00000380828 JAZF1Q86VZ6 243 aa7.65□□□□□ -1.19
RABGEF1-202ENST00000380828 CHAMP1Q96JM3 812 aa7.65□□□□□ -1.19
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RABGEF1-202ENST00000380828 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.19
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RABGEF1-202ENST00000380828 CREB3L3Q68CJ9 461 aa7.64□□□□□ -1.19
RABGEF1-202ENST00000380828 PDXDC2PQ6P474 469 aa7.64□□□□□ -1.19
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RABGEF1-202ENST00000380828 PDE4DQ08499 809 aa7.63□□□□□ -1.19
RABGEF1-202ENST00000380828 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP7.63□□□□□ -1.19
RABGEF1-202ENST00000380828 MUM1Q2TAK8 710 aa7.63□□□□□ -1.19
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RABGEF1-202ENST00000380828 SDE2Q6IQ49 451 aa7.63□□□□□ -1.19
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