RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367364.5

PTPRC-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 1,017 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-202ENST00000367364 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
PTPRC-202ENST00000367364 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
PTPRC-202ENST00000367364 RNF111Q6ZNA4 994 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRC-202ENST00000367364 WAPLQ7Z5K2 1190 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRC-202ENST00000367364 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
PTPRC-202ENST00000367364 LINC01356Q8N9X3 169 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRC-202ENST00000367364 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
PTPRC-202ENST00000367364 VWCEQ96DN2 955 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRC-202ENST00000367364 PLCD4Q9BRC7 762 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRC-202ENST00000367364 HDAC8Q9BY41 377 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRC-202ENST00000367364 TMEM82A0PJX8 343 aa8.24□□□□□ -1.09
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PTPRC-202ENST00000367364 ERVFRD-1P60508 538 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRC-202ENST00000367364 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRC-202ENST00000367364 CEP128Q6ZU80 1094 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRC-202ENST00000367364 FRMD5Q7Z6J6 570 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRC-202ENST00000367364 HHIPL1Q96JK4 782 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRC-202ENST00000367364 FRMD6Q96NE9 622 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRC-202ENST00000367364 ZMYM5Q9UJ78 669 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRC-202ENST00000367364 TLR6Q9Y2C9 796 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRC-202ENST00000367364 CILPO75339 1184 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRC-202ENST00000367364 TNNI2P48788 182 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRC-202ENST00000367364 SLC14A2Q15849 920 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRC-202ENST00000367364 BDH2Q9BUT1 245 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRC-202ENST00000367364 FOXP3Q9BZS1 431 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRC-202ENST00000367364 KLHL14Q9P2G3 628 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRC-202ENST00000367364 PLP2Q04941 152 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRC-202ENST00000367364 KIR3DS1Q14943 382 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRC-202ENST00000367364 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
PTPRC-202ENST00000367364 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRC-202ENST00000367364 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
PTPRC-202ENST00000367364 LDHBP07195 334 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
PTPRC-202ENST00000367364 INSRRP14616 1297 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRC-202ENST00000367364 GNA15P30679 374 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRC-202ENST00000367364 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
PTPRC-202ENST00000367364 LDHDQ86WU2 507 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRC-202ENST00000367364 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
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PTPRC-202ENST00000367364 RTP5Q14D33 572 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRC-202ENST00000367364 OLFML2BQ68BL8 750 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRC-202ENST00000367364 ZPBP2Q6X784 338 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRC-202ENST00000367364 CCDC74BQ96LY2 380 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRC-202ENST00000367364 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRC-202ENST00000367364 PRR36Q9H6K5 1346 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRC-202ENST00000367364 ABLIM1O14639 778 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRC-202ENST00000367364 DNAJA2O60884 412 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRC-202ENST00000367364 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP8.19□□□□□ -1.1
PTPRC-202ENST00000367364 BBS9Q3SYG4 887 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRC-202ENST00000367364 MEI1Q5TIA1 1274 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRC-202ENST00000367364 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
PTPRC-202ENST00000367364 DAGLBQ8NCG7 672 aa8.19□□□□□ -1.1
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PTPRC-202ENST00000367364 RNF19AQ9NV58 838 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRC-202ENST00000367364 REV1Q9UBZ9 1251 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRC-202ENST00000367364 TCFL5Q9UL49 500 aa8.19□□□□□ -1.1
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PTPRC-202ENST00000367364 KLHL3Q9UH77 587 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRC-202ENST00000367364 AK5Q9Y6K8 562 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRC-202ENST00000367364 FFAR3O14843 346 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRC-202ENST00000367364 TMC3Q7Z5M5 1100 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRC-202ENST00000367364 KIF2CQ99661 725 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRC-202ENST00000367364 FKTNO75072 461 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRC-202ENST00000367364 MPOP05164 745 aa8.16□□□□□ -1.1
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PTPRC-202ENST00000367364 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
PTPRC-202ENST00000367364 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
PTPRC-202ENST00000367364 LINC00116Q8NCU8 138 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRC-202ENST00000367364 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
PTPRC-202ENST00000367364 MYRFQ9Y2G1 1151 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRC-202ENST00000367364 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
PTPRC-202ENST00000367364 FADS2P1A8MWK0 482 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRC-202ENST00000367364 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
PTPRC-202ENST00000367364 PDE4CQ08493 712 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRC-202ENST00000367364 PHACTR4Q8IZ21 702 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
PTPRC-202ENST00000367364 SYPP08247 313 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRC-202ENST00000367364 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
PTPRC-202ENST00000367364 SLURP1P55000 103 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRC-202ENST00000367364 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
PTPRC-202ENST00000367364 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa8.14□□□□□ -1.11
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PTPRC-202ENST00000367364 HTR3BO95264 441 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRC-202ENST00000367364 BPNT1O95861 308 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRC-202ENST00000367364 F13A1P00488 732 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRC-202ENST00000367364 RLBP1P12271 317 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRC-202ENST00000367364 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
PTPRC-202ENST00000367364 CAP1Q01518 475 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRC-202ENST00000367364 RAB3GAP1Q15042 981 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRC-202ENST00000367364 GALNT18Q6P9A2 607 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRC-202ENST00000367364 GATAD2BQ8WXI9 593 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRC-202ENST00000367364 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
PTPRC-202ENST00000367364 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRC-202ENST00000367364 NUDT19A8MXV4 375 aa8.12□□□□□ -1.11
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