RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366686.1

CCSAP-202, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CCSAP, Length 4,399 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-202ENST00000366686 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 TRIM52Q96A61 297 aa3.14□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 HERPUD2Q9BSE4 406 aa3.14□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 LAMA4Q16363 1823 aa3.14□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 PAPLNO95428 1278 aa3.14□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 ARAFP10398 606 aa3.14□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 CCDC96Q2M329 555 aa3.14□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 CCDC81Q6ZN84 652 aa3.14□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 Q6ZVU0 165 aa3.14□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 ANKLE2Q86XL3 938 aa3.14□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 TTC16Q8NEE8 873 aa3.14□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 RBSNQ9H1K0 784 aa3.14□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa3.14□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 AKAP2Q9Y2D5 859 aa3.14□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 GPR52Q9Y2T5 361 aa3.14□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 HTTP42858 3142 aa3.14□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa3.13□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 A0A1W2PQU0 124 aa3.13□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 APAF1O14727 1248 aa3.13□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 PLIN1O60240 522 aa3.13□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 MYCP01106 439 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 CELA3AP09093 270 aa3.13□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 HALP42357 657 aa3.13□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 FAAP100Q0VG06 881 aa3.13□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 AAMPQ13685 434 aa3.13□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 SEPT6Q14141 434 aa3.13□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 ALFQ53S48 1182 aa3.13□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 HGSNATQ68CP4 663 aa3.13□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 ST7Q9NRC1 585 aa3.13□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 SLC5A4Q9NY91 659 aa3.13□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 FBXO21O94952 628 aa3.13□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP3.13□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 CCDC174Q6PII3 467 aa3.13□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 GPR152Q8TDT2 470 aa3.13□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 GRIP2Q9C0E4 1043 aa3.13□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 SSC5DA1L4H1 1573 aa3.13□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 PTMSP20962 102 aa3.13□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 MAP7Q14244 749 aa3.13□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP3.13□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 ANKRD23Q86SG2 305 aa3.13□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 LRRTM3Q86VH5 581 aa3.13□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 GOLM1Q8NBJ4 401 aa3.13□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 ANAPC16Q96DE5 110 aa3.13□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 PHACTR1Q9C0D0 580 aa3.13□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 FNIP2Q9P278 1114 aa3.13□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa3.13□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 EYA2O00167 538 aa3.12□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 NEK3P51956 506 aa3.12□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 SAPCD2Q86UD0 394 aa3.12□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 CCNJLQ8IV13 435 aa3.12□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 L3MBTL2Q969R5 705 aa3.12□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 DHRS4Q9BTZ2 278 aa3.12□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 IFT122Q9HBG6 1241 aa3.12□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 LATS2Q9NRM7 1088 aa3.12□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 PDP2Q9P2J9 529 aa3.12□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 PHTF1Q9UMS5 762 aa3.12□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 DGKBQ9Y6T7 804 aa3.12□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 TECPR2O15040 1411 aa3.12□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 F6X3S4 739 aa3.12□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 GFRA2O00451 464 aa3.12□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 TNFRSF10CO14798 259 aa3.12□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 ADH1BP00325 375 aa3.12□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 MYL3P08590 195 aa3.12□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa3.12□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP3.12□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 STAT4Q14765 748 aa3.12□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 MTERF2Q49AM1 385 aa3.12□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 IL31Q6EBC2 164 aa3.12□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 TEX19Q8NA77 164 aa3.12□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 OR10H5Q8NGA6 315 aa3.12□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 FRS2Q8WU20 508 aa3.12□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 SLC10A4Q96EP9 437 aa3.12□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 SUSD3Q96L08 255 aa3.12□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 RETREG1Q9H6L5 497 aa3.12□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 RASSF1Q9NS23 344 aa3.12□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 POLG2Q9UHN1 485 aa3.12□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 C5P01031 1676 aa3.12□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 MINDY4BA8MYZ0 360 aa3.12□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 GRIN3BO60391 1043 aa3.12□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 RHOBTB3O94955 611 aa3.12□□□□□ -1.91
CCSAP-202ENST00000366686 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.5 ms