RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361441.4

APOBEC3C-201, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3C, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene APOBEC3C, Length 2,818 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3C-201ENST00000361441 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP12.06□□□□□ -0.48
APOBEC3C-201ENST00000361441 FAM114A1Q8IWE2 563 aa12.06□□□□□ -0.48
APOBEC3C-201ENST00000361441 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP12.06□□□□□ -0.48
APOBEC3C-201ENST00000361441 SDF4Q9BRK5 362 aa12.06□□□□□ -0.48
APOBEC3C-201ENST00000361441 RXRAP19793 462 aa12.06□□□□□ -0.48
APOBEC3C-201ENST00000361441 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP12.06□□□□□ -0.48
APOBEC3C-201ENST00000361441 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP12.06□□□□□ -0.48
APOBEC3C-201ENST00000361441 DPCR1Q3MIW9 517 aa12.06□□□□□ -0.48
APOBEC3C-201ENST00000361441 CCDC121Q6ZUS5 278 aa12.06□□□□□ -0.48
APOBEC3C-201ENST00000361441 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP12.06□□□□□ -0.48
APOBEC3C-201ENST00000361441 CABLES1Q8TDN4 633 aa12.06□□□□□ -0.48
APOBEC3C-201ENST00000361441 COG1Q8WTW3 980 aa12.06□□□□□ -0.48
APOBEC3C-201ENST00000361441 EBF2Q9HAK2 575 aa12.06□□□□□ -0.48
APOBEC3C-201ENST00000361441 KDM3BQ7LBC6 1761 aa12.06□□□□□ -0.48
APOBEC3C-201ENST00000361441 GOLGA6L10A6NI86 522 aa12.06□□□□□ -0.48
APOBEC3C-201ENST00000361441 DNM1LO00429 736 aa12.06□□□□□ -0.48
APOBEC3C-201ENST00000361441 MAP3K13O43283 966 aa12.06□□□□□ -0.48
APOBEC3C-201ENST00000361441 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa12.06□□□□□ -0.48
APOBEC3C-201ENST00000361441 UNC45AQ9H3U1 944 aa12.06□□□□□ -0.48
APOBEC3C-201ENST00000361441 HMG20BQ9P0W2 317 aa12.06□□□□□ -0.48
APOBEC3C-201ENST00000361441 CLIC4Q9Y696 253 aa12.06□□□□□ -0.48
APOBEC3C-201ENST00000361441 CTAGE15A4D2H0 777 aa12.05□□□□□ -0.48
APOBEC3C-201ENST00000361441 ARHGAP6O43182 974 aa12.05□□□□□ -0.48
APOBEC3C-201ENST00000361441 ATP6V1G2O95670 118 aa12.05□□□□□ -0.48
APOBEC3C-201ENST00000361441 CTAGE8P0CG41 777 aa12.05□□□□□ -0.48
APOBEC3C-201ENST00000361441 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP12.05□□□□□ -0.48
APOBEC3C-201ENST00000361441 NDUFA8P51970 172 aa12.05□□□□□ -0.48
APOBEC3C-201ENST00000361441 SLC7A5Q01650 507 aa12.05□□□□□ -0.48
APOBEC3C-201ENST00000361441 LRRC24Q50LG9 513 aa12.05□□□□□ -0.48
APOBEC3C-201ENST00000361441 NUGGCQ68CJ6 796 aa12.05□□□□□ -0.48
APOBEC3C-201ENST00000361441 CTAGE6Q86UF2 777 aa12.05□□□□□ -0.48
APOBEC3C-201ENST00000361441 CTAGE4Q8IX94 777 aa12.05□□□□□ -0.48
APOBEC3C-201ENST00000361441 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP12.05□□□□□ -0.48
APOBEC3C-201ENST00000361441 CFAP45Q9UL16 551 aa12.05□□□□□ -0.48
APOBEC3C-201ENST00000361441 DENND2AQ9ULE3 1009 aa12.05□□□□□ -0.48
APOBEC3C-201ENST00000361441 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP12.05□□□□□ -0.48
APOBEC3C-201ENST00000361441 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
APOBEC3C-201ENST00000361441 CHRNA2Q15822 529 aa12.05□□□□□ -0.48
APOBEC3C-201ENST00000361441 Q4G0T1 1027 aa12.05□□□□□ -0.48
APOBEC3C-201ENST00000361441 C16orf87Q6PH81 154 aa12.05□□□□□ -0.48
APOBEC3C-201ENST00000361441 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP12.05□□□□□ -0.48
APOBEC3C-201ENST00000361441 SH3GL2Q99962 352 aa12.05□□□□□ -0.48
APOBEC3C-201ENST00000361441 PCDHA7Q9UN72 937 aa12.05□□□□□ -0.48
APOBEC3C-201ENST00000361441 NUB1Q9Y5A7 615 aa12.05□□□□□ -0.48
APOBEC3C-201ENST00000361441 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa12.04□□□□□ -0.48
APOBEC3C-201ENST00000361441 SEC24CP53992 1094 aa12.04□□□□□ -0.48
APOBEC3C-201ENST00000361441 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP12.04□□□□□ -0.48
APOBEC3C-201ENST00000361441 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP12.04□□□□□ -0.48
APOBEC3C-201ENST00000361441 AIFM3Q96NN9 605 aa12.04□□□□□ -0.48
APOBEC3C-201ENST00000361441 HINFPQ9BQA5 517 aa12.04□□□□□ -0.48
APOBEC3C-201ENST00000361441 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP12.04□□□□□ -0.48
APOBEC3C-201ENST00000361441 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP12.04□□□□□ -0.48
APOBEC3C-201ENST00000361441 PCMTD2Q9NV79 361 aa12.04□□□□□ -0.48
APOBEC3C-201ENST00000361441 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP12.04□□□□□ -0.48
APOBEC3C-201ENST00000361441 E7EWF7 191 aa12.04□□□□□ -0.48
APOBEC3C-201ENST00000361441 DIAPH2O60879 1101 aa12.04□□□□□ -0.48
APOBEC3C-201ENST00000361441 ATP1A3P13637 1013 aa12.04□□□□□ -0.48
APOBEC3C-201ENST00000361441 FUT4P22083 530 aa12.04□□□□□ -0.48
APOBEC3C-201ENST00000361441 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP12.04□□□□□ -0.48
APOBEC3C-201ENST00000361441 PPARDQ03181 441 aa12.04□□□□□ -0.48
APOBEC3C-201ENST00000361441 BLMHQ13867 455 aa12.04□□□□□ -0.48
APOBEC3C-201ENST00000361441 SPECC1Q5M775 1068 aa12.04□□□□□ -0.48
APOBEC3C-201ENST00000361441 PI16Q6UXB8 463 aa12.04□□□□□ -0.48
APOBEC3C-201ENST00000361441 BRAPQ7Z569 592 aa12.04□□□□□ -0.48
APOBEC3C-201ENST00000361441 NME8Q8N427 588 aa12.04□□□□□ -0.48
APOBEC3C-201ENST00000361441 PDILTQ8N807 584 aa12.04□□□□□ -0.48
APOBEC3C-201ENST00000361441 TEKT4Q8WW24 435 aa12.04□□□□□ -0.48
APOBEC3C-201ENST00000361441 OCEL1Q9H607 264 aa12.04□□□□□ -0.48
APOBEC3C-201ENST00000361441 TBC1D7Q9P0N9 293 aa12.04□□□□□ -0.48
APOBEC3C-201ENST00000361441 ZFATQ9P243 1243 aa12.04□□□□□ -0.48
APOBEC3C-201ENST00000361441 A0A0U1RQJ8 604 aa12.03□□□□□ -0.48
APOBEC3C-201ENST00000361441 DPPA5A6NC42 116 aa12.03□□□□□ -0.48
APOBEC3C-201ENST00000361441 CREB3O43889 395 aa12.03□□□□□ -0.48
APOBEC3C-201ENST00000361441 MBD4O95243 580 aa12.03□□□□□ -0.48
APOBEC3C-201ENST00000361441 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP12.03□□□□□ -0.48
APOBEC3C-201ENST00000361441 KRT32Q14532 448 aa12.03□□□□□ -0.48
APOBEC3C-201ENST00000361441 USPL1Q5W0Q7 1092 aa12.03□□□□□ -0.48
APOBEC3C-201ENST00000361441 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP12.03□□□□□ -0.48
APOBEC3C-201ENST00000361441 HOOK3Q86VS8 718 aa12.03□□□□□ -0.48
APOBEC3C-201ENST00000361441 ATRIPQ8WXE1 791 aa12.03□□□□□ -0.48
APOBEC3C-201ENST00000361441 ZBTB3Q9H5J0 574 aa12.03□□□□□ -0.48
APOBEC3C-201ENST00000361441 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP12.03□□□□□ -0.48
APOBEC3C-201ENST00000361441 GALNT8Q9NY28 637 aa12.03□□□□□ -0.48
APOBEC3C-201ENST00000361441 C2CD2Q9Y426 696 aa12.03□□□□□ -0.48
APOBEC3C-201ENST00000361441 A6NHS1 94 aa12.03□□□□□ -0.48
APOBEC3C-201ENST00000361441 PFKFB2O60825 505 aa12.03□□□□□ -0.48
APOBEC3C-201ENST00000361441 POLE2P56282 527 aa12.03□□□□□ -0.48
APOBEC3C-201ENST00000361441 IFFO1Q0D2I5 559 aa12.03□□□□□ -0.48
APOBEC3C-201ENST00000361441 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa12.03□□□□□ -0.48
APOBEC3C-201ENST00000361441 ATL3Q6DD88 541 aa12.03□□□□□ -0.48
APOBEC3C-201ENST00000361441 ARHGEF25Q86VW2 580 aa12.03□□□□□ -0.48
APOBEC3C-201ENST00000361441 MIPOL1Q8TD10 442 aa12.03□□□□□ -0.48
APOBEC3C-201ENST00000361441 DPF2Q92785 391 aa12.03□□□□□ -0.48
APOBEC3C-201ENST00000361441 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa12.03□□□□□ -0.48
APOBEC3C-201ENST00000361441 PREBQ9HCU5 417 aa12.03□□□□□ -0.48
APOBEC3C-201ENST00000361441 FANCLQ9NW38 375 aa12.03□□□□□ -0.48
APOBEC3C-201ENST00000361441 PAG1Q9NWQ8 432 aa12.03□□□□□ -0.48
APOBEC3C-201ENST00000361441 MGRN1O60291 552 aa12.02□□□□□ -0.48
APOBEC3C-201ENST00000361441 FDPSP14324 419 aaKnown RBP12.02□□□□□ -0.48
APOBEC3C-201ENST00000361441 ABL2P42684 1182 aa12.02□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.3 ms