RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361125.1

SMURF1-201, Transcript of SMAD specific E3 ubiquitin protein ligase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SMURF1, Length 5,737 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF1-201ENST00000361125 SCG2P13521 617 aa23.37■■□□□ 1.33
SMURF1-201ENST00000361125 NT5C3AQ9H0P0 336 aa23.37■■□□□ 1.33
SMURF1-201ENST00000361125 RRAGAQ7L523 313 aa23.37■■□□□ 1.33
SMURF1-201ENST00000361125 NLRX1Q86UT6 975 aa23.37■■□□□ 1.33
SMURF1-201ENST00000361125 NLRC4Q9NPP4 1024 aa23.37■■□□□ 1.33
SMURF1-201ENST00000361125 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
SMURF1-201ENST00000361125 CIAO1O76071 339 aa23.37■■□□□ 1.33
SMURF1-201ENST00000361125 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
SMURF1-201ENST00000361125 MYO1AQ9UBC5 1043 aa23.37■■□□□ 1.33
SMURF1-201ENST00000361125 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa23.37■■□□□ 1.33
SMURF1-201ENST00000361125 E7EVH7 732 aa23.36■■□□□ 1.33
SMURF1-201ENST00000361125 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
SMURF1-201ENST00000361125 PPM1EQ8WY54 764 aa23.36■■□□□ 1.33
SMURF1-201ENST00000361125 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
SMURF1-201ENST00000361125 MAGEA1P43355 309 aa23.36■■□□□ 1.33
SMURF1-201ENST00000361125 KIAA1468Q9P260 1216 aa23.36■■□□□ 1.33
SMURF1-201ENST00000361125 BTBD18B2RXH4 712 aa23.36■■□□□ 1.33
SMURF1-201ENST00000361125 CYP2J2P51589 502 aa23.36■■□□□ 1.33
SMURF1-201ENST00000361125 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
SMURF1-201ENST00000361125 CCDC6Q16204 474 aa23.36■■□□□ 1.33
SMURF1-201ENST00000361125 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
SMURF1-201ENST00000361125 PRR36Q9H6K5 1346 aa23.36■■□□□ 1.33
SMURF1-201ENST00000361125 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa23.36■■□□□ 1.33
SMURF1-201ENST00000361125 DNM2P50570 870 aa23.36■■□□□ 1.33
SMURF1-201ENST00000361125 CCDC121Q6ZUS5 278 aa23.36■■□□□ 1.33
SMURF1-201ENST00000361125 C10orf67Q8IYJ2 551 aa23.36■■□□□ 1.33
SMURF1-201ENST00000361125 PYCARDQ9ULZ3 195 aa23.36■■□□□ 1.33
SMURF1-201ENST00000361125 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
SMURF1-201ENST00000361125 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
SMURF1-201ENST00000361125 KLHL7Q8IXQ5 586 aa23.35■■□□□ 1.33
SMURF1-201ENST00000361125 TRIM37O94972 964 aa23.35■■□□□ 1.33
SMURF1-201ENST00000361125 ZNF827Q17R98 1081 aa23.35■■□□□ 1.33
SMURF1-201ENST00000361125 AS3MTQ9HBK9 375 aa23.35■■□□□ 1.33
SMURF1-201ENST00000361125 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP23.35■■□□□ 1.33
SMURF1-201ENST00000361125 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
SMURF1-201ENST00000361125 CEP104O60308 925 aa23.35■■□□□ 1.33
SMURF1-201ENST00000361125 DDAH1O94760 285 aa23.35■■□□□ 1.33
SMURF1-201ENST00000361125 HPDP32754 393 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
SMURF1-201ENST00000361125 ICA1Q05084 483 aa23.35■■□□□ 1.33
SMURF1-201ENST00000361125 UBE3CQ15386 1083 aa23.35■■□□□ 1.33
SMURF1-201ENST00000361125 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
SMURF1-201ENST00000361125 FAM204AQ9H8W3 233 aa23.34■■□□□ 1.33
SMURF1-201ENST00000361125 KCNJ18B7U540 433 aa23.34■■□□□ 1.33
SMURF1-201ENST00000361125 KCNJ12Q14500 433 aa23.34■■□□□ 1.33
SMURF1-201ENST00000361125 LRRC8AQ8IWT6 810 aa23.34■■□□□ 1.33
SMURF1-201ENST00000361125 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
SMURF1-201ENST00000361125 DAPK3O43293 454 aa23.34■■□□□ 1.33
SMURF1-201ENST00000361125 MORC3Q14149 939 aa23.34■■□□□ 1.33
SMURF1-201ENST00000361125 GLG1Q92896 1179 aa23.34■■□□□ 1.33
SMURF1-201ENST00000361125 POLR2MP0CAP2 368 aa23.34■■□□□ 1.33
SMURF1-201ENST00000361125 BCRP11274 1271 aa23.34■■□□□ 1.33
SMURF1-201ENST00000361125 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
SMURF1-201ENST00000361125 CUL4AQ13619 759 aa23.34■■□□□ 1.33
SMURF1-201ENST00000361125 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa23.34■■□□□ 1.33
SMURF1-201ENST00000361125 TNNI1P19237 187 aa23.33■■□□□ 1.33
SMURF1-201ENST00000361125 PPARDQ03181 441 aa23.33■■□□□ 1.33
SMURF1-201ENST00000361125 CCDC14Q49A88 953 aa23.33■■□□□ 1.33
SMURF1-201ENST00000361125 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
SMURF1-201ENST00000361125 NEK8Q86SG6 692 aa23.33■■□□□ 1.33
SMURF1-201ENST00000361125 FLAD1Q8NFF5 587 aa23.33■■□□□ 1.33
SMURF1-201ENST00000361125 CSRNP2Q9H175 543 aa23.33■■□□□ 1.33
SMURF1-201ENST00000361125 PCDHA7Q9UN72 937 aa23.33■■□□□ 1.33
SMURF1-201ENST00000361125 CSADQ9Y600 493 aa23.33■■□□□ 1.33
SMURF1-201ENST00000361125 ZNF853P0CG23 659 aa23.33■■□□□ 1.33
SMURF1-201ENST00000361125 FBXO11Q86XK2 927 aa23.33■■□□□ 1.33
SMURF1-201ENST00000361125 PCDHA12Q9UN75 941 aa23.33■■□□□ 1.33
SMURF1-201ENST00000361125 CD19P15391 556 aa23.33■■□□□ 1.33
SMURF1-201ENST00000361125 MAP4K1Q92918 833 aa23.33■■□□□ 1.33
SMURF1-201ENST00000361125 XDHP47989 1333 aa23.33■■□□□ 1.32
SMURF1-201ENST00000361125 OR52Z1P0C646 297 aa23.33■■□□□ 1.32
SMURF1-201ENST00000361125 OTUD6AQ7L8S5 288 aa23.33■■□□□ 1.32
SMURF1-201ENST00000361125 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.32
SMURF1-201ENST00000361125 AFAP1L1Q8TED9 768 aa23.33■■□□□ 1.32
SMURF1-201ENST00000361125 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.32
SMURF1-201ENST00000361125 SHROOM2Q13796 1616 aa23.33■■□□□ 1.32
SMURF1-201ENST00000361125 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa23.33■■□□□ 1.32
SMURF1-201ENST00000361125 PLA2R1Q13018 1463 aa23.32■■□□□ 1.32
SMURF1-201ENST00000361125 TMEM232C9JQI7 657 aa23.32■■□□□ 1.32
SMURF1-201ENST00000361125 TNFAIP1Q13829 316 aa23.32■■□□□ 1.32
SMURF1-201ENST00000361125 PANK4Q9NVE7 773 aa23.32■■□□□ 1.32
SMURF1-201ENST00000361125 NDUFA8P51970 172 aa23.32■■□□□ 1.32
SMURF1-201ENST00000361125 ZNF365Q70YC5 407 aa23.32■■□□□ 1.32
SMURF1-201ENST00000361125 METTL13Q8N6R0 699 aa23.32■■□□□ 1.32
SMURF1-201ENST00000361125 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
SMURF1-201ENST00000361125 DCUN1D2Q6PH85 259 aa23.32■■□□□ 1.32
SMURF1-201ENST00000361125 GADL1Q6ZQY3 521 aa23.32■■□□□ 1.32
SMURF1-201ENST00000361125 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa23.32■■□□□ 1.32
SMURF1-201ENST00000361125 FAM196AQ6ZSG2 479 aa23.32■■□□□ 1.32
SMURF1-201ENST00000361125 PI16Q6UXB8 463 aa23.32■■□□□ 1.32
SMURF1-201ENST00000361125 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa23.32■■□□□ 1.32
SMURF1-201ENST00000361125 WDR17Q8IZU2 1322 aa23.31■■□□□ 1.32
SMURF1-201ENST00000361125 SLFN13Q68D06 897 aa23.31■■□□□ 1.32
SMURF1-201ENST00000361125 MLXIPQ9HAP2 919 aa23.31■■□□□ 1.32
SMURF1-201ENST00000361125 MYOCDQ8IZQ8 938 aa23.31■■□□□ 1.32
SMURF1-201ENST00000361125 PREX2Q70Z35 1606 aa23.31■■□□□ 1.32
SMURF1-201ENST00000361125 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
SMURF1-201ENST00000361125 CLRN2A0PK11 232 aa23.31■■□□□ 1.32
SMURF1-201ENST00000361125 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa23.31■■□□□ 1.32
SMURF1-201ENST00000361125 DEPTORQ8TB45 409 aa23.31■■□□□ 1.32
SMURF1-201ENST00000361125 SMC6Q96SB8 1091 aa23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20 ms