RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356100.6

PTPRT-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 12,480 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-201ENST00000356100 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP6.63□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 REREQ9P2R6 1566 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 STAM2O75886 525 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 CCDC105Q8IYK2 499 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 FAM212AQ96EL1 285 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 BEGAINQ9BUH8 593 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 ABCC12Q96J65 1359 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 MIPOL1Q8TD10 442 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 HOMER3Q9NSC5 361 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 A2ML1A8K2U0 1454 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 CIAO1O76071 339 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 GCNT3O95395 438 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 SRGAP2BP0DMP2 458 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 CCDC38Q502W7 563 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 RIC8AQ9NPQ8 531 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 A0A1W2PQ27 194 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 A0A1W2PQ64 194 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 A0A1W2PQD8 194 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 ZNF174Q15697 407 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 AK8Q96MA6 479 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 SAR1BQ9Y6B6 198 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 KRT10P13645 584 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 STAT1P42224 750 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 AMFRQ9UKV5 643 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 B4E1Z4 1266 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 HHATQ5VTY9 493 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 MICALL1Q8N3F8 863 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 FAM8A1Q9UBU6 413 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 ABCA8O94911 1581 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 RNF40O75150 1001 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 ALCAMQ13740 583 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 LARGE2Q8N3Y3 721 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 RBSNQ9H1K0 784 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 ARAP3Q8WWN8 1544 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 ADCY9O60503 1353 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 ATP2C2O75185 946 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 STMN1P16949 149 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 TMOD1P28289 359 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 C10orf76Q5T2E6 689 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 HOMEZQ8IX15 550 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 HVCN1Q96D96 273 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 RAB20Q9NX57 234 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 CTSWP56202 376 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 SEPT2Q15019 361 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 CHMP2AO43633 222 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 INPP5BP32019 993 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 STX17P56962 302 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 TFDP1Q14186 410 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 MYCT1Q8N699 235 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 BTG4Q9NY30 223 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 RNF123Q5XPI4 1314 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 H7C1D1 291 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 DEPTORQ8TB45 409 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 ADPGKQ9BRR6 497 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 HAUS4Q9H6D7 363 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 KRT9P35527 623 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 LONP1P36776 959 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 PDE6CP51160 858 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 GABPAQ06546 454 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 MAP7D3Q8IWC1 876 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 TSC1Q92574 1164 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 ATP6V0A1Q93050 837 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 WDR17Q8IZU2 1322 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 XPOTO43592 962 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 ARHGAP4P98171 946 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 V9GY48 417 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 USP19O94966 1318 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 KRT40Q6A162 431 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 TRIM50Q86XT4 487 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 PHACTR3Q96KR7 559 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 GPR108Q9NPR9 543 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 KLHL14Q9P2G3 628 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP6.62□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 ACSBG1Q96GR2 724 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 NEURL1BA8MQ27 555 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 LMNB1P20700 586 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 YARSP54577 528 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
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