RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332029.2

SOCS1-201, Transcript of suppressor of cytokine signaling 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SOCS1, Length 1,225 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS1-201ENST00000332029 SEPT4O43236 478 aa25.3■■□□□ 1.64
SOCS1-201ENST00000332029 EEF2P13639 858 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
SOCS1-201ENST00000332029 RRP1P56182 461 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
SOCS1-201ENST00000332029 TMEM132BQ14DG7 1078 aa25.3■■□□□ 1.64
SOCS1-201ENST00000332029 ANO1Q5XXA6 986 aa25.3■■□□□ 1.64
SOCS1-201ENST00000332029 CTR9Q6PD62 1173 aa25.3■■□□□ 1.64
SOCS1-201ENST00000332029 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
SOCS1-201ENST00000332029 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
SOCS1-201ENST00000332029 KANSL2Q9H9L4 492 aa25.3■■□□□ 1.64
SOCS1-201ENST00000332029 FCER1AP12319 257 aa25.29■■□□□ 1.64
SOCS1-201ENST00000332029 RTP1P59025 263 aa25.29■■□□□ 1.64
SOCS1-201ENST00000332029 MAML3Q96JK9 1138 aa25.29■■□□□ 1.64
SOCS1-201ENST00000332029 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
SOCS1-201ENST00000332029 MYH8P13535 1937 aa25.28■■□□□ 1.64
SOCS1-201ENST00000332029 KBTBD13C9JR72 458 aa25.28■■□□□ 1.64
SOCS1-201ENST00000332029 SLC25A27O95847 323 aa25.28■■□□□ 1.64
SOCS1-201ENST00000332029 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa25.28■■□□□ 1.64
SOCS1-201ENST00000332029 GOPCQ9HD26 462 aa25.28■■□□□ 1.64
SOCS1-201ENST00000332029 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
SOCS1-201ENST00000332029 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa25.28■■□□□ 1.64
SOCS1-201ENST00000332029 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa25.28■■□□□ 1.64
SOCS1-201ENST00000332029 FBXO28Q9NVF7 368 aa25.27■■□□□ 1.64
SOCS1-201ENST00000332029 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa25.27■■□□□ 1.64
SOCS1-201ENST00000332029 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
SOCS1-201ENST00000332029 RAD21O60216 631 aa25.26■■□□□ 1.63
SOCS1-201ENST00000332029 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
SOCS1-201ENST00000332029 RIOX2Q8IUF8 465 aa25.26■■□□□ 1.63
SOCS1-201ENST00000332029 APPBP2Q92624 585 aa25.26■■□□□ 1.63
SOCS1-201ENST00000332029 OSBP2Q969R2 916 aa25.26■■□□□ 1.63
SOCS1-201ENST00000332029 MMP19Q99542 508 aa25.26■■□□□ 1.63
SOCS1-201ENST00000332029 VWA5AO00534 786 aa25.25■■□□□ 1.63
SOCS1-201ENST00000332029 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
SOCS1-201ENST00000332029 FAM83BQ5T0W9 1011 aa25.25■■□□□ 1.63
SOCS1-201ENST00000332029 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa25.25■■□□□ 1.63
SOCS1-201ENST00000332029 MTMR10Q9NXD2 777 aa25.25■■□□□ 1.63
SOCS1-201ENST00000332029 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa25.25■■□□□ 1.63
SOCS1-201ENST00000332029 TTC41PQ6P2S7 1318 aa25.25■■□□□ 1.63
SOCS1-201ENST00000332029 GSG1L2A8MUP6 293 aa25.24■■□□□ 1.63
SOCS1-201ENST00000332029 SBK1Q52WX2 424 aa25.24■■□□□ 1.63
SOCS1-201ENST00000332029 GIMAP6Q6P9H5 292 aa25.24■■□□□ 1.63
SOCS1-201ENST00000332029 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP25.24■■□□□ 1.63
SOCS1-201ENST00000332029 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa25.24■■□□□ 1.63
SOCS1-201ENST00000332029 ERC2O15083 957 aa25.23■■□□□ 1.63
SOCS1-201ENST00000332029 PGK2P07205 417 aa25.23■■□□□ 1.63
SOCS1-201ENST00000332029 STAT3P40763 770 aa25.23■■□□□ 1.63
SOCS1-201ENST00000332029 KCTD2Q14681 263 aa25.23■■□□□ 1.63
SOCS1-201ENST00000332029 LRRC41Q15345 812 aa25.23■■□□□ 1.63
SOCS1-201ENST00000332029 FAM47AQ5JRC9 791 aa25.23■■□□□ 1.63
SOCS1-201ENST00000332029 NRBP1Q9UHY1 535 aa25.23■■□□□ 1.63
SOCS1-201ENST00000332029 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
SOCS1-201ENST00000332029 PARP14Q460N5 1801 aa25.22■■□□□ 1.63
SOCS1-201ENST00000332029 COPB2P35606 906 aa25.22■■□□□ 1.63
SOCS1-201ENST00000332029 ADCYAP1R1P41586 468 aa25.22■■□□□ 1.63
SOCS1-201ENST00000332029 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
SOCS1-201ENST00000332029 REPS2Q8NFH8 660 aa25.22■■□□□ 1.63
SOCS1-201ENST00000332029 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
SOCS1-201ENST00000332029 CRBNQ96SW2 442 aa25.22■■□□□ 1.63
SOCS1-201ENST00000332029 A0A0C4DFX4 3053 aa25.21■■□□□ 1.63
SOCS1-201ENST00000332029 DLL1O00548 723 aa25.21■■□□□ 1.63
SOCS1-201ENST00000332029 GPAA1O43292 621 aa25.21■■□□□ 1.63
SOCS1-201ENST00000332029 RASA1P20936 1047 aa25.21■■□□□ 1.63
SOCS1-201ENST00000332029 SNX17Q15036 470 aa25.21■■□□□ 1.63
SOCS1-201ENST00000332029 ZNF792Q3KQV3 632 aa25.21■■□□□ 1.63
SOCS1-201ENST00000332029 TRIM60Q495X7 471 aa25.21■■□□□ 1.63
SOCS1-201ENST00000332029 STK11IPQ8N1F8 1099 aa25.21■■□□□ 1.63
SOCS1-201ENST00000332029 PI4K2BQ8TCG2 481 aa25.21■■□□□ 1.63
SOCS1-201ENST00000332029 MKNK2Q9HBH9 465 aa25.21■■□□□ 1.63
SOCS1-201ENST00000332029 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
SOCS1-201ENST00000332029 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
SOCS1-201ENST00000332029 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.63
SOCS1-201ENST00000332029 MINDY4BA8MYZ0 360 aa25.2■■□□□ 1.62
SOCS1-201ENST00000332029 M0R2C6 588 aa25.2■■□□□ 1.62
SOCS1-201ENST00000332029 GNAT2P19087 354 aa25.2■■□□□ 1.62
SOCS1-201ENST00000332029 FERMT2Q96AC1 680 aa25.2■■□□□ 1.62
SOCS1-201ENST00000332029 TINF2Q9BSI4 451 aa25.2■■□□□ 1.62
SOCS1-201ENST00000332029 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa25.2■■□□□ 1.62
SOCS1-201ENST00000332029 ROBO3Q96MS0 1386 aa25.19■■□□□ 1.62
SOCS1-201ENST00000332029 RARBP10826 455 aa25.19■■□□□ 1.62
SOCS1-201ENST00000332029 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
SOCS1-201ENST00000332029 SLF1Q9BQI6 1058 aa25.19■■□□□ 1.62
SOCS1-201ENST00000332029 NYAP2Q9P242 653 aa25.19■■□□□ 1.62
SOCS1-201ENST00000332029 MX1P20591 662 aa25.18■■□□□ 1.62
SOCS1-201ENST00000332029 C1orf53Q5VUE5 145 aa25.18■■□□□ 1.62
SOCS1-201ENST00000332029 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
SOCS1-201ENST00000332029 PDLIM7Q9NR12 457 aa25.18■■□□□ 1.62
SOCS1-201ENST00000332029 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
SOCS1-201ENST00000332029 POTEB2H3BUK9 544 aa25.17■■□□□ 1.62
SOCS1-201ENST00000332029 NDUFB10O96000 172 aa25.17■■□□□ 1.62
SOCS1-201ENST00000332029 APPP05067 770 aa25.17■■□□□ 1.62
SOCS1-201ENST00000332029 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
SOCS1-201ENST00000332029 TDO2P48775 406 aa25.17■■□□□ 1.62
SOCS1-201ENST00000332029 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
SOCS1-201ENST00000332029 FSD1Q9BTV5 496 aa25.17■■□□□ 1.62
SOCS1-201ENST00000332029 TEX13BQ9BXU2 312 aa25.17■■□□□ 1.62
SOCS1-201ENST00000332029 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
SOCS1-201ENST00000332029 PHF24Q9UPV7 400 aa25.17■■□□□ 1.62
SOCS1-201ENST00000332029 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
SOCS1-201ENST00000332029 LTBP2Q14767 1821 aa25.16■■□□□ 1.62
SOCS1-201ENST00000332029 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
SOCS1-201ENST00000332029 F5H6K3 240 aa25.16■■□□□ 1.62
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