RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331462.5

HOXD1-201, Transcript of homeobox D1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD1, Length 1,975 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1-201ENST00000331462 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa25.51■■□□□ 1.67
HOXD1-201ENST00000331462 TXLNAP40222 546 aa25.51■■□□□ 1.67
HOXD1-201ENST00000331462 IL17AQ16552 155 aa25.51■■□□□ 1.67
HOXD1-201ENST00000331462 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa25.51■■□□□ 1.67
HOXD1-201ENST00000331462 TMTC1Q8IUR5 882 aa25.51■■□□□ 1.67
HOXD1-201ENST00000331462 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
HOXD1-201ENST00000331462 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
HOXD1-201ENST00000331462 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
HOXD1-201ENST00000331462 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
HOXD1-201ENST00000331462 CALML3P27482 149 aa25.51■■□□□ 1.67
HOXD1-201ENST00000331462 LONP1P36776 959 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
HOXD1-201ENST00000331462 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP25.51■■□□□ 1.67
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HOXD1-201ENST00000331462 TUBB4BP68371 445 aa25.51■■□□□ 1.67
HOXD1-201ENST00000331462 PAK1Q13153 545 aa25.51■■□□□ 1.67
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
HOXD1-201ENST00000331462 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa25.51■■□□□ 1.67
HOXD1-201ENST00000331462 PARD6BQ9BYG5 372 aa25.51■■□□□ 1.67
HOXD1-201ENST00000331462 CDC23Q9UJX2 597 aa25.51■■□□□ 1.67
HOXD1-201ENST00000331462 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
HOXD1-201ENST00000331462 ARFGAP3Q9NP61 516 aa25.5■■□□□ 1.67
HOXD1-201ENST00000331462 LZTFL1Q9NQ48 299 aa25.5■■□□□ 1.67
HOXD1-201ENST00000331462 SH3GLB2Q9NR46 395 aa25.5■■□□□ 1.67
HOXD1-201ENST00000331462 MYH13Q9UKX3 1938 aa25.5■■□□□ 1.67
HOXD1-201ENST00000331462 CCDC151A5D8V7 595 aa25.49■■□□□ 1.67
HOXD1-201ENST00000331462 SASH3O75995 380 aa25.49■■□□□ 1.67
HOXD1-201ENST00000331462 MECOMQ03112 1051 aa25.49■■□□□ 1.67
HOXD1-201ENST00000331462 BRD3Q15059 726 aa25.49■■□□□ 1.67
HOXD1-201ENST00000331462 SLC10A5Q5PT55 438 aa25.49■■□□□ 1.67
HOXD1-201ENST00000331462 RRAGBQ5VZM2 374 aa25.49■■□□□ 1.67
HOXD1-201ENST00000331462 CEP112Q8N8E3 955 aa25.49■■□□□ 1.67
HOXD1-201ENST00000331462 C4orf32Q8N8J7 132 aa25.49■■□□□ 1.67
HOXD1-201ENST00000331462 CCDC66A2RUB6 948 aa25.49■■□□□ 1.67
HOXD1-201ENST00000331462 ADAMTS2O95450 1211 aa25.49■■□□□ 1.67
HOXD1-201ENST00000331462 KIF5BP33176 963 aa25.49■■□□□ 1.67
HOXD1-201ENST00000331462 CYP2C19P33261 490 aa25.49■■□□□ 1.67
HOXD1-201ENST00000331462 COPB1P53618 953 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
HOXD1-201ENST00000331462 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
HOXD1-201ENST00000331462 EPC1Q9H2F5 836 aa25.49■■□□□ 1.67
HOXD1-201ENST00000331462 MYO1AQ9UBC5 1043 aa25.49■■□□□ 1.67
HOXD1-201ENST00000331462 CHMP4BP1P59074 171 aa25.48■■□□□ 1.67
HOXD1-201ENST00000331462 SEMA3FQ13275 785 aa25.48■■□□□ 1.67
HOXD1-201ENST00000331462 RCSD1Q6JBY9 416 aa25.48■■□□□ 1.67
HOXD1-201ENST00000331462 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa25.48■■□□□ 1.67
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HOXD1-201ENST00000331462 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
HOXD1-201ENST00000331462 ABHD10Q9NUJ1 306 aa25.48■■□□□ 1.67
HOXD1-201ENST00000331462 TAF1P21675 1872 aa25.47■■□□□ 1.67
HOXD1-201ENST00000331462 N4BP3O15049 544 aa25.47■■□□□ 1.67
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HOXD1-201ENST00000331462 TCP11X2Q5H9J9 407 aa25.47■■□□□ 1.67
HOXD1-201ENST00000331462 ACSBG1Q96GR2 724 aa25.47■■□□□ 1.67
HOXD1-201ENST00000331462 BLZF1Q9H2G9 400 aa25.47■■□□□ 1.67
HOXD1-201ENST00000331462 POTEB2H3BUK9 544 aa25.47■■□□□ 1.67
HOXD1-201ENST00000331462 TOM1O60784 492 aa25.47■■□□□ 1.67
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HOXD1-201ENST00000331462 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
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HOXD1-201ENST00000331462 CYP26C1Q6V0L0 522 aa25.46■■□□□ 1.67
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HOXD1-201ENST00000331462 KCNJ18B7U540 433 aa25.45■■□□□ 1.67
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HOXD1-201ENST00000331462 KCNJ12Q14500 433 aa25.45■■□□□ 1.67
HOXD1-201ENST00000331462 BLIDQ8IZY5 108 aa25.45■■□□□ 1.67
HOXD1-201ENST00000331462 MSANTD4Q8NCY6 345 aa25.45■■□□□ 1.67
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HOXD1-201ENST00000331462 CTAGE9A4FU28 777 aa25.45■■□□□ 1.66
HOXD1-201ENST00000331462 FAM47AQ5JRC9 791 aa25.45■■□□□ 1.66
HOXD1-201ENST00000331462 ATRIPQ8WXE1 791 aa25.45■■□□□ 1.66
HOXD1-201ENST00000331462 RAB21Q9UL25 225 aa25.45■■□□□ 1.66
HOXD1-201ENST00000331462 H7C1D1 291 aa25.44■■□□□ 1.66
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HOXD1-201ENST00000331462 USP5P45974 858 aa25.44■■□□□ 1.66
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF569Q5MCW4 686 aa25.44■■□□□ 1.66
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HOXD1-201ENST00000331462 PCDHA4Q9UN74 947 aa25.44■■□□□ 1.66
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HOXD1-201ENST00000331462 ARHGAP25P42331 645 aa25.44■■□□□ 1.66
HOXD1-201ENST00000331462 KCNB1Q14721 858 aa25.44■■□□□ 1.66
HOXD1-201ENST00000331462 DGKHQ86XP1 1220 aa25.44■■□□□ 1.66
HOXD1-201ENST00000331462 ROBO3Q96MS0 1386 aa25.43■■□□□ 1.66
HOXD1-201ENST00000331462 TSPY2A6NKD2 308 aa25.43■■□□□ 1.66
HOXD1-201ENST00000331462 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
HOXD1-201ENST00000331462 KLRK1P26718 216 aa25.43■■□□□ 1.66
HOXD1-201ENST00000331462 ADSSL1Q8N142 457 aa25.43■■□□□ 1.66
HOXD1-201ENST00000331462 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
HOXD1-201ENST00000331462 DAGLBQ8NCG7 672 aa25.43■■□□□ 1.66
HOXD1-201ENST00000331462 ANKRD2Q9GZV1 360 aa25.43■■□□□ 1.66
HOXD1-201ENST00000331462 DISC1Q9NRI5 854 aa25.43■■□□□ 1.66
HOXD1-201ENST00000331462 TAB2Q9NYJ8 693 aa25.43■■□□□ 1.66
HOXD1-201ENST00000331462 COL24A1Q17RW2 1714 aa25.43■■□□□ 1.66
HOXD1-201ENST00000331462 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa25.43■■□□□ 1.66
HOXD1-201ENST00000331462 FAM205AQ6ZU69 1335 aa25.43■■□□□ 1.66
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