RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326431.3

TMIE-201, Transcript of transmembrane inner ear, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMIE, Length 1,824 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIE-201ENST00000326431 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP27.49■■□□□ 1.99
TMIE-201ENST00000326431 CCDC96Q2M329 555 aa27.49■■□□□ 1.99
TMIE-201ENST00000326431 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP27.49■■□□□ 1.99
TMIE-201ENST00000326431 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa27.49■■□□□ 1.99
TMIE-201ENST00000326431 SLFN13Q68D06 897 aa27.49■■□□□ 1.99
TMIE-201ENST00000326431 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP27.49■■□□□ 1.99
TMIE-201ENST00000326431 RIOX1Q9H6W3 641 aa27.49■■□□□ 1.99
TMIE-201ENST00000326431 DOCK1Q14185 1865 aa27.49■■□□□ 1.99
TMIE-201ENST00000326431 BTBD18B2RXH4 712 aa27.48■■□□□ 1.99
TMIE-201ENST00000326431 RAD21O60216 631 aa27.48■■□□□ 1.99
TMIE-201ENST00000326431 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP27.48■■□□□ 1.99
TMIE-201ENST00000326431 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa27.48■■□□□ 1.99
TMIE-201ENST00000326431 KCTD1Q719H9 257 aa27.48■■□□□ 1.99
TMIE-201ENST00000326431 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP27.48■■□□□ 1.99
TMIE-201ENST00000326431 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP27.48■■□□□ 1.99
TMIE-201ENST00000326431 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP27.48■■□□□ 1.99
TMIE-201ENST00000326431 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP27.48■■□□□ 1.99
TMIE-201ENST00000326431 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP27.48■■□□□ 1.99
TMIE-201ENST00000326431 MYSM1Q5VVJ2 828 aa27.48■■□□□ 1.99
TMIE-201ENST00000326431 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa27.48■■□□□ 1.99
TMIE-201ENST00000326431 DCAF4Q8WV16 495 aa27.48■■□□□ 1.99
TMIE-201ENST00000326431 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP27.48■■□□□ 1.99
TMIE-201ENST00000326431 USP28Q96RU2 1077 aa27.48■■□□□ 1.99
TMIE-201ENST00000326431 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa27.48■■□□□ 1.99
TMIE-201ENST00000326431 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP27.48■■□□□ 1.99
TMIE-201ENST00000326431 F5H6K3 240 aa27.47■■□□□ 1.99
TMIE-201ENST00000326431 ECE1P42892 770 aa27.47■■□□□ 1.99
TMIE-201ENST00000326431 KLRC3Q07444 240 aa27.47■■□□□ 1.99
TMIE-201ENST00000326431 TTBK2Q6IQ55 1244 aa27.47■■□□□ 1.99
TMIE-201ENST00000326431 GPT2Q8TD30 523 aa27.47■■□□□ 1.99
TMIE-201ENST00000326431 ACER1Q8TDN7 264 aa27.47■■□□□ 1.99
TMIE-201ENST00000326431 OXER1Q8TDS5 423 aa27.47■■□□□ 1.99
TMIE-201ENST00000326431 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP27.47■■□□□ 1.99
TMIE-201ENST00000326431 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa27.47■■□□□ 1.99
TMIE-201ENST00000326431 VAT1LQ9HCJ6 419 aa27.47■■□□□ 1.99
TMIE-201ENST00000326431 CFAP45Q9UL16 551 aa27.47■■□□□ 1.99
TMIE-201ENST00000326431 SCN4AP35499 1836 aa27.46■■□□□ 1.99
TMIE-201ENST00000326431 ASNSP08243 561 aa27.46■■□□□ 1.99
TMIE-201ENST00000326431 ATL3Q6DD88 541 aa27.46■■□□□ 1.99
TMIE-201ENST00000326431 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP27.46■■□□□ 1.99
TMIE-201ENST00000326431 SPATA32Q96LK8 384 aa27.46■■□□□ 1.99
TMIE-201ENST00000326431 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP27.46■■□□□ 1.99
TMIE-201ENST00000326431 NDUFB10O96000 172 aa27.46■■□□□ 1.99
TMIE-201ENST00000326431 SLC1A4P43007 532 aa27.46■■□□□ 1.99
TMIE-201ENST00000326431 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP27.46■■□□□ 1.99
TMIE-201ENST00000326431 NPY5RQ15761 445 aa27.46■■□□□ 1.99
TMIE-201ENST00000326431 KLHL40Q2TBA0 621 aa27.46■■□□□ 1.99
TMIE-201ENST00000326431 HOMER1Q86YM7 354 aa27.46■■□□□ 1.99
TMIE-201ENST00000326431 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP27.46■■□□□ 1.99
TMIE-201ENST00000326431 PIGSQ96S52 555 aa27.46■■□□□ 1.99
TMIE-201ENST00000326431 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa27.46■■□□□ 1.99
TMIE-201ENST00000326431 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa27.46■■□□□ 1.99
TMIE-201ENST00000326431 NR5A1Q13285 461 aa27.45■■□□□ 1.98
TMIE-201ENST00000326431 WWC2Q6AWC2 1192 aa27.45■■□□□ 1.98
TMIE-201ENST00000326431 NOSTRINQ8IVI9 506 aa27.45■■□□□ 1.98
TMIE-201ENST00000326431 ELP1O95163 1332 aa27.45■■□□□ 1.98
TMIE-201ENST00000326431 GLTPD2A6NH11 291 aa27.44■■□□□ 1.98
TMIE-201ENST00000326431 DCAF15Q66K64 600 aa27.44■■□□□ 1.98
TMIE-201ENST00000326431 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP27.44■■□□□ 1.98
TMIE-201ENST00000326431 SH3GLB2Q9NR46 395 aa27.44■■□□□ 1.98
TMIE-201ENST00000326431 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP27.44■■□□□ 1.98
TMIE-201ENST00000326431 TMX2Q9Y320 296 aa27.44■■□□□ 1.98
TMIE-201ENST00000326431 SSC5DA1L4H1 1573 aa27.44■■□□□ 1.98
TMIE-201ENST00000326431 KRT2P35908 639 aa27.44■■□□□ 1.98
TMIE-201ENST00000326431 SLC16A2P36021 539 aa27.44■■□□□ 1.98
TMIE-201ENST00000326431 TYW1BQ6NUM6 668 aa27.44■■□□□ 1.98
TMIE-201ENST00000326431 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa27.44■■□□□ 1.98
TMIE-201ENST00000326431 HOOK2Q96ED9 719 aa27.44■■□□□ 1.98
TMIE-201ENST00000326431 GMCL1Q96IK5 515 aa27.44■■□□□ 1.98
TMIE-201ENST00000326431 ZNF341Q9BYN7 854 aa27.44■■□□□ 1.98
TMIE-201ENST00000326431 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP27.44■■□□□ 1.98
TMIE-201ENST00000326431 STXBP3O00186 592 aa27.43■■□□□ 1.98
TMIE-201ENST00000326431 NLRP5P59047 1200 aa27.43■■□□□ 1.98
TMIE-201ENST00000326431 ADGRF4Q8IZF3 695 aa27.43■■□□□ 1.98
TMIE-201ENST00000326431 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP27.43■■□□□ 1.98
TMIE-201ENST00000326431 BARHL2Q9NY43 387 aa27.43■■□□□ 1.98
TMIE-201ENST00000326431 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP27.42■■□□□ 1.98
TMIE-201ENST00000326431 INPP5BP32019 993 aa27.42■■□□□ 1.98
TMIE-201ENST00000326431 UBE2HP62256 183 aa27.42■■□□□ 1.98
TMIE-201ENST00000326431 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP27.42■■□□□ 1.98
TMIE-201ENST00000326431 JMJD4Q9H9V9 463 aa27.42■■□□□ 1.98
TMIE-201ENST00000326431 SOCS7O14512 581 aa27.41■■□□□ 1.98
TMIE-201ENST00000326431 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa27.41■■□□□ 1.98
TMIE-201ENST00000326431 RTEL1Q9NZ71 1219 aa27.41■■□□□ 1.98
TMIE-201ENST00000326431 RCOR1Q9UKL0 485 aa27.41■■□□□ 1.98
TMIE-201ENST00000326431 FZD1Q9UP38 647 aa27.41■■□□□ 1.98
TMIE-201ENST00000326431 CLIC4Q9Y696 253 aa27.41■■□□□ 1.98
TMIE-201ENST00000326431 TPRNQ4KMQ1 711 aa27.41■■□□□ 1.98
TMIE-201ENST00000326431 SPICE1Q8N0Z3 855 aa27.41■■□□□ 1.98
TMIE-201ENST00000326431 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP27.41■■□□□ 1.98
TMIE-201ENST00000326431 ZNF112Q9UJU3 913 aa27.41■■□□□ 1.98
TMIE-201ENST00000326431 MBD3O95983 291 aa27.4■■□□□ 1.98
TMIE-201ENST00000326431 EPHX2P34913 555 aa27.4■■□□□ 1.98
TMIE-201ENST00000326431 BRMS1Q9HCU9 246 aa27.4■■□□□ 1.98
TMIE-201ENST00000326431 GOPCQ9HD26 462 aa27.4■■□□□ 1.98
TMIE-201ENST00000326431 GINM1Q9NU53 330 aa27.4■■□□□ 1.98
TMIE-201ENST00000326431 POLR3EQ9NVU0 708 aa27.4■■□□□ 1.98
TMIE-201ENST00000326431 PHIPQ8WWQ0 1821 aa27.4■■□□□ 1.98
TMIE-201ENST00000326431 WDR90Q96KV7 1748 aa27.39■■□□□ 1.98
TMIE-201ENST00000326431 ADAMTS3O15072 1205 aa27.39■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.2 ms