RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000324444.7

SYNE4-201, Transcript of spectrin repeat containing nuclear envelope family member 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene SYNE4, Length 1,354 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4-201ENST00000324444 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP20.94■□□□□ 0.94
SYNE4-201ENST00000324444 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP20.94■□□□□ 0.94
SYNE4-201ENST00000324444 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP20.94■□□□□ 0.94
SYNE4-201ENST00000324444 CCDC85CA6NKD9 419 aa20.93■□□□□ 0.94
SYNE4-201ENST00000324444 PHF20L1A8MW92 1017 aa20.93■□□□□ 0.94
SYNE4-201ENST00000324444 SYT1P21579 422 aa20.93■□□□□ 0.94
SYNE4-201ENST00000324444 INHBEP58166 350 aa20.93■□□□□ 0.94
SYNE4-201ENST00000324444 MAP3K9P80192 1104 aa20.93■□□□□ 0.94
SYNE4-201ENST00000324444 VGLL4Q14135 290 aa20.93■□□□□ 0.94
SYNE4-201ENST00000324444 MIGA2Q7L4E1 593 aa20.93■□□□□ 0.94
SYNE4-201ENST00000324444 MKL1Q969V6 931 aa20.93■□□□□ 0.94
SYNE4-201ENST00000324444 CTDNEP1O95476 244 aa20.92■□□□□ 0.94
SYNE4-201ENST00000324444 BRD1O95696 1058 aa20.92■□□□□ 0.94
SYNE4-201ENST00000324444 ADD1P35611 737 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
SYNE4-201ENST00000324444 IFNL1Q8IU54 200 aa20.92■□□□□ 0.94
SYNE4-201ENST00000324444 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP20.92■□□□□ 0.94
SYNE4-201ENST00000324444 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
SYNE4-201ENST00000324444 OPTNQ96CV9 577 aa20.92■□□□□ 0.94
SYNE4-201ENST00000324444 GBP4Q96PP9 640 aa20.92■□□□□ 0.94
SYNE4-201ENST00000324444 MYL10Q9BUA6 226 aa20.92■□□□□ 0.94
SYNE4-201ENST00000324444 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
SYNE4-201ENST00000324444 SH2D4AQ9H788 454 aa20.92■□□□□ 0.94
SYNE4-201ENST00000324444 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
SYNE4-201ENST00000324444 ZNF112Q9UJU3 913 aa20.92■□□□□ 0.94
SYNE4-201ENST00000324444 CSADQ9Y600 493 aa20.92■□□□□ 0.94
SYNE4-201ENST00000324444 H3BQV1 296 aa20.91■□□□□ 0.94
SYNE4-201ENST00000324444 GPR25O00155 361 aa20.91■□□□□ 0.94
SYNE4-201ENST00000324444 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP20.91■□□□□ 0.94
SYNE4-201ENST00000324444 ALDH1A1P00352 501 aa20.91■□□□□ 0.94
SYNE4-201ENST00000324444 ASNSP08243 561 aa20.91■□□□□ 0.94
SYNE4-201ENST00000324444 SMARCA1P28370 1054 aa20.91■□□□□ 0.94
SYNE4-201ENST00000324444 CDC27P30260 824 aa20.91■□□□□ 0.94
SYNE4-201ENST00000324444 GRM4Q14833 912 aa20.91■□□□□ 0.94
SYNE4-201ENST00000324444 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa20.91■□□□□ 0.94
SYNE4-201ENST00000324444 ZNF341Q9BYN7 854 aa20.91■□□□□ 0.94
SYNE4-201ENST00000324444 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa20.91■□□□□ 0.94
SYNE4-201ENST00000324444 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa20.91■□□□□ 0.94
SYNE4-201ENST00000324444 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP20.91■□□□□ 0.94
SYNE4-201ENST00000324444 CLIP2Q9UDT6 1046 aa20.91■□□□□ 0.94
SYNE4-201ENST00000324444 MYH4Q9Y623 1939 aa20.91■□□□□ 0.94
SYNE4-201ENST00000324444 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP20.9■□□□□ 0.94
SYNE4-201ENST00000324444 JAK2O60674 1132 aa20.9■□□□□ 0.94
SYNE4-201ENST00000324444 DEXIO95424 95 aa20.9■□□□□ 0.94
SYNE4-201ENST00000324444 XBP1P17861 261 aa20.9■□□□□ 0.94
SYNE4-201ENST00000324444 RXRAP19793 462 aa20.9■□□□□ 0.94
SYNE4-201ENST00000324444 CAP2P40123 477 aa20.9■□□□□ 0.94
SYNE4-201ENST00000324444 JAG1P78504 1218 aa20.9■□□□□ 0.94
SYNE4-201ENST00000324444 ICA1Q05084 483 aa20.9■□□□□ 0.94
SYNE4-201ENST00000324444 NTRK3Q16288 839 aa20.9■□□□□ 0.94
SYNE4-201ENST00000324444 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
SYNE4-201ENST00000324444 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
SYNE4-201ENST00000324444 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa20.9■□□□□ 0.94
SYNE4-201ENST00000324444 DDX11Q96FC9 970 aa20.9■□□□□ 0.94
SYNE4-201ENST00000324444 WRNIP1Q96S55 665 aa20.9■□□□□ 0.94
SYNE4-201ENST00000324444 CFHR5Q9BXR6 569 aa20.9■□□□□ 0.94
SYNE4-201ENST00000324444 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
SYNE4-201ENST00000324444 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
SYNE4-201ENST00000324444 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
SYNE4-201ENST00000324444 GUCY1A2P33402 732 aa20.89■□□□□ 0.93
SYNE4-201ENST00000324444 TRIM29Q14134 588 aa20.89■□□□□ 0.93
SYNE4-201ENST00000324444 ASPRV1Q53RT3 343 aa20.89■□□□□ 0.93
SYNE4-201ENST00000324444 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa20.89■□□□□ 0.93
SYNE4-201ENST00000324444 GDF11O95390 407 aa20.88■□□□□ 0.93
SYNE4-201ENST00000324444 GH2P01242 217 aa20.88■□□□□ 0.93
SYNE4-201ENST00000324444 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
SYNE4-201ENST00000324444 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
SYNE4-201ENST00000324444 TMTC3Q6ZXV5 915 aa20.88■□□□□ 0.93
SYNE4-201ENST00000324444 PHIPQ8WWQ0 1821 aa20.88■□□□□ 0.93
SYNE4-201ENST00000324444 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
SYNE4-201ENST00000324444 PTMSP20962 102 aa20.87■□□□□ 0.93
SYNE4-201ENST00000324444 ATP2B2Q01814 1243 aa20.87■□□□□ 0.93
SYNE4-201ENST00000324444 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
SYNE4-201ENST00000324444 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
SYNE4-201ENST00000324444 OTUD5Q96G74 571 aa20.87■□□□□ 0.93
SYNE4-201ENST00000324444 C8orf76Q96K31 380 aa20.87■□□□□ 0.93
SYNE4-201ENST00000324444 PTPN18Q99952 460 aa20.87■□□□□ 0.93
SYNE4-201ENST00000324444 SLC26A6Q9BXS9 759 aa20.87■□□□□ 0.93
SYNE4-201ENST00000324444 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
SYNE4-201ENST00000324444 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa20.87■□□□□ 0.93
SYNE4-201ENST00000324444 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa20.87■□□□□ 0.93
SYNE4-201ENST00000324444 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
SYNE4-201ENST00000324444 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
SYNE4-201ENST00000324444 GOLGA6L22H0YM25 854 aa20.86■□□□□ 0.93
SYNE4-201ENST00000324444 EEF2P13639 858 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
SYNE4-201ENST00000324444 SEPT2Q15019 361 aa20.86■□□□□ 0.93
SYNE4-201ENST00000324444 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa20.86■□□□□ 0.93
SYNE4-201ENST00000324444 CLEC17AQ6ZS10 378 aa20.86■□□□□ 0.93
SYNE4-201ENST00000324444 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa20.86■□□□□ 0.93
SYNE4-201ENST00000324444 DCAF4Q8WV16 495 aa20.86■□□□□ 0.93
SYNE4-201ENST00000324444 MS4A4AQ96JQ5 239 aa20.86■□□□□ 0.93
SYNE4-201ENST00000324444 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
SYNE4-201ENST00000324444 SPDYE5A6NIY4 337 aa20.85■□□□□ 0.93
SYNE4-201ENST00000324444 FKTNO75072 461 aa20.85■□□□□ 0.93
SYNE4-201ENST00000324444 SNHG28P0DPA3 235 aa20.85■□□□□ 0.93
SYNE4-201ENST00000324444 INPP5BP32019 993 aa20.85■□□□□ 0.93
SYNE4-201ENST00000324444 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
SYNE4-201ENST00000324444 CLEC10AQ8IUN9 316 aa20.85■□□□□ 0.93
SYNE4-201ENST00000324444 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
SYNE4-201ENST00000324444 ALG1Q9BT22 464 aa20.85■□□□□ 0.93
SYNE4-201ENST00000324444 MTMR6Q9Y217 621 aa20.85■□□□□ 0.93
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