RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318988.10

CTDNEP1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-201ENST00000318988 USP14P54578 494 aa31.85■■■□□ 2.69
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CTDNEP1-201ENST00000318988 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP31.85■■■□□ 2.69
CTDNEP1-201ENST00000318988 GPCPD1Q9NPB8 672 aa31.85■■■□□ 2.69
CTDNEP1-201ENST00000318988 UBE2Q2LH0YL09 131 aa31.84■■■□□ 2.69
CTDNEP1-201ENST00000318988 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP31.84■■■□□ 2.69
CTDNEP1-201ENST00000318988 PDCP20941 246 aa31.84■■■□□ 2.69
CTDNEP1-201ENST00000318988 RASGRP2Q7LDG7 609 aa31.84■■■□□ 2.69
CTDNEP1-201ENST00000318988 ELP3Q9H9T3 547 aa31.84■■■□□ 2.69
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CTDNEP1-201ENST00000318988 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP31.83■■■□□ 2.69
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CTDNEP1-201ENST00000318988 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP31.82■■■□□ 2.68
CTDNEP1-201ENST00000318988 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP31.82■■■□□ 2.68
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CTDNEP1-201ENST00000318988 MTMR2Q13614 643 aa31.81■■■□□ 2.68
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CTDNEP1-201ENST00000318988 LPAR1Q92633 364 aa31.81■■■□□ 2.68
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CTDNEP1-201ENST00000318988 DEXIO95424 95 aa31.8■■■□□ 2.68
CTDNEP1-201ENST00000318988 PPATQ06203 517 aa31.8■■■□□ 2.68
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CTDNEP1-201ENST00000318988 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP31.8■■■□□ 2.68
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CTDNEP1-201ENST00000318988 SPZ1Q9BXG8 430 aa31.8■■■□□ 2.68
CTDNEP1-201ENST00000318988 CHMP5Q9NZZ3 219 aa31.8■■■□□ 2.68
CTDNEP1-201ENST00000318988 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa31.8■■■□□ 2.68
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CTDNEP1-201ENST00000318988 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP31.79■■■□□ 2.68
CTDNEP1-201ENST00000318988 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP31.79■■■□□ 2.68
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CTDNEP1-201ENST00000318988 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP31.79■■■□□ 2.68
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CTDNEP1-201ENST00000318988 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa31.79■■■□□ 2.68
CTDNEP1-201ENST00000318988 FDPSP14324 419 aaKnown RBP31.78■■■□□ 2.68
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CTDNEP1-201ENST00000318988 SPDYE5A6NIY4 337 aa31.77■■■□□ 2.68
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CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM83BQ5T0W9 1011 aa31.77■■■□□ 2.68
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CTDNEP1-201ENST00000318988 TMEM232C9JQI7 657 aa31.76■■■□□ 2.68
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CTDNEP1-201ENST00000318988 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP31.76■■■□□ 2.68
CTDNEP1-201ENST00000318988 ALG1Q9BT22 464 aa31.76■■■□□ 2.68
CTDNEP1-201ENST00000318988 VAT1LQ9HCJ6 419 aa31.76■■■□□ 2.68
CTDNEP1-201ENST00000318988 H3BQV1 296 aa31.75■■■□□ 2.67
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CTDNEP1-201ENST00000318988 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP31.75■■■□□ 2.67
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CTDNEP1-201ENST00000318988 EMILIN3Q9NT22 766 aa31.75■■■□□ 2.67
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CTDNEP1-201ENST00000318988 FOSBP53539 338 aa31.74■■■□□ 2.67
CTDNEP1-201ENST00000318988 PPIL2Q13356 520 aa31.74■■■□□ 2.67
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CTDNEP1-201ENST00000318988 C8orf76Q96K31 380 aa31.74■■■□□ 2.67
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CTDNEP1-201ENST00000318988 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa31.73■■■□□ 2.67
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CTDNEP1-201ENST00000318988 TOMM70O94826 608 aa31.73■■■□□ 2.67
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CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM160B2Q86V87 743 aa31.73■■■□□ 2.67
CTDNEP1-201ENST00000318988 ADGRF4Q8IZF3 695 aa31.73■■■□□ 2.67
CTDNEP1-201ENST00000318988 FEM1BQ9UK73 627 aa31.73■■■□□ 2.67
CTDNEP1-201ENST00000318988 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP31.72■■■□□ 2.67
CTDNEP1-201ENST00000318988 HOMER1Q86YM7 354 aa31.72■■■□□ 2.67
CTDNEP1-201ENST00000318988 C12orf42Q96LP6 360 aa31.72■■■□□ 2.67
CTDNEP1-201ENST00000318988 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP31.71■■■□□ 2.67
CTDNEP1-201ENST00000318988 CXCL11O14625 94 aa31.71■■■□□ 2.67
CTDNEP1-201ENST00000318988 VCAM1P19320 739 aa31.71■■■□□ 2.67
CTDNEP1-201ENST00000318988 SYDE2Q5VT97 1194 aa31.71■■■□□ 2.67
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