RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000316939.2

GADD45GIP1-201, Transcript of GADD45G interacting protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GADD45GIP1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SPDYE2Q495Y8 402 aa25.11■■□□□ 1.61
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CIAPIN1Q6FI81 312 aa25.11■■□□□ 1.61
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GALNT17Q6IS24 598 aa25.11■■□□□ 1.61
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CCDC148Q8NFR7 591 aa25.11■■□□□ 1.61
GADD45GIP1-201ENST00000316939 BARHL2Q9NY43 387 aa25.11■■□□□ 1.61
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa25.1■■□□□ 1.61
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DAGLBQ8NCG7 672 aa25.1■■□□□ 1.61
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PIBF1Q8WXW3 757 aa25.1■■□□□ 1.61
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RIOX1Q9H6W3 641 aa25.1■■□□□ 1.61
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
GADD45GIP1-201ENST00000316939 A0A1B0GVL5 298 aa25.1■■□□□ 1.61
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NDUFA8P51970 172 aa25.1■■□□□ 1.61
GADD45GIP1-201ENST00000316939 WWC2Q6AWC2 1192 aa25.1■■□□□ 1.61
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CLEC10AQ8IUN9 316 aa25.1■■□□□ 1.61
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MKL1Q969V6 931 aa25.1■■□□□ 1.61
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KANSL2Q9H9L4 492 aa25.1■■□□□ 1.61
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NYAP2Q9P242 653 aa25.1■■□□□ 1.61
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa25.1■■□□□ 1.61
GADD45GIP1-201ENST00000316939 STXBP3O00186 592 aa25.09■■□□□ 1.61
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLURP2P0DP57 97 aa25.09■■□□□ 1.61
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TRAPPC10P48553 1259 aa25.09■■□□□ 1.61
GADD45GIP1-201ENST00000316939 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FAM151AQ8WW52 585 aa25.09■■□□□ 1.61
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP25.09■■□□□ 1.61
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PCDHA4Q9UN74 947 aa25.09■■□□□ 1.61
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TRIM75PA6NK02 468 aa25.08■■□□□ 1.61
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FAM196BA6NMK8 535 aa25.08■■□□□ 1.61
GADD45GIP1-201ENST00000316939 BMP15O95972 392 aa25.08■■□□□ 1.61
GADD45GIP1-201ENST00000316939 EIF6P56537 245 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TNIP1Q15025 636 aa25.08■■□□□ 1.61
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TMEM179Q6ZVK1 233 aa25.08■■□□□ 1.61
GADD45GIP1-201ENST00000316939 BLIDQ8IZY5 108 aa25.08■■□□□ 1.61
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CSRNP1Q96S65 589 aa25.08■■□□□ 1.61
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HPSEQ9Y251 543 aa25.08■■□□□ 1.61
GADD45GIP1-201ENST00000316939 BCS1LQ9Y276 419 aa25.08■■□□□ 1.61
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CNTNAP1P78357 1384 aa25.08■■□□□ 1.61
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FAM205CA6NFA0 338 aa25.08■■□□□ 1.6
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PTPREP23469 700 aa25.08■■□□□ 1.6
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF543Q08ER8 600 aa25.08■■□□□ 1.6
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RESP18Q5W5W9 173 aa25.08■■□□□ 1.6
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TYW1BQ6NUM6 668 aa25.08■■□□□ 1.6
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CKAP2LQ8IYA6 745 aa25.08■■□□□ 1.6
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.6
GADD45GIP1-201ENST00000316939 hCG_1984214I3L0E3 225 aa25.07■■□□□ 1.6
GADD45GIP1-201ENST00000316939 M0R2N6 131 aa25.07■■□□□ 1.6
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PFKFB1P16118 471 aa25.07■■□□□ 1.6
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TYRO3Q06418 890 aa25.07■■□□□ 1.6
GADD45GIP1-201ENST00000316939 UVSSAQ2YD98 709 aa25.07■■□□□ 1.6
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SHC4Q6S5L8 630 aa25.07■■□□□ 1.6
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RNF214Q8ND24 703 aa25.07■■□□□ 1.6
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CLRN2A0PK11 232 aa25.06■■□□□ 1.6
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa25.06■■□□□ 1.6
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FAM83AQ86UY5 434 aa25.06■■□□□ 1.6
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TCP10L2B9ZVM9 353 aa25.05■■□□□ 1.6
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RPS12P25398 132 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ABCB5Q2M3G0 1257 aa25.05■■□□□ 1.6
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TIGD1Q96MW7 591 aa25.05■■□□□ 1.6
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZMYND12Q9H0C1 365 aa25.05■■□□□ 1.6
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CPVLQ9H3G5 476 aa25.05■■□□□ 1.6
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MRVI1Q9Y6F6 885 aa25.05■■□□□ 1.6
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MYO1BO43795 1136 aa25.04■■□□□ 1.6
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF202O95125 648 aa25.04■■□□□ 1.6
GADD45GIP1-201ENST00000316939 EEF2P13639 858 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CCDC173Q0VFZ6 552 aa25.04■■□□□ 1.6
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PPP1R9BQ96SB3 815 aa25.04■■□□□ 1.6
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TTC38Q5R3I4 469 aa25.03■■□□□ 1.6
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SASS6Q6UVJ0 657 aa25.03■■□□□ 1.6
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CLIC6Q96NY7 704 aa25.03■■□□□ 1.6
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PIGSQ96S52 555 aa25.03■■□□□ 1.6
GADD45GIP1-201ENST00000316939 UBA5Q9GZZ9 404 aa25.03■■□□□ 1.6
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa25.03■■□□□ 1.6
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ESYT2A0FGR8 921 aa25.03■■□□□ 1.6
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ICA1Q05084 483 aa25.03■■□□□ 1.6
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SEPT2Q15019 361 aa25.03■■□□□ 1.6
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa25.03■■□□□ 1.6
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SIAH1Q8IUQ4 282 aa25.03■■□□□ 1.6
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DCAF4Q8WV16 495 aa25.03■■□□□ 1.6
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MYOZ2Q9NPC6 264 aa25.03■■□□□ 1.6
GADD45GIP1-201ENST00000316939 WNT10BO00744 389 aa25.02■■□□□ 1.6
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ADAMTS3O15072 1205 aa25.02■■□□□ 1.6
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CAVIN2O95810 425 aa25.02■■□□□ 1.6
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SYKP43405 635 aa25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.7 ms