RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000313173.5

HOXD8-201, Transcript of homeobox D8, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-201ENST00000313173 USP25Q9UHP3 1055 aa30.74■■■□□ 2.51
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HOXD8-201ENST00000313173 BLIDQ8IZY5 108 aa30.73■■■□□ 2.51
HOXD8-201ENST00000313173 CBX8Q9HC52 389 aa30.73■■■□□ 2.51
HOXD8-201ENST00000313173 BARHL2Q9NY43 387 aa30.73■■■□□ 2.51
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HOXD8-201ENST00000313173 USP17L5A8MUK1 530 aa30.73■■■□□ 2.51
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HOXD8-201ENST00000313173 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP30.67■■■□□ 2.5
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HOXD8-201ENST00000313173 hCG_1984214I3L0E3 225 aa30.64■■■□□ 2.5
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HOXD8-201ENST00000313173 OGFOD1Q8N543 542 aa30.63■■■□□ 2.49
HOXD8-201ENST00000313173 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa30.63■■■□□ 2.49
HOXD8-201ENST00000313173 DLGAP5Q15398 846 aa30.63■■■□□ 2.49
HOXD8-201ENST00000313173 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP30.63■■■□□ 2.49
HOXD8-201ENST00000313173 CEP57L1Q8IYX8 460 aa30.63■■■□□ 2.49
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