RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299687.9

ZNF407-201, Transcript of zinc finger protein 407, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZNF407, Length 7,948 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF407-201ENST00000299687 ESRRGP62508 458 aa13.44□□□□□ -0.26
ZNF407-201ENST00000299687 DLGAP5Q15398 846 aa13.44□□□□□ -0.26
ZNF407-201ENST00000299687 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa13.44□□□□□ -0.26
ZNF407-201ENST00000299687 RASIP1Q5U651 963 aa13.44□□□□□ -0.26
ZNF407-201ENST00000299687 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
ZNF407-201ENST00000299687 ACEP12821 1306 aa13.44□□□□□ -0.26
ZNF407-201ENST00000299687 KIAA1841Q6NSI8 718 aa13.44□□□□□ -0.26
ZNF407-201ENST00000299687 TTLL7Q6ZT98 887 aa13.44□□□□□ -0.26
ZNF407-201ENST00000299687 NRBF2Q96F24 287 aa13.44□□□□□ -0.26
ZNF407-201ENST00000299687 MBIPQ9NS73 344 aa13.44□□□□□ -0.26
ZNF407-201ENST00000299687 RPS6KA1Q15418 735 aa13.44□□□□□ -0.26
ZNF407-201ENST00000299687 ACRBPQ8NEB7 543 aa13.44□□□□□ -0.26
ZNF407-201ENST00000299687 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
ZNF407-201ENST00000299687 PAGR1Q9BTK6 254 aa13.44□□□□□ -0.26
ZNF407-201ENST00000299687 TXKP42681 527 aa13.44□□□□□ -0.26
ZNF407-201ENST00000299687 APOBRQ0VD83 1088 aa13.44□□□□□ -0.26
ZNF407-201ENST00000299687 SLC12A1Q13621 1099 aa13.44□□□□□ -0.26
ZNF407-201ENST00000299687 MCF2L2Q86YR7 1114 aa13.44□□□□□ -0.26
ZNF407-201ENST00000299687 PLCH2O75038 1416 aa13.43□□□□□ -0.26
ZNF407-201ENST00000299687 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
ZNF407-201ENST00000299687 MCTP2Q6DN12 878 aa13.43□□□□□ -0.26
ZNF407-201ENST00000299687 FAM186BQ8IYM0 893 aa13.43□□□□□ -0.26
ZNF407-201ENST00000299687 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
ZNF407-201ENST00000299687 CFAP61Q8NHU2 1237 aa13.43□□□□□ -0.26
ZNF407-201ENST00000299687 SMYD2Q9NRG4 433 aa13.43□□□□□ -0.26
ZNF407-201ENST00000299687 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
ZNF407-201ENST00000299687 RXRAP19793 462 aa13.43□□□□□ -0.26
ZNF407-201ENST00000299687 ARHGEF37A1IGU5 675 aa13.43□□□□□ -0.26
ZNF407-201ENST00000299687 GAS7O60861 476 aa13.43□□□□□ -0.26
ZNF407-201ENST00000299687 CFBP00751 764 aa13.43□□□□□ -0.26
ZNF407-201ENST00000299687 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
ZNF407-201ENST00000299687 NME8Q8N427 588 aa13.43□□□□□ -0.26
ZNF407-201ENST00000299687 CHURC1Q8WUH1 139 aa13.43□□□□□ -0.26
ZNF407-201ENST00000299687 ATP6V1E2Q96A05 226 aa13.43□□□□□ -0.26
ZNF407-201ENST00000299687 TMEM87BQ96K49 555 aa13.43□□□□□ -0.26
ZNF407-201ENST00000299687 TRIM4Q9C037 500 aa13.43□□□□□ -0.26
ZNF407-201ENST00000299687 TLR3O15455 904 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
ZNF407-201ENST00000299687 LIG4P49917 911 aa13.43□□□□□ -0.26
ZNF407-201ENST00000299687 METTL23Q86XA0 190 aa13.43□□□□□ -0.26
ZNF407-201ENST00000299687 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa13.43□□□□□ -0.26
ZNF407-201ENST00000299687 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
ZNF407-201ENST00000299687 HELLSQ9NRZ9 838 aa13.43□□□□□ -0.26
ZNF407-201ENST00000299687 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
ZNF407-201ENST00000299687 RASEFQ8IZ41 740 aa13.43□□□□□ -0.26
ZNF407-201ENST00000299687 NEUROG2Q9H2A3 272 aa13.43□□□□□ -0.26
ZNF407-201ENST00000299687 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa13.43□□□□□ -0.26
ZNF407-201ENST00000299687 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
ZNF407-201ENST00000299687 EFCAB13Q8IY85 973 aa13.43□□□□□ -0.26
ZNF407-201ENST00000299687 GOLGA5Q8TBA6 731 aa13.43□□□□□ -0.26
ZNF407-201ENST00000299687 A6NJR5 290 aa13.42□□□□□ -0.26
ZNF407-201ENST00000299687 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
ZNF407-201ENST00000299687 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa13.42□□□□□ -0.26
ZNF407-201ENST00000299687 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa13.42□□□□□ -0.26
ZNF407-201ENST00000299687 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa13.42□□□□□ -0.26
ZNF407-201ENST00000299687 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa13.42□□□□□ -0.26
ZNF407-201ENST00000299687 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa13.42□□□□□ -0.26
ZNF407-201ENST00000299687 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa13.42□□□□□ -0.26
ZNF407-201ENST00000299687 GSTA4O15217 222 aa13.42□□□□□ -0.26
ZNF407-201ENST00000299687 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
ZNF407-201ENST00000299687 PAK1Q13153 545 aa13.42□□□□□ -0.26
ZNF407-201ENST00000299687 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
ZNF407-201ENST00000299687 SULF1Q8IWU6 871 aa13.42□□□□□ -0.26
ZNF407-201ENST00000299687 KRT82Q9NSB4 513 aa13.42□□□□□ -0.26
ZNF407-201ENST00000299687 MBD4O95243 580 aa13.42□□□□□ -0.26
ZNF407-201ENST00000299687 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
ZNF407-201ENST00000299687 KRT25Q7Z3Z0 450 aa13.42□□□□□ -0.26
ZNF407-201ENST00000299687 GANCQ8TET4 914 aa13.42□□□□□ -0.26
ZNF407-201ENST00000299687 CDKL2Q92772 493 aa13.42□□□□□ -0.26
ZNF407-201ENST00000299687 TBC1D7Q9P0N9 293 aa13.42□□□□□ -0.26
ZNF407-201ENST00000299687 NCAPD3P42695 1498 aa13.42□□□□□ -0.26
ZNF407-201ENST00000299687 SDSP20132 328 aa13.42□□□□□ -0.26
ZNF407-201ENST00000299687 SNX29Q8TEQ0 813 aa13.42□□□□□ -0.26
ZNF407-201ENST00000299687 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa13.42□□□□□ -0.26
ZNF407-201ENST00000299687 NT5C3AQ9H0P0 336 aa13.42□□□□□ -0.26
ZNF407-201ENST00000299687 ABCC5O15440 1437 aa13.42□□□□□ -0.26
ZNF407-201ENST00000299687 FAM102BQ5T8I3 360 aa13.42□□□□□ -0.26
ZNF407-201ENST00000299687 ZBTB33Q86T24 672 aa13.42□□□□□ -0.26
ZNF407-201ENST00000299687 SPATA17Q96L03 361 aa13.42□□□□□ -0.26
ZNF407-201ENST00000299687 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
ZNF407-201ENST00000299687 SLC39A6Q13433 755 aa13.42□□□□□ -0.26
ZNF407-201ENST00000299687 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa13.42□□□□□ -0.26
ZNF407-201ENST00000299687 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa13.42□□□□□ -0.26
ZNF407-201ENST00000299687 TCP10Q12799 353 aa13.41□□□□□ -0.26
ZNF407-201ENST00000299687 IQCDQ96DY2 449 aa13.41□□□□□ -0.26
ZNF407-201ENST00000299687 NCOA1Q15788 1441 aa13.41□□□□□ -0.26
ZNF407-201ENST00000299687 ATP8B3O60423 1300 aa13.41□□□□□ -0.26
ZNF407-201ENST00000299687 ZNF233A6NK53 670 aa13.41□□□□□ -0.26
ZNF407-201ENST00000299687 ANXA1P04083 346 aa13.41□□□□□ -0.26
ZNF407-201ENST00000299687 PPP2R5EQ16537 467 aa13.41□□□□□ -0.26
ZNF407-201ENST00000299687 AMFRQ9UKV5 643 aa13.41□□□□□ -0.26
ZNF407-201ENST00000299687 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP13.41□□□□□ -0.26
ZNF407-201ENST00000299687 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP13.41□□□□□ -0.26
ZNF407-201ENST00000299687 SFMBT2Q5VUG0 894 aa13.41□□□□□ -0.26
ZNF407-201ENST00000299687 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa13.41□□□□□ -0.26
ZNF407-201ENST00000299687 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP13.41□□□□□ -0.26
ZNF407-201ENST00000299687 A0A1B0GVL5 298 aa13.41□□□□□ -0.26
ZNF407-201ENST00000299687 ARHGAP6O43182 974 aa13.41□□□□□ -0.26
ZNF407-201ENST00000299687 MAP2K2P36507 400 aa13.41□□□□□ -0.26
ZNF407-201ENST00000299687 EXOC8Q8IYI6 725 aa13.41□□□□□ -0.26
ZNF407-201ENST00000299687 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.3 ms