RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000294964.5

PKDCC-201, Transcript of protein kinase domain containing, cytoplasmic, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PKDCC, Length 2,502 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCC-201ENST00000294964 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP27.76■■■□□ 2.03
PKDCC-201ENST00000294964 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP27.76■■■□□ 2.03
PKDCC-201ENST00000294964 RBL2Q08999 1139 aa27.76■■■□□ 2.03
PKDCC-201ENST00000294964 RESP18Q5W5W9 173 aa27.76■■■□□ 2.03
PKDCC-201ENST00000294964 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa27.75■■■□□ 2.03
PKDCC-201ENST00000294964 GSG1L2A8MUP6 293 aa27.75■■■□□ 2.03
PKDCC-201ENST00000294964 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP27.75■■■□□ 2.03
PKDCC-201ENST00000294964 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP27.75■■■□□ 2.03
PKDCC-201ENST00000294964 CCDC87Q9NVE4 849 aa27.75■■■□□ 2.03
PKDCC-201ENST00000294964 KCNJ14Q9UNX9 436 aa27.75■■■□□ 2.03
PKDCC-201ENST00000294964 MROH5Q6ZUA9 1318 aa27.75■■■□□ 2.03
PKDCC-201ENST00000294964 ERVV-1B6SEH8 477 aa27.75■■■□□ 2.03
PKDCC-201ENST00000294964 TEX33O43247 280 aa27.75■■■□□ 2.03
PKDCC-201ENST00000294964 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP27.75■■■□□ 2.03
PKDCC-201ENST00000294964 USP8P40818 1118 aa27.75■■■□□ 2.03
PKDCC-201ENST00000294964 MAP3K12Q12852 859 aa27.75■■■□□ 2.03
PKDCC-201ENST00000294964 MAN1B1Q9UKM7 699 aa27.75■■■□□ 2.03
PKDCC-201ENST00000294964 IRAK1P51617 712 aa27.74■■■□□ 2.03
PKDCC-201ENST00000294964 SLC12A7Q9Y666 1083 aa27.74■■■□□ 2.03
PKDCC-201ENST00000294964 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa27.74■■■□□ 2.03
PKDCC-201ENST00000294964 PPP6R2O75170 966 aa27.74■■■□□ 2.03
PKDCC-201ENST00000294964 GGCXP38435 758 aa27.74■■■□□ 2.03
PKDCC-201ENST00000294964 TDO2P48775 406 aa27.74■■■□□ 2.03
PKDCC-201ENST00000294964 ACRBPQ8NEB7 543 aa27.74■■■□□ 2.03
PKDCC-201ENST00000294964 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP27.74■■■□□ 2.03
PKDCC-201ENST00000294964 MED15Q96RN5 788 aa27.74■■■□□ 2.03
PKDCC-201ENST00000294964 EHD4Q9H223 541 aa27.74■■■□□ 2.03
PKDCC-201ENST00000294964 LRRC4BQ9NT99 713 aa27.74■■■□□ 2.03
PKDCC-201ENST00000294964 PTPAQ15257 358 aa27.73■■■□□ 2.03
PKDCC-201ENST00000294964 ZNF827Q17R98 1081 aa27.73■■■□□ 2.03
PKDCC-201ENST00000294964 CCDC148Q8NFR7 591 aa27.73■■■□□ 2.03
PKDCC-201ENST00000294964 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP27.73■■■□□ 2.03
PKDCC-201ENST00000294964 A0A1B0GTH6 734 aa27.73■■■□□ 2.03
PKDCC-201ENST00000294964 STIM1Q13586 685 aa27.73■■■□□ 2.03
PKDCC-201ENST00000294964 SDR42E1Q8WUS8 393 aa27.73■■■□□ 2.03
PKDCC-201ENST00000294964 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa27.73■■■□□ 2.03
PKDCC-201ENST00000294964 RABEP2Q9H5N1 569 aa27.73■■■□□ 2.03
PKDCC-201ENST00000294964 ABCF2Q9UG63 623 aa27.73■■■□□ 2.03
PKDCC-201ENST00000294964 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP27.72■■■□□ 2.03
PKDCC-201ENST00000294964 ADGRA1Q86SQ6 560 aa27.72■■■□□ 2.03
PKDCC-201ENST00000294964 PPFIBP1Q86W92 1011 aa27.72■■■□□ 2.03
PKDCC-201ENST00000294964 JMYQ8N9B5 988 aa27.72■■■□□ 2.03
PKDCC-201ENST00000294964 KCNH3Q9ULD8 1083 aa27.72■■■□□ 2.03
PKDCC-201ENST00000294964 MYO6Q9UM54 1294 aa27.72■■■□□ 2.03
PKDCC-201ENST00000294964 WDR19Q8NEZ3 1342 aa27.72■■■□□ 2.03
PKDCC-201ENST00000294964 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP27.72■■■□□ 2.03
PKDCC-201ENST00000294964 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa27.72■■■□□ 2.03
PKDCC-201ENST00000294964 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP27.72■■■□□ 2.03
PKDCC-201ENST00000294964 AMPD2Q01433 879 aa27.72■■■□□ 2.03
PKDCC-201ENST00000294964 CNPY4Q8N129 248 aa27.72■■■□□ 2.03
PKDCC-201ENST00000294964 FAM76AQ8TAV0 307 aa27.72■■■□□ 2.03
PKDCC-201ENST00000294964 COG1Q8WTW3 980 aa27.72■■■□□ 2.03
PKDCC-201ENST00000294964 LRP2BPQ9P2M1 347 aa27.72■■■□□ 2.03
PKDCC-201ENST00000294964 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP27.72■■■□□ 2.03
PKDCC-201ENST00000294964 BTBD18B2RXH4 712 aa27.71■■■□□ 2.03
PKDCC-201ENST00000294964 INPP5BP32019 993 aa27.71■■■□□ 2.03
PKDCC-201ENST00000294964 NUP133Q8WUM0 1156 aa27.71■■■□□ 2.03
PKDCC-201ENST00000294964 USP14P54578 494 aa27.71■■■□□ 2.03
PKDCC-201ENST00000294964 MFSD6Q6ZSS7 791 aa27.71■■■□□ 2.03
PKDCC-201ENST00000294964 TMEM87BQ96K49 555 aa27.71■■■□□ 2.03
PKDCC-201ENST00000294964 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP27.71■■■□□ 2.03
PKDCC-201ENST00000294964 MINDY4BA8MYZ0 360 aa27.7■■■□□ 2.03
PKDCC-201ENST00000294964 GRIN1Q05586 938 aa27.7■■■□□ 2.03
PKDCC-201ENST00000294964 AKNAD1Q5T1N1 836 aa27.7■■■□□ 2.03
PKDCC-201ENST00000294964 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP27.7■■■□□ 2.03
PKDCC-201ENST00000294964 MAP3K14Q99558 947 aa27.7■■■□□ 2.03
PKDCC-201ENST00000294964 POTEDQ86YR6 584 aa27.7■■■□□ 2.02
PKDCC-201ENST00000294964 AGPSO00116 658 aa27.69■■■□□ 2.02
PKDCC-201ENST00000294964 CDKL5O76039 1030 aa27.69■■■□□ 2.02
PKDCC-201ENST00000294964 GYG1P46976 350 aa27.69■■■□□ 2.02
PKDCC-201ENST00000294964 CHRNDQ07001 517 aa27.69■■■□□ 2.02
PKDCC-201ENST00000294964 TRIM29Q14134 588 aa27.69■■■□□ 2.02
PKDCC-201ENST00000294964 MAP9Q49MG5 647 aa27.69■■■□□ 2.02
PKDCC-201ENST00000294964 BCAS4Q8TDM0 211 aa27.69■■■□□ 2.02
PKDCC-201ENST00000294964 COL4A1P02462 1669 aa27.69■■■□□ 2.02
PKDCC-201ENST00000294964 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa27.69■■■□□ 2.02
PKDCC-201ENST00000294964 MFAP3LO75121 409 aa27.69■■■□□ 2.02
PKDCC-201ENST00000294964 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP27.69■■■□□ 2.02
PKDCC-201ENST00000294964 PROM2Q8N271 834 aa27.69■■■□□ 2.02
PKDCC-201ENST00000294964 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa27.69■■■□□ 2.02
PKDCC-201ENST00000294964 APBA3O96018 575 aa27.68■■■□□ 2.02
PKDCC-201ENST00000294964 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP27.68■■■□□ 2.02
PKDCC-201ENST00000294964 MLKLQ8NB16 471 aa27.68■■■□□ 2.02
PKDCC-201ENST00000294964 CAMTA2O94983 1202 aa27.68■■■□□ 2.02
PKDCC-201ENST00000294964 ARHGAP25P42331 645 aa27.68■■■□□ 2.02
PKDCC-201ENST00000294964 C3orf67Q6ZVT6 689 aa27.68■■■□□ 2.02
PKDCC-201ENST00000294964 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP27.68■■■□□ 2.02
PKDCC-201ENST00000294964 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa27.67■■■□□ 2.02
PKDCC-201ENST00000294964 GOLGA6CA6NDK9 693 aa27.67■■■□□ 2.02
PKDCC-201ENST00000294964 GOLGA6DP0CG33 693 aa27.67■■■□□ 2.02
PKDCC-201ENST00000294964 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP27.67■■■□□ 2.02
PKDCC-201ENST00000294964 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP27.67■■■□□ 2.02
PKDCC-201ENST00000294964 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa27.67■■■□□ 2.02
PKDCC-201ENST00000294964 CASP14P31944 242 aa27.67■■■□□ 2.02
PKDCC-201ENST00000294964 NR5A1Q13285 461 aa27.67■■■□□ 2.02
PKDCC-201ENST00000294964 BICDL1Q6ZP65 573 aa27.67■■■□□ 2.02
PKDCC-201ENST00000294964 SGMS1Q86VZ5 419 aa27.67■■■□□ 2.02
PKDCC-201ENST00000294964 FAM212AQ96EL1 285 aa27.67■■■□□ 2.02
PKDCC-201ENST00000294964 CRACR2AQ9BSW2 395 aa27.67■■■□□ 2.02
PKDCC-201ENST00000294964 MYH8P13535 1937 aa27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.4 ms