RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233336.6

TTL-201, Transcript of tubulin tyrosine ligase, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTL, Length 14,269 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTL-201ENST00000233336 SUCLG2Q96I99 432 aa11.24□□□□□ -0.61
TTL-201ENST00000233336 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
TTL-201ENST00000233336 RILPQ96NA2 401 aa11.23□□□□□ -0.61
TTL-201ENST00000233336 SPTLC3Q9NUV7 552 aa11.23□□□□□ -0.61
TTL-201ENST00000233336 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa11.23□□□□□ -0.61
TTL-201ENST00000233336 SCRN1Q12765 414 aa11.23□□□□□ -0.61
TTL-201ENST00000233336 TMED1Q13445 227 aa11.23□□□□□ -0.61
TTL-201ENST00000233336 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa11.23□□□□□ -0.61
TTL-201ENST00000233336 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
TTL-201ENST00000233336 CARMIL3Q8ND23 1372 aa11.23□□□□□ -0.61
TTL-201ENST00000233336 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
TTL-201ENST00000233336 CCDC13Q8IYE1 715 aa11.23□□□□□ -0.61
TTL-201ENST00000233336 TCP11Q8WWU5 503 aa11.23□□□□□ -0.61
TTL-201ENST00000233336 CLIC6Q96NY7 704 aa11.23□□□□□ -0.61
TTL-201ENST00000233336 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa11.23□□□□□ -0.61
TTL-201ENST00000233336 APBA1Q02410 837 aa11.23□□□□□ -0.61
TTL-201ENST00000233336 ZNF354CQ86Y25 554 aa11.23□□□□□ -0.61
TTL-201ENST00000233336 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
TTL-201ENST00000233336 EXOC5O00471 708 aa11.23□□□□□ -0.61
TTL-201ENST00000233336 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa11.23□□□□□ -0.61
TTL-201ENST00000233336 ABCC10Q5T3U5 1492 aa11.23□□□□□ -0.61
TTL-201ENST00000233336 LDHBP07195 334 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
TTL-201ENST00000233336 BIRC3Q13489 604 aa11.23□□□□□ -0.61
TTL-201ENST00000233336 SPATA1Q5VX52 437 aa11.23□□□□□ -0.61
TTL-201ENST00000233336 QRICH2Q9H0J4 1663 aa11.23□□□□□ -0.61
TTL-201ENST00000233336 ATP5JP18859 108 aa11.23□□□□□ -0.61
TTL-201ENST00000233336 DYMQ7RTS9 669 aa11.23□□□□□ -0.61
TTL-201ENST00000233336 MYO1AQ9UBC5 1043 aa11.23□□□□□ -0.61
TTL-201ENST00000233336 MAGI2Q86UL8 1455 aa11.23□□□□□ -0.61
TTL-201ENST00000233336 ENC1O14682 589 aa11.23□□□□□ -0.61
TTL-201ENST00000233336 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP11.23□□□□□ -0.61
TTL-201ENST00000233336 CASP14P31944 242 aa11.23□□□□□ -0.61
TTL-201ENST00000233336 LRRC43Q8N309 656 aa11.23□□□□□ -0.61
TTL-201ENST00000233336 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
TTL-201ENST00000233336 MYOM2P54296 1465 aa11.23□□□□□ -0.61
TTL-201ENST00000233336 RTEL1Q9NZ71 1219 aa11.23□□□□□ -0.61
TTL-201ENST00000233336 CFAP74Q9C0B2 1584 aa11.23□□□□□ -0.61
TTL-201ENST00000233336 GPCPD1Q9NPB8 672 aa11.23□□□□□ -0.61
TTL-201ENST00000233336 MAGEA9P43362 315 aa11.23□□□□□ -0.61
TTL-201ENST00000233336 MAP3K19Q56UN5 1328 aa11.22□□□□□ -0.61
TTL-201ENST00000233336 FAM170AA1A519 330 aa11.22□□□□□ -0.61
TTL-201ENST00000233336 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
TTL-201ENST00000233336 HAUS3Q68CZ6 603 aa11.22□□□□□ -0.61
TTL-201ENST00000233336 CCDC89Q8N998 374 aa11.22□□□□□ -0.61
TTL-201ENST00000233336 SUN1O94901 812 aa11.22□□□□□ -0.61
TTL-201ENST00000233336 STMN1P16949 149 aa11.22□□□□□ -0.61
TTL-201ENST00000233336 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
TTL-201ENST00000233336 A0A1W2PQ27 194 aa11.22□□□□□ -0.61
TTL-201ENST00000233336 A0A1W2PQ64 194 aa11.22□□□□□ -0.61
TTL-201ENST00000233336 A0A1W2PQD8 194 aa11.22□□□□□ -0.61
TTL-201ENST00000233336 SNX29Q8TEQ0 813 aa11.22□□□□□ -0.61
TTL-201ENST00000233336 BABAM1Q9NWV8 329 aa11.22□□□□□ -0.61
TTL-201ENST00000233336 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP11.22□□□□□ -0.61
TTL-201ENST00000233336 KAT6AQ92794 2004 aa11.22□□□□□ -0.61
TTL-201ENST00000233336 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
TTL-201ENST00000233336 BAG2O95816 211 aa11.22□□□□□ -0.61
TTL-201ENST00000233336 GNA14O95837 355 aa11.22□□□□□ -0.61
TTL-201ENST00000233336 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
TTL-201ENST00000233336 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
TTL-201ENST00000233336 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
TTL-201ENST00000233336 RPN1P04843 607 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
TTL-201ENST00000233336 MCTP2Q6DN12 878 aa11.22□□□□□ -0.61
TTL-201ENST00000233336 DPH5Q9H2P9 285 aa11.22□□□□□ -0.61
TTL-201ENST00000233336 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
TTL-201ENST00000233336 GEN1Q17RS7 908 aa11.22□□□□□ -0.61
TTL-201ENST00000233336 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
TTL-201ENST00000233336 GCNT3O95395 438 aa11.22□□□□□ -0.61
TTL-201ENST00000233336 HOXB7P09629 217 aa11.22□□□□□ -0.61
TTL-201ENST00000233336 KIFC2Q96AC6 838 aa11.22□□□□□ -0.61
TTL-201ENST00000233336 VPS37BQ9H9H4 285 aa11.22□□□□□ -0.61
TTL-201ENST00000233336 BCRP11274 1271 aa11.22□□□□□ -0.61
TTL-201ENST00000233336 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
TTL-201ENST00000233336 CHMP2AO43633 222 aa11.22□□□□□ -0.61
TTL-201ENST00000233336 IRX4P78413 519 aa11.22□□□□□ -0.61
TTL-201ENST00000233336 ATP7AQ04656 1500 aa11.22□□□□□ -0.61
TTL-201ENST00000233336 MYO10Q9HD67 2058 aa11.22□□□□□ -0.61
TTL-201ENST00000233336 THAP12O43422 761 aa11.21□□□□□ -0.61
TTL-201ENST00000233336 COPB1P53618 953 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
TTL-201ENST00000233336 SETDB2Q96T68 719 aa11.21□□□□□ -0.61
TTL-201ENST00000233336 PRDM1O75626 825 aa11.21□□□□□ -0.61
TTL-201ENST00000233336 KRT12Q99456 494 aa11.21□□□□□ -0.61
TTL-201ENST00000233336 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
TTL-201ENST00000233336 PTPN21Q16825 1174 aa11.21□□□□□ -0.61
TTL-201ENST00000233336 USTQ9Y2C2 406 aa11.21□□□□□ -0.61
TTL-201ENST00000233336 ABCB4P21439 1286 aa11.21□□□□□ -0.61
TTL-201ENST00000233336 CRCPO75575 148 aa11.21□□□□□ -0.61
TTL-201ENST00000233336 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
TTL-201ENST00000233336 CABP7Q86V35 215 aa11.21□□□□□ -0.61
TTL-201ENST00000233336 ARHGAP42A6NI28 874 aa11.21□□□□□ -0.62
TTL-201ENST00000233336 H7C1D1 291 aa11.21□□□□□ -0.62
TTL-201ENST00000233336 PPFIA2O75334 1257 aa11.21□□□□□ -0.62
TTL-201ENST00000233336 TRPC3Q13507 836 aa11.21□□□□□ -0.62
TTL-201ENST00000233336 KSR1Q8IVT5 923 aa11.21□□□□□ -0.62
TTL-201ENST00000233336 SOWAHDA6NJG2 315 aa11.21□□□□□ -0.62
TTL-201ENST00000233336 ADCK5Q3MIX3 580 aa11.21□□□□□ -0.62
TTL-201ENST00000233336 SSH3Q8TE77 659 aa11.21□□□□□ -0.62
TTL-201ENST00000233336 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa11.21□□□□□ -0.62
TTL-201ENST00000233336 EPHB4P54760 987 aa11.21□□□□□ -0.62
TTL-201ENST00000233336 LRWD1Q9UFC0 647 aa11.21□□□□□ -0.62
TTL-201ENST00000233336 ZNF532Q9HCE3 1301 aa11.21□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 122.5 ms