RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000221957.8

PLIN3-201, Transcript of perilipin 3, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PLIN3, Length 2,333 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN3-201ENST00000221957 CNGA4Q8IV77 575 aa14.98□□□□□ -0.01
PLIN3-201ENST00000221957 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
PLIN3-201ENST00000221957 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
PLIN3-201ENST00000221957 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
PLIN3-201ENST00000221957 LRRC10BA6NIK2 292 aa14.97□□□□□ -0.01
PLIN3-201ENST00000221957 H3BQF6 201 aa14.97□□□□□ -0.01
PLIN3-201ENST00000221957 ADAMTS3O15072 1205 aa14.97□□□□□ -0.01
PLIN3-201ENST00000221957 IL17AQ16552 155 aa14.97□□□□□ -0.01
PLIN3-201ENST00000221957 CCDC152Q4G0S7 254 aa14.97□□□□□ -0.01
PLIN3-201ENST00000221957 PDXDC2PQ6P474 469 aa14.97□□□□□ -0.01
PLIN3-201ENST00000221957 SLC35F6Q8N357 371 aa14.97□□□□□ -0.01
PLIN3-201ENST00000221957 CCDC51Q96ER9 411 aa14.97□□□□□ -0.01
PLIN3-201ENST00000221957 PNKPQ96T60 521 aa14.97□□□□□ -0.01
PLIN3-201ENST00000221957 CAMTA2O94983 1202 aa14.97□□□□□ -0.01
PLIN3-201ENST00000221957 GYS2P54840 703 aa14.97□□□□□ -0.01
PLIN3-201ENST00000221957 EVX2Q03828 476 aa14.97□□□□□ -0.01
PLIN3-201ENST00000221957 TMTC3Q6ZXV5 915 aa14.97□□□□□ -0.01
PLIN3-201ENST00000221957 CEP112Q8N8E3 955 aa14.97□□□□□ -0.01
PLIN3-201ENST00000221957 VPS16Q9H269 839 aa14.97□□□□□ -0.01
PLIN3-201ENST00000221957 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
PLIN3-201ENST00000221957 ZNF804BA4D1E1 1349 aa14.96□□□□□ -0.01
PLIN3-201ENST00000221957 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa14.96□□□□□ -0.01
PLIN3-201ENST00000221957 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa14.96□□□□□ -0.01
PLIN3-201ENST00000221957 ZBTB22O15209 634 aa14.96□□□□□ -0.01
PLIN3-201ENST00000221957 GYG1P46976 350 aa14.96□□□□□ -0.01
PLIN3-201ENST00000221957 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa14.96□□□□□ -0.01
PLIN3-201ENST00000221957 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
PLIN3-201ENST00000221957 RRAGBQ5VZM2 374 aa14.96□□□□□ -0.01
PLIN3-201ENST00000221957 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
PLIN3-201ENST00000221957 MSANTD4Q8NCY6 345 aa14.96□□□□□ -0.01
PLIN3-201ENST00000221957 ZNF384Q8TF68 577 aa14.96□□□□□ -0.01
PLIN3-201ENST00000221957 ABHD10Q9NUJ1 306 aa14.96□□□□□ -0.01
PLIN3-201ENST00000221957 RAB21Q9UL25 225 aa14.96□□□□□ -0.01
PLIN3-201ENST00000221957 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
PLIN3-201ENST00000221957 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP14.96□□□□□ -0.01
PLIN3-201ENST00000221957 CTAGE9A4FU28 777 aa14.95□□□□□ -0.02
PLIN3-201ENST00000221957 N4BP3O15049 544 aa14.95□□□□□ -0.02
PLIN3-201ENST00000221957 FGRP09769 529 aa14.95□□□□□ -0.02
PLIN3-201ENST00000221957 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
PLIN3-201ENST00000221957 ARHGAP25P42331 645 aa14.95□□□□□ -0.02
PLIN3-201ENST00000221957 BICDL1Q6ZP65 573 aa14.95□□□□□ -0.02
PLIN3-201ENST00000221957 C3orf67Q6ZVT6 689 aa14.95□□□□□ -0.02
PLIN3-201ENST00000221957 TMTC1Q8IUR5 882 aa14.95□□□□□ -0.02
PLIN3-201ENST00000221957 CCDC24Q8N4L8 307 aa14.95□□□□□ -0.02
PLIN3-201ENST00000221957 IQUBQ8NA54 791 aa14.95□□□□□ -0.02
PLIN3-201ENST00000221957 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
PLIN3-201ENST00000221957 BRMS1Q9HCU9 246 aa14.95□□□□□ -0.02
PLIN3-201ENST00000221957 NTSR2O95665 410 aa14.95□□□□□ -0.02
PLIN3-201ENST00000221957 USP5P45974 858 aa14.95□□□□□ -0.02
PLIN3-201ENST00000221957 COPB1P53618 953 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
PLIN3-201ENST00000221957 LINC00116Q8NCU8 138 aa14.95□□□□□ -0.02
PLIN3-201ENST00000221957 TAB2Q9NYJ8 693 aa14.95□□□□□ -0.02
PLIN3-201ENST00000221957 RWDD2AQ9UIY3 292 aa14.95□□□□□ -0.02
PLIN3-201ENST00000221957 NMT2O60551 498 aa14.94□□□□□ -0.02
PLIN3-201ENST00000221957 CTR9Q6PD62 1173 aa14.94□□□□□ -0.02
PLIN3-201ENST00000221957 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa14.94□□□□□ -0.02
PLIN3-201ENST00000221957 IQCA1Q86XH1 822 aa14.94□□□□□ -0.02
PLIN3-201ENST00000221957 BRIP1Q9BX63 1249 aa14.94□□□□□ -0.02
PLIN3-201ENST00000221957 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
PLIN3-201ENST00000221957 DDAH1O94760 285 aa14.94□□□□□ -0.02
PLIN3-201ENST00000221957 CALM1P0DP23 149 aa14.94□□□□□ -0.02
PLIN3-201ENST00000221957 CALM2P0DP24 149 aa14.94□□□□□ -0.02
PLIN3-201ENST00000221957 CALM3P0DP25 149 aa14.94□□□□□ -0.02
PLIN3-201ENST00000221957 PAK1Q13153 545 aa14.94□□□□□ -0.02
PLIN3-201ENST00000221957 TUBB2AQ13885 445 aa14.94□□□□□ -0.02
PLIN3-201ENST00000221957 TCP11X2Q5H9J9 407 aa14.94□□□□□ -0.02
PLIN3-201ENST00000221957 TXLNBQ8N3L3 684 aa14.94□□□□□ -0.02
PLIN3-201ENST00000221957 TUBB2BQ9BVA1 445 aa14.94□□□□□ -0.02
PLIN3-201ENST00000221957 LAMB2P55268 1798 aa14.94□□□□□ -0.02
PLIN3-201ENST00000221957 A0A1B0GUL6 1792 aa14.93□□□□□ -0.02
PLIN3-201ENST00000221957 MCM7P33993 719 aa14.93□□□□□ -0.02
PLIN3-201ENST00000221957 NELFBQ8WX92 580 aa14.93□□□□□ -0.02
PLIN3-201ENST00000221957 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
PLIN3-201ENST00000221957 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
PLIN3-201ENST00000221957 SUGCTQ9HAC7 445 aa14.93□□□□□ -0.02
PLIN3-201ENST00000221957 ADAM21Q9UKJ8 722 aa14.93□□□□□ -0.02
PLIN3-201ENST00000221957 KCNJ18B7U540 433 aa14.93□□□□□ -0.02
PLIN3-201ENST00000221957 TULP2O00295 520 aa14.93□□□□□ -0.02
PLIN3-201ENST00000221957 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
PLIN3-201ENST00000221957 KCNJ12Q14500 433 aa14.93□□□□□ -0.02
PLIN3-201ENST00000221957 PARP10Q53GL7 1025 aa14.93□□□□□ -0.02
PLIN3-201ENST00000221957 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
PLIN3-201ENST00000221957 CYP26C1Q6V0L0 522 aa14.93□□□□□ -0.02
PLIN3-201ENST00000221957 SLC51AQ86UW1 340 aa14.93□□□□□ -0.02
PLIN3-201ENST00000221957 AMIGO3Q86WK7 504 aa14.93□□□□□ -0.02
PLIN3-201ENST00000221957 SLF1Q9BQI6 1058 aa14.93□□□□□ -0.02
PLIN3-201ENST00000221957 ABCB6Q9NP58 842 aa14.93□□□□□ -0.02
PLIN3-201ENST00000221957 L1RE1Q9UN81 338 aa14.93□□□□□ -0.02
PLIN3-201ENST00000221957 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa14.93□□□□□ -0.02
PLIN3-201ENST00000221957 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP14.93□□□□□ -0.02
PLIN3-201ENST00000221957 GDAQ9Y2T3 454 aa14.93□□□□□ -0.02
PLIN3-201ENST00000221957 USP17L12C9JPN9 530 aa14.92□□□□□ -0.02
PLIN3-201ENST00000221957 USP17L21D6R901 530 aa14.92□□□□□ -0.02
PLIN3-201ENST00000221957 POTEB2H3BUK9 544 aa14.92□□□□□ -0.02
PLIN3-201ENST00000221957 RHOXF2BP0C7M4 288 aa14.92□□□□□ -0.02
PLIN3-201ENST00000221957 SCG2P13521 617 aa14.92□□□□□ -0.02
PLIN3-201ENST00000221957 KRT9P35527 623 aa14.92□□□□□ -0.02
PLIN3-201ENST00000221957 MCM6Q14566 821 aa14.92□□□□□ -0.02
PLIN3-201ENST00000221957 IRF2BP1Q8IU81 584 aa14.92□□□□□ -0.02
PLIN3-201ENST00000221957 CHP1Q99653 195 aa14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.5 ms