RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000031823.11

Herc3-201, Transcript of Hect domain and RLD 3, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Herc3, Length 3,596 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm11437Q5QR91 290 aa13.45□□□□□ -0.26
Herc3-201ENSMUST00000031823 Akap4Q60662 849 aa13.45□□□□□ -0.26
Herc3-201ENSMUST00000031823 Adgrg6Q6F3F9 1165 aa13.45□□□□□ -0.26
Herc3-201ENSMUST00000031823 Clca4aQ6Q473 924 aa13.45□□□□□ -0.26
Herc3-201ENSMUST00000031823 RadxQ8C779 850 aa13.45□□□□□ -0.26
Herc3-201ENSMUST00000031823 BccipQ9CWI3 316 aa13.45□□□□□ -0.26
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tmem191cQ9JJB1 302 aa13.45□□□□□ -0.26
Herc3-201ENSMUST00000031823 GdaQ9R111 454 aa13.45□□□□□ -0.26
Herc3-201ENSMUST00000031823 Spata21Q8BHW6 681 aa13.45□□□□□ -0.26
Herc3-201ENSMUST00000031823 Krt23Q99PS0 422 aa13.45□□□□□ -0.26
Herc3-201ENSMUST00000031823 Nova2D3YVV7 556 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
Herc3-201ENSMUST00000031823 Snapc2Q91XA5 359 aa13.45□□□□□ -0.26
Herc3-201ENSMUST00000031823 Arpp21Q9DCB4 807 aa13.45□□□□□ -0.26
Herc3-201ENSMUST00000031823 Wdr33Q8K4P0 1330 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
Herc3-201ENSMUST00000031823 Epha2Q03145 977 aa13.44□□□□□ -0.26
Herc3-201ENSMUST00000031823 Grm4Q68EF4 912 aa13.44□□□□□ -0.26
Herc3-201ENSMUST00000031823 Zscan22Q8BGS5 496 aa13.44□□□□□ -0.26
Herc3-201ENSMUST00000031823 Nlrp5Q9R1M5 1163 aa13.44□□□□□ -0.26
Herc3-201ENSMUST00000031823 Psmd10Q9Z2X2 231 aa13.44□□□□□ -0.26
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pabpc1lA2A5N3 607 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
Herc3-201ENSMUST00000031823 Phldb3E9QAF4 648 aa13.44□□□□□ -0.26
Herc3-201ENSMUST00000031823 Zfp953Q3UPV7 304 aa13.44□□□□□ -0.26
Herc3-201ENSMUST00000031823 Vmn1r209Q5NC97 312 aa13.44□□□□□ -0.26
Herc3-201ENSMUST00000031823 Madcam1Q61826 405 aa13.44□□□□□ -0.26
Herc3-201ENSMUST00000031823 Kctd3Q8BFX3 815 aa13.44□□□□□ -0.26
Herc3-201ENSMUST00000031823 Scfd2Q8BTY8 684 aa13.44□□□□□ -0.26
Herc3-201ENSMUST00000031823 Dppa3Q8QZY3 150 aa13.44□□□□□ -0.26
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gtf3c5Q8R2T8 520 aa13.44□□□□□ -0.26
Herc3-201ENSMUST00000031823 TbcbQ9D1E6 244 aa13.44□□□□□ -0.26
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gucy1a2F8VQK3 730 aa13.43□□□□□ -0.26
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mboat4P0C7A3 435 aa13.43□□□□□ -0.26
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gjb4Q02738 266 aa13.43□□□□□ -0.26
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pls1Q3V0K9 630 aa13.43□□□□□ -0.26
Herc3-201ENSMUST00000031823 Lrrcc1Q69ZB0 1026 aa13.43□□□□□ -0.26
Herc3-201ENSMUST00000031823 IqcgQ80W32 419 aa13.43□□□□□ -0.26
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tspyl4Q8VD63 406 aa13.43□□□□□ -0.26
Herc3-201ENSMUST00000031823 Lmbr1Q9JIT0 490 aa13.43□□□□□ -0.26
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ddx20Q9JJY4 825 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
Herc3-201ENSMUST00000031823 Nr2e3Q9QXZ7 395 aa13.43□□□□□ -0.26
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tpm3-rs7D3Z2H9 248 aa13.43□□□□□ -0.26
Herc3-201ENSMUST00000031823 Jakmip3Q5DTN8 844 aa13.43□□□□□ -0.26
Herc3-201ENSMUST00000031823 Krt74Q6IFZ9 495 aa13.43□□□□□ -0.26
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tcp11l1Q8BTG3 509 aa13.43□□□□□ -0.26
Herc3-201ENSMUST00000031823 VirmaA2AIV2 1811 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
Herc3-201ENSMUST00000031823 PparaP23204 468 aa13.43□□□□□ -0.26
Herc3-201ENSMUST00000031823 Lilrb3P97484 841 aa13.43□□□□□ -0.26
Herc3-201ENSMUST00000031823 Igf2bp2Q5SF07 592 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
Herc3-201ENSMUST00000031823 Slc9a1Q61165 820 aa13.43□□□□□ -0.26
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ift122Q6NWV3 1182 aa13.43□□□□□ -0.26
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ccdc150Q8CDI7 1110 aa13.43□□□□□ -0.26
Herc3-201ENSMUST00000031823 Plcg2Q8CIH5 1265 aa13.43□□□□□ -0.26
Herc3-201ENSMUST00000031823 Hps3Q91VB4 1002 aa13.43□□□□□ -0.26
Herc3-201ENSMUST00000031823 Aldh1b1Q9CZS1 519 aa13.43□□□□□ -0.26
Herc3-201ENSMUST00000031823 Utp3Q9JI13 469 aaKnown RBP13.43□□□□□ -0.26
Herc3-201ENSMUST00000031823 Calhm4Q8CE93 315 aa13.42□□□□□ -0.26
Herc3-201ENSMUST00000031823 4921524L21RikQ9D5T2 438 aa13.42□□□□□ -0.26
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tbc1d2B1AVH7 922 aa13.42□□□□□ -0.26
Herc3-201ENSMUST00000031823 C87499Q3UX49 493 aa13.42□□□□□ -0.26
Herc3-201ENSMUST00000031823 Prkag3Q8BGM7 489 aa13.42□□□□□ -0.26
Herc3-201ENSMUST00000031823 Fez1Q8K0X8 392 aa13.42□□□□□ -0.26
Herc3-201ENSMUST00000031823 AdpgkQ8VDL4 496 aa13.42□□□□□ -0.26
Herc3-201ENSMUST00000031823 Dnaaf5B9EJR8 853 aa13.42□□□□□ -0.26
Herc3-201ENSMUST00000031823 Dapk3O54784 448 aa13.42□□□□□ -0.26
Herc3-201ENSMUST00000031823 Dnajb6O54946 365 aa13.42□□□□□ -0.26
Herc3-201ENSMUST00000031823 LdhbP16125 334 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
Herc3-201ENSMUST00000031823 OatP29758 439 aa13.42□□□□□ -0.26
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gdf10P97737 476 aa13.42□□□□□ -0.26
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mical3Q8CJ19 1993 aa13.42□□□□□ -0.26
Herc3-201ENSMUST00000031823 Zscan29E9Q5B4 869 aa13.41□□□□□ -0.26
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tfcp2l1Q3UNW5 479 aa13.41□□□□□ -0.26
Herc3-201ENSMUST00000031823 Stxbp3Q60770 592 aa13.41□□□□□ -0.26
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cyp7b1Q60991 507 aa13.41□□□□□ -0.26
Herc3-201ENSMUST00000031823 Fbxo11Q7TPD1 930 aaKnown RBP13.41□□□□□ -0.26
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ubxn4Q8VCH8 506 aa13.41□□□□□ -0.26
Herc3-201ENSMUST00000031823 Wdr64Q9D565 1086 aa13.41□□□□□ -0.26
Herc3-201ENSMUST00000031823 NinQ61043 2035 aa13.41□□□□□ -0.26
Herc3-201ENSMUST00000031823 Myh6Q02566 1938 aaKnown RBP13.41□□□□□ -0.26
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pramel3A2AHA7 463 aa13.41□□□□□ -0.26
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm7903A2AWL1 463 aa13.41□□□□□ -0.26
Herc3-201ENSMUST00000031823 AV320801A2AWL3 467 aa13.41□□□□□ -0.26
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm15023L7MUB4 467 aa13.41□□□□□ -0.26
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tmprss11eQ5S248 423 aa13.41□□□□□ -0.26
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cdca8Q8BHX3 289 aa13.41□□□□□ -0.26
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rasgrp4Q8BTM9 673 aa13.41□□□□□ -0.26
Herc3-201ENSMUST00000031823 Hs2st1Q8R3H7 356 aa13.41□□□□□ -0.26
Herc3-201ENSMUST00000031823 Inpp4aQ9EPW0 939 aa13.41□□□□□ -0.26
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm5114W4VSN8 858 aa13.41□□□□□ -0.26
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tph1P17532 447 aa13.41□□□□□ -0.26
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tdrd3Q91W18 743 aaKnown RBP13.41□□□□□ -0.26
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cul5Q9D5V5 780 aa13.41□□□□□ -0.26
Herc3-201ENSMUST00000031823 Myo1hQ9D6A1 958 aa13.41□□□□□ -0.26
Herc3-201ENSMUST00000031823 Scn9aQ62205 1984 aa13.4□□□□□ -0.26
Herc3-201ENSMUST00000031823 DSCC1Q14AI0 399 aa13.4□□□□□ -0.26
Herc3-201ENSMUST00000031823 Slc10a4Q3UEZ8 437 aa13.4□□□□□ -0.26
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gprin1Q3UNH4 932 aa13.4□□□□□ -0.26
Herc3-201ENSMUST00000031823 Dync1li2Q6PDL0 492 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tex13cD3YU32 604 aa13.4□□□□□ -0.26
Herc3-201ENSMUST00000031823 LRWD1Q8BUI3 648 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
Herc3-201ENSMUST00000031823 Q8K2W9 541 aa13.4□□□□□ -0.26
Herc3-201ENSMUST00000031823 Spon1Q8VCC9 807 aa13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 26.6 ms