RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617158.4

CSAG3-202, Transcript of CSAG family member 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CSAG3, Length 789 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG3-202ENST00000617158 STK3Q13188 491 aa24.49■■□□□ 1.51
CSAG3-202ENST00000617158 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
CSAG3-202ENST00000617158 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
CSAG3-202ENST00000617158 PICK1Q9NRD5 415 aa24.49■■□□□ 1.51
CSAG3-202ENST00000617158 SLC12A7Q9Y666 1083 aa24.49■■□□□ 1.51
CSAG3-202ENST00000617158 ZBTB43O43298 467 aa24.48■■□□□ 1.51
CSAG3-202ENST00000617158 DTNBO60941 627 aa24.48■■□□□ 1.51
CSAG3-202ENST00000617158 SNHG28P0DPA3 235 aa24.48■■□□□ 1.51
CSAG3-202ENST00000617158 CDC27P30260 824 aa24.48■■□□□ 1.51
CSAG3-202ENST00000617158 GJA5P36382 358 aa24.48■■□□□ 1.51
CSAG3-202ENST00000617158 SCRN1Q12765 414 aa24.48■■□□□ 1.51
CSAG3-202ENST00000617158 CUL4AQ13619 759 aa24.48■■□□□ 1.51
CSAG3-202ENST00000617158 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa24.48■■□□□ 1.51
CSAG3-202ENST00000617158 CSADQ9Y600 493 aa24.48■■□□□ 1.51
CSAG3-202ENST00000617158 ZHX2Q9Y6X8 837 aa24.48■■□□□ 1.51
CSAG3-202ENST00000617158 SPDYE5A6NIY4 337 aa24.47■■□□□ 1.51
CSAG3-202ENST00000617158 DDAH1O94760 285 aa24.47■■□□□ 1.51
CSAG3-202ENST00000617158 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
CSAG3-202ENST00000617158 CCT2P78371 535 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
CSAG3-202ENST00000617158 SPP2Q13103 211 aa24.47■■□□□ 1.51
CSAG3-202ENST00000617158 DGKZQ13574 1117 aa24.47■■□□□ 1.51
CSAG3-202ENST00000617158 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa24.47■■□□□ 1.51
CSAG3-202ENST00000617158 CATIPQ7Z7H3 387 aa24.47■■□□□ 1.51
CSAG3-202ENST00000617158 MICU3Q86XE3 530 aa24.47■■□□□ 1.51
CSAG3-202ENST00000617158 HSCBQ8IWL3 235 aa24.47■■□□□ 1.51
CSAG3-202ENST00000617158 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa24.47■■□□□ 1.51
CSAG3-202ENST00000617158 C2orf69Q8N8R5 385 aa24.47■■□□□ 1.51
CSAG3-202ENST00000617158 CHMP4CQ96CF2 233 aa24.47■■□□□ 1.51
CSAG3-202ENST00000617158 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa24.47■■□□□ 1.51
CSAG3-202ENST00000617158 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa24.47■■□□□ 1.51
CSAG3-202ENST00000617158 UNCXA6NJT0 531 aa24.46■■□□□ 1.51
CSAG3-202ENST00000617158 PDHBP11177 359 aa24.46■■□□□ 1.51
CSAG3-202ENST00000617158 SLC4A3P48751 1232 aa24.46■■□□□ 1.51
CSAG3-202ENST00000617158 RCAN1P53805 252 aa24.46■■□□□ 1.51
CSAG3-202ENST00000617158 GRM4Q14833 912 aa24.46■■□□□ 1.51
CSAG3-202ENST00000617158 SLC35G1Q2M3R5 365 aa24.46■■□□□ 1.51
CSAG3-202ENST00000617158 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa24.46■■□□□ 1.51
CSAG3-202ENST00000617158 GTF3C6Q969F1 213 aa24.46■■□□□ 1.51
CSAG3-202ENST00000617158 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa24.46■■□□□ 1.51
CSAG3-202ENST00000617158 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
CSAG3-202ENST00000617158 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
CSAG3-202ENST00000617158 F5H6K3 240 aa24.45■■□□□ 1.5
CSAG3-202ENST00000617158 CTDNEP1O95476 244 aa24.45■■□□□ 1.5
CSAG3-202ENST00000617158 NDUFB10O96000 172 aa24.45■■□□□ 1.5
CSAG3-202ENST00000617158 ADD1P35611 737 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
CSAG3-202ENST00000617158 KLRC3Q07444 240 aa24.45■■□□□ 1.5
CSAG3-202ENST00000617158 FSTL1Q12841 308 aa24.45■■□□□ 1.5
CSAG3-202ENST00000617158 ERO1BQ86YB8 467 aa24.45■■□□□ 1.5
CSAG3-202ENST00000617158 STAG2Q8N3U4 1231 aa24.45■■□□□ 1.5
CSAG3-202ENST00000617158 FANCBQ8NB91 859 aa24.45■■□□□ 1.5
CSAG3-202ENST00000617158 ZNF280CQ8ND82 737 aa24.45■■□□□ 1.5
CSAG3-202ENST00000617158 NUP133Q8WUM0 1156 aa24.45■■□□□ 1.5
CSAG3-202ENST00000617158 MAP3K14Q99558 947 aa24.45■■□□□ 1.5
CSAG3-202ENST00000617158 EMILIN3Q9NT22 766 aa24.45■■□□□ 1.5
CSAG3-202ENST00000617158 MAD2L2Q9UI95 211 aa24.45■■□□□ 1.5
CSAG3-202ENST00000617158 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
CSAG3-202ENST00000617158 MTMR7Q9Y216 660 aa24.45■■□□□ 1.5
CSAG3-202ENST00000617158 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
CSAG3-202ENST00000617158 GOLGA8AA7E2F4 631 aa24.44■■□□□ 1.5
CSAG3-202ENST00000617158 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
CSAG3-202ENST00000617158 NTRK3Q16288 839 aa24.44■■□□□ 1.5
CSAG3-202ENST00000617158 SLFN13Q68D06 897 aa24.44■■□□□ 1.5
CSAG3-202ENST00000617158 USP17L2Q6R6M4 530 aa24.44■■□□□ 1.5
CSAG3-202ENST00000617158 CCDC83Q8IWF9 413 aa24.44■■□□□ 1.5
CSAG3-202ENST00000617158 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
CSAG3-202ENST00000617158 VCPKMTQ9H867 229 aa24.44■■□□□ 1.5
CSAG3-202ENST00000617158 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP24.43■■□□□ 1.5
CSAG3-202ENST00000617158 BACE1P56817 501 aa24.43■■□□□ 1.5
CSAG3-202ENST00000617158 PPATQ06203 517 aa24.43■■□□□ 1.5
CSAG3-202ENST00000617158 FUT2Q10981 343 aa24.43■■□□□ 1.5
CSAG3-202ENST00000617158 MTMR2Q13614 643 aa24.43■■□□□ 1.5
CSAG3-202ENST00000617158 OTUD5Q96G74 571 aa24.43■■□□□ 1.5
CSAG3-202ENST00000617158 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
CSAG3-202ENST00000617158 TRIM75PA6NK02 468 aa24.42■■□□□ 1.5
CSAG3-202ENST00000617158 USP17L10C9JJH3 530 aa24.42■■□□□ 1.5
CSAG3-202ENST00000617158 IRF6O14896 467 aa24.42■■□□□ 1.5
CSAG3-202ENST00000617158 PLEKHA8P1O95397 391 aa24.42■■□□□ 1.5
CSAG3-202ENST00000617158 GOLGA8HP0CJ92 632 aa24.42■■□□□ 1.5
CSAG3-202ENST00000617158 CALM1P0DP23 149 aa24.42■■□□□ 1.5
CSAG3-202ENST00000617158 CALM2P0DP24 149 aa24.42■■□□□ 1.5
CSAG3-202ENST00000617158 CALM3P0DP25 149 aa24.42■■□□□ 1.5
CSAG3-202ENST00000617158 RTN1Q16799 776 aa24.42■■□□□ 1.5
CSAG3-202ENST00000617158 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa24.42■■□□□ 1.5
CSAG3-202ENST00000617158 NBPF11Q86T75 865 aa24.42■■□□□ 1.5
CSAG3-202ENST00000617158 SAPCD2Q86UD0 394 aa24.42■■□□□ 1.5
CSAG3-202ENST00000617158 OPTNQ96CV9 577 aa24.42■■□□□ 1.5
CSAG3-202ENST00000617158 SLC10A4Q96EP9 437 aa24.42■■□□□ 1.5
CSAG3-202ENST00000617158 GMCL1Q96IK5 515 aa24.42■■□□□ 1.5
CSAG3-202ENST00000617158 AS3MTQ9HBK9 375 aa24.42■■□□□ 1.5
CSAG3-202ENST00000617158 KCNH4Q9UQ05 1017 aa24.42■■□□□ 1.5
CSAG3-202ENST00000617158 LOC285556D6RIA3 1793 aa24.42■■□□□ 1.5
CSAG3-202ENST00000617158 ZNF543Q08ER8 600 aa24.41■■□□□ 1.5
CSAG3-202ENST00000617158 PPIL2Q13356 520 aa24.41■■□□□ 1.5
CSAG3-202ENST00000617158 MOGSQ13724 837 aa24.41■■□□□ 1.5
CSAG3-202ENST00000617158 SH3D19Q5HYK7 790 aa24.41■■□□□ 1.5
CSAG3-202ENST00000617158 TTBK2Q6IQ55 1244 aa24.41■■□□□ 1.5
CSAG3-202ENST00000617158 SPICE1Q8N0Z3 855 aa24.41■■□□□ 1.5
CSAG3-202ENST00000617158 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
CSAG3-202ENST00000617158 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
CSAG3-202ENST00000617158 HUNKP57058 714 aa24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22 ms