RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589634.1

SMAD7-207, Transcript of SMAD family member 7, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 4 BASIC

Gene SMAD7, Length 1,278 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD7-207ENST00000589634 NYAP2Q9P242 653 aa22.99■■□□□ 1.27
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SMAD7-207ENST00000589634 ZMYM6O95789 1325 aa22.99■■□□□ 1.27
SMAD7-207ENST00000589634 ZNF213O14771 459 aa22.98■■□□□ 1.27
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SMAD7-207ENST00000589634 COG2Q14746 738 aa22.98■■□□□ 1.27
SMAD7-207ENST00000589634 SPICE1Q8N0Z3 855 aa22.98■■□□□ 1.27
SMAD7-207ENST00000589634 NEDD1Q8NHV4 660 aa22.98■■□□□ 1.27
SMAD7-207ENST00000589634 RAET1EQ8TD07 263 aa22.98■■□□□ 1.27
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SMAD7-207ENST00000589634 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
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SMAD7-207ENST00000589634 SRRDQ9UH36 339 aa22.98■■□□□ 1.27
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SMAD7-207ENST00000589634 TTLL1O95922 423 aa22.97■■□□□ 1.27
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SMAD7-207ENST00000589634 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa22.97■■□□□ 1.27
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SMAD7-207ENST00000589634 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
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SMAD7-207ENST00000589634 LOC285556D6RIA3 1793 aa22.96■■□□□ 1.27
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SMAD7-207ENST00000589634 HAND2P61296 217 aa22.95■■□□□ 1.26
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SMAD7-207ENST00000589634 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP22.95■■□□□ 1.26
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SMAD7-207ENST00000589634 STX8Q9UNK0 236 aa22.94■■□□□ 1.26
SMAD7-207ENST00000589634 PTPRFP10586 1907 aa22.94■■□□□ 1.26
SMAD7-207ENST00000589634 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa22.93■■□□□ 1.26
SMAD7-207ENST00000589634 F5H6K3 240 aa22.93■■□□□ 1.26
SMAD7-207ENST00000589634 MAPK4P31152 587 aa22.93■■□□□ 1.26
SMAD7-207ENST00000589634 PRKCZQ05513 592 aa22.93■■□□□ 1.26
SMAD7-207ENST00000589634 KLRC3Q07444 240 aa22.93■■□□□ 1.26
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SMAD7-207ENST00000589634 FLT3LGP49771 235 aa22.91■■□□□ 1.26
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SMAD7-207ENST00000589634 WDR78Q5VTH9 848 aa22.91■■□□□ 1.26
SMAD7-207ENST00000589634 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa22.91■■□□□ 1.26
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SMAD7-207ENST00000589634 ESR2Q92731 530 aa22.91■■□□□ 1.26
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SMAD7-207ENST00000589634 FAM83BQ5T0W9 1011 aa22.9■■□□□ 1.26
SMAD7-207ENST00000589634 CASC1Q6TDU7 716 aa22.9■■□□□ 1.26
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SMAD7-207ENST00000589634 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
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SMAD7-207ENST00000589634 ADCY3O60266 1144 aa22.87■■□□□ 1.25
SMAD7-207ENST00000589634 PEX10O60683 326 aa22.87■■□□□ 1.25
SMAD7-207ENST00000589634 SOX10P56693 466 aa22.87■■□□□ 1.25
SMAD7-207ENST00000589634 UBXN2AP68543 259 aa22.87■■□□□ 1.25
SMAD7-207ENST00000589634 CCDC178Q5BJE1 867 aa22.87■■□□□ 1.25
SMAD7-207ENST00000589634 PLEKHH3Q7Z736 793 aa22.87■■□□□ 1.25
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