RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584970.1

DDX25-209, Transcript of DEAD-box helicase 25, human

TSL 3

Gene DDX25, Length 460 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDX25-209	ENST00000584970	FEZ1	Q99689	392 aa		13.29	□□□□□ -0.28
DDX25-209	ENST00000584970	TRIM75P	A6NK02	468 aa		13.28	□□□□□ -0.28
DDX25-209	ENST00000584970	SH2B2	O14492	632 aa	Predicted RBP	13.28	□□□□□ -0.28
DDX25-209	ENST00000584970	NMT2	O60551	498 aa		13.28	□□□□□ -0.28
DDX25-209	ENST00000584970	CETP	P11597	493 aa		13.28	□□□□□ -0.28
DDX25-209	ENST00000584970	GJA5	P36382	358 aa		13.28	□□□□□ -0.28
DDX25-209	ENST00000584970	MTMR2	Q13614	643 aa		13.28	□□□□□ -0.28
DDX25-209	ENST00000584970	RABEP1	Q15276	862 aa		13.28	□□□□□ -0.28
DDX25-209	ENST00000584970	ANKRD1	Q15327	319 aa		13.28	□□□□□ -0.28
DDX25-209	ENST00000584970	TMEM67	Q5HYA8	995 aa		13.28	□□□□□ -0.28
DDX25-209	ENST00000584970	USP17L2	Q6R6M4	530 aa		13.28	□□□□□ -0.28
DDX25-209	ENST00000584970	FASTKD5	Q7L8L6	764 aa	Known RBP	13.28	□□□□□ -0.28
DDX25-209	ENST00000584970	NKX2-3	Q8TAU0	364 aa		13.28	□□□□□ -0.28
DDX25-209	ENST00000584970	MAP3K14	Q99558	947 aa		13.28	□□□□□ -0.28
DDX25-209	ENST00000584970	KIF2C	Q99661	725 aa		13.28	□□□□□ -0.28
DDX25-209	ENST00000584970	VCPKMT	Q9H867	229 aa		13.28	□□□□□ -0.28
DDX25-209	ENST00000584970	KAT14	Q9H8E8	782 aa		13.28	□□□□□ -0.28
DDX25-209	ENST00000584970	LY9	Q9HBG7	655 aa		13.28	□□□□□ -0.28
DDX25-209	ENST00000584970	ZCCHC17	Q9NP64	241 aa	Known RBP	13.28	□□□□□ -0.28
DDX25-209	ENST00000584970	FRMD4A	Q9P2Q2	1039 aa	Predicted RBP	13.28	□□□□□ -0.28
DDX25-209	ENST00000584970	CLIP2	Q9UDT6	1046 aa		13.28	□□□□□ -0.28
DDX25-209	ENST00000584970		A0A1W2PRG0	241 aa		13.27	□□□□□ -0.29
DDX25-209	ENST00000584970	TESPA1	A2RU30	521 aa	Predicted RBP	13.27	□□□□□ -0.29
DDX25-209	ENST00000584970	MAP2K2	P36507	400 aa		13.27	□□□□□ -0.29
DDX25-209	ENST00000584970	SREBF2	Q12772	1141 aa		13.27	□□□□□ -0.29
DDX25-209	ENST00000584970	PNMA1	Q8ND90	353 aa		13.27	□□□□□ -0.29
DDX25-209	ENST00000584970	ACER1	Q8TDN7	264 aa		13.27	□□□□□ -0.29
DDX25-209	ENST00000584970	CNKSR2	Q8WXI2	1034 aa		13.27	□□□□□ -0.29
DDX25-209	ENST00000584970	GMCL1	Q96IK5	515 aa		13.27	□□□□□ -0.29
DDX25-209	ENST00000584970	MS4A4A	Q96JQ5	239 aa		13.27	□□□□□ -0.29
DDX25-209	ENST00000584970	CAPNS2	Q96L46	248 aa		13.27	□□□□□ -0.29
DDX25-209	ENST00000584970	TMEM47	Q9BQJ4	181 aa		13.27	□□□□□ -0.29
DDX25-209	ENST00000584970	ZKSCAN3	Q9BRR0	538 aa		13.27	□□□□□ -0.29
DDX25-209	ENST00000584970	TMOD4	Q9NZQ9	345 aa		13.27	□□□□□ -0.29
DDX25-209	ENST00000584970	SLC45A1	Q9Y2W3	748 aa		13.27	□□□□□ -0.29
DDX25-209	ENST00000584970	WDR46	O15213	610 aa	Known RBP	13.26	□□□□□ -0.29
DDX25-209	ENST00000584970	DDAH1	O94760	285 aa		13.26	□□□□□ -0.29
DDX25-209	ENST00000584970	CALM1	P0DP23	149 aa		13.26	□□□□□ -0.29
DDX25-209	ENST00000584970	CALM2	P0DP24	149 aa		13.26	□□□□□ -0.29
DDX25-209	ENST00000584970	CALM3	P0DP25	149 aa		13.26	□□□□□ -0.29
DDX25-209	ENST00000584970	SNHG28	P0DPA3	235 aa		13.26	□□□□□ -0.29
DDX25-209	ENST00000584970	EVC	P57679	992 aa		13.26	□□□□□ -0.29
DDX25-209	ENST00000584970	FGD1	P98174	961 aa		13.26	□□□□□ -0.29
DDX25-209	ENST00000584970	ATP2B2	Q01814	1243 aa		13.26	□□□□□ -0.29
DDX25-209	ENST00000584970	PABPC4	Q13310	644 aa	Known RBP eCLIP	13.26	□□□□□ -0.29
DDX25-209	ENST00000584970	PPP2R5B	Q15173	497 aa		13.26	□□□□□ -0.29
DDX25-209	ENST00000584970	CHST3	Q7LGC8	479 aa		13.26	□□□□□ -0.29
DDX25-209	ENST00000584970	CLEC10A	Q8IUN9	316 aa		13.26	□□□□□ -0.29
DDX25-209	ENST00000584970	DCAF4	Q8WV16	495 aa		13.26	□□□□□ -0.29
DDX25-209	ENST00000584970	UPF3B	Q9BZI7	483 aa	Known RBP	13.26	□□□□□ -0.29
DDX25-209	ENST00000584970	PDRG1	Q9NUG6	133 aa		13.26	□□□□□ -0.29
DDX25-209	ENST00000584970	NID2	Q14112	1375 aa		13.25	□□□□□ -0.29
DDX25-209	ENST00000584970	WDR33	Q9C0J8	1336 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
DDX25-209	ENST00000584970	CCDC69	A6NI79	296 aa		13.25	□□□□□ -0.29
DDX25-209	ENST00000584970		F5H6K3	240 aa		13.25	□□□□□ -0.29
DDX25-209	ENST00000584970	HMGCS2	P54868	508 aa		13.25	□□□□□ -0.29
DDX25-209	ENST00000584970	KLRC3	Q07444	240 aa		13.25	□□□□□ -0.29
DDX25-209	ENST00000584970	COL9A3	Q14050	684 aa	Predicted RBP	13.25	□□□□□ -0.29
DDX25-209	ENST00000584970	GPATCH4	Q5T3I0	446 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
DDX25-209	ENST00000584970	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		13.25	□□□□□ -0.29
DDX25-209	ENST00000584970		Q6ZUG5	572 aa		13.25	□□□□□ -0.29
DDX25-209	ENST00000584970	CATIP	Q7Z7H3	387 aa		13.25	□□□□□ -0.29
DDX25-209	ENST00000584970	CCDC84	Q86UT8	332 aa	Predicted RBP	13.25	□□□□□ -0.29
DDX25-209	ENST00000584970	EMILIN3	Q9NT22	766 aa		13.25	□□□□□ -0.29
DDX25-209	ENST00000584970	AGTPBP1	Q9UPW5	1226 aa		13.25	□□□□□ -0.29
DDX25-209	ENST00000584970	RLF	Q13129	1914 aa		13.25	□□□□□ -0.29
DDX25-209	ENST00000584970	ST18	O60284	1047 aa		13.24	□□□□□ -0.29
DDX25-209	ENST00000584970	PLA2G6	O60733	806 aa		13.24	□□□□□ -0.29
DDX25-209	ENST00000584970	NDUFB10	O96000	172 aa		13.24	□□□□□ -0.29
DDX25-209	ENST00000584970	PDHB	P11177	359 aa		13.24	□□□□□ -0.29
DDX25-209	ENST00000584970	VCAM1	P19320	739 aa		13.24	□□□□□ -0.29
DDX25-209	ENST00000584970	HOXA7	P31268	230 aa	Predicted RBP	13.24	□□□□□ -0.29
DDX25-209	ENST00000584970	TM4SF4	P48230	202 aa		13.24	□□□□□ -0.29
DDX25-209	ENST00000584970	NEK4	P51957	841 aa		13.24	□□□□□ -0.29
DDX25-209	ENST00000584970	TROAP	Q12815	778 aa		13.24	□□□□□ -0.29
DDX25-209	ENST00000584970	MOGS	Q13724	837 aa		13.24	□□□□□ -0.29
DDX25-209	ENST00000584970	OTUD7B	Q6GQQ9	843 aa		13.24	□□□□□ -0.29
DDX25-209	ENST00000584970	APOA5	Q6Q788	366 aa		13.24	□□□□□ -0.29
DDX25-209	ENST00000584970	SYNE3	Q6ZMZ3	975 aa		13.24	□□□□□ -0.29
DDX25-209	ENST00000584970	PAXIP1	Q6ZW49	1069 aa	Predicted RBP	13.24	□□□□□ -0.29
DDX25-209	ENST00000584970	ANKRD23	Q86SG2	305 aa		13.24	□□□□□ -0.29
DDX25-209	ENST00000584970	LRRC47	Q8N1G4	583 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
DDX25-209	ENST00000584970	SLC12A7	Q9Y666	1083 aa		13.24	□□□□□ -0.29
DDX25-209	ENST00000584970		A0A0G2JMZ2	1700 aa		13.24	□□□□□ -0.29
DDX25-209	ENST00000584970	MYPN	Q86TC9	1320 aa		13.23	□□□□□ -0.29
DDX25-209	ENST00000584970	CCL15-CCL14	A0A0B4J2E2	113 aa		13.23	□□□□□ -0.29
DDX25-209	ENST00000584970	ALDH1A1	P00352	501 aa		13.23	□□□□□ -0.29
DDX25-209	ENST00000584970	CPA1	P15085	419 aa		13.23	□□□□□ -0.29
DDX25-209	ENST00000584970	KIF5B	P33176	963 aa		13.23	□□□□□ -0.29
DDX25-209	ENST00000584970	SLC1A4	P43007	532 aa		13.23	□□□□□ -0.29
DDX25-209	ENST00000584970	MCM2	P49736	904 aa		13.23	□□□□□ -0.29
DDX25-209	ENST00000584970	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
DDX25-209	ENST00000584970	CCL15	Q16663	113 aa		13.23	□□□□□ -0.29
DDX25-209	ENST00000584970	ASPRV1	Q53RT3	343 aa		13.23	□□□□□ -0.29
DDX25-209	ENST00000584970	SLFN13	Q68D06	897 aa		13.23	□□□□□ -0.29
DDX25-209	ENST00000584970	NFXL1	Q6ZNB6	911 aa		13.23	□□□□□ -0.29
DDX25-209	ENST00000584970	ZNF654	Q8IZM8	581 aa		13.23	□□□□□ -0.29
DDX25-209	ENST00000584970	BRF1	Q92994	677 aa		13.23	□□□□□ -0.29
DDX25-209	ENST00000584970	ZNF274	Q96GC6	653 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
DDX25-209	ENST00000584970	IPO9	Q96P70	1041 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29

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