RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579969.1

SNORD53-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 53, humanhuman

BASIC

Gene SNORD53, Length 78 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD53-201ENST00000579969 NUP133Q8WUM0 1156 aa3.06□□□□□ -1.92
SNORD53-201ENST00000579969 ARAP2Q8WZ64 1704 aa3.06□□□□□ -1.92
SNORD53-201ENST00000579969 EDAQ92838 391 aa3.06□□□□□ -1.92
SNORD53-201ENST00000579969 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
SNORD53-201ENST00000579969 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
SNORD53-201ENST00000579969 WDR18Q9BV38 432 aa3.06□□□□□ -1.92
SNORD53-201ENST00000579969 TBC1D2Q9BYX2 928 aa3.06□□□□□ -1.92
SNORD53-201ENST00000579969 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa3.06□□□□□ -1.92
SNORD53-201ENST00000579969 AS3MTQ9HBK9 375 aa3.06□□□□□ -1.92
SNORD53-201ENST00000579969 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa3.06□□□□□ -1.92
SNORD53-201ENST00000579969 STARD7Q9NQZ5 370 aa3.06□□□□□ -1.92
SNORD53-201ENST00000579969 TLR9Q9NR96 1032 aa3.06□□□□□ -1.92
SNORD53-201ENST00000579969 LMCD1Q9NZU5 365 aa3.06□□□□□ -1.92
SNORD53-201ENST00000579969 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
SNORD53-201ENST00000579969 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa3.06□□□□□ -1.92
SNORD53-201ENST00000579969 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa3.06□□□□□ -1.92
SNORD53-201ENST00000579969 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa3.05□□□□□ -1.92
SNORD53-201ENST00000579969 DNAH14Q0VDD8 3507 aa3.05□□□□□ -1.92
SNORD53-201ENST00000579969 ATRNL1Q5VV63 1379 aa3.05□□□□□ -1.92
SNORD53-201ENST00000579969 ZNF536O15090 1300 aa3.05□□□□□ -1.92
SNORD53-201ENST00000579969 ELP1O95163 1332 aa3.05□□□□□ -1.92
SNORD53-201ENST00000579969 MROH7Q68CQ1 1323 aa3.05□□□□□ -1.92
SNORD53-201ENST00000579969 TMEM221A6NGB7 291 aa3.05□□□□□ -1.92
SNORD53-201ENST00000579969 KIF28PB7ZC32 967 aa3.05□□□□□ -1.92
SNORD53-201ENST00000579969 USP17L10C9JJH3 530 aa3.05□□□□□ -1.92
SNORD53-201ENST00000579969 H3BQ06 376 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
SNORD53-201ENST00000579969 M0R296 226 aa3.05□□□□□ -1.92
SNORD53-201ENST00000579969 ARVCFO00192 962 aa3.05□□□□□ -1.92
SNORD53-201ENST00000579969 STRNO43815 780 aa3.05□□□□□ -1.92
SNORD53-201ENST00000579969 COBLO75128 1261 aa3.05□□□□□ -1.92
SNORD53-201ENST00000579969 CNMDO75829 334 aa3.05□□□□□ -1.92
SNORD53-201ENST00000579969 IRS1P35568 1242 aa3.05□□□□□ -1.92
SNORD53-201ENST00000579969 CAP2P40123 477 aa3.05□□□□□ -1.92
SNORD53-201ENST00000579969 TMPOP42166 694 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
SNORD53-201ENST00000579969 ACLYP53396 1101 aa3.05□□□□□ -1.92
SNORD53-201ENST00000579969 CASP7P55210 303 aa3.05□□□□□ -1.92
SNORD53-201ENST00000579969 FOXO4P98177 505 aa3.05□□□□□ -1.92
SNORD53-201ENST00000579969 ZP2Q05996 745 aa3.05□□□□□ -1.92
SNORD53-201ENST00000579969 LMOD3Q0VAK6 560 aa3.05□□□□□ -1.92
SNORD53-201ENST00000579969 MTMR2Q13614 643 aa3.05□□□□□ -1.92
SNORD53-201ENST00000579969 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
SNORD53-201ENST00000579969 NEUROD2Q15784 382 aa3.05□□□□□ -1.92
SNORD53-201ENST00000579969 KCNA10Q16322 511 aa3.05□□□□□ -1.92
SNORD53-201ENST00000579969 CCDC57Q2TAC2 916 aa3.05□□□□□ -1.92
SNORD53-201ENST00000579969 NBPF20Q3BBV1 942 aa3.05□□□□□ -1.92
SNORD53-201ENST00000579969 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
SNORD53-201ENST00000579969 LMBR1LQ6UX01 489 aa3.05□□□□□ -1.92
SNORD53-201ENST00000579969 TRIM67Q6ZTA4 783 aa3.05□□□□□ -1.92
SNORD53-201ENST00000579969 RNF135Q8IUD6 432 aa3.05□□□□□ -1.92
SNORD53-201ENST00000579969 ADHFE1Q8IWW8 467 aa3.05□□□□□ -1.92
SNORD53-201ENST00000579969 ADSSL1Q8N142 457 aa3.05□□□□□ -1.92
SNORD53-201ENST00000579969 KLHDC9Q8NEP7 349 aa3.05□□□□□ -1.92
SNORD53-201ENST00000579969 WDR66Q8TBY9 1149 aa3.05□□□□□ -1.92
SNORD53-201ENST00000579969 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
SNORD53-201ENST00000579969 NEK9Q8TD19 979 aa3.05□□□□□ -1.92
SNORD53-201ENST00000579969 RMDN1Q96DB5 314 aa3.05□□□□□ -1.92
SNORD53-201ENST00000579969 FSD1Q9BTV5 496 aa3.05□□□□□ -1.92
SNORD53-201ENST00000579969 IDI2Q9BXS1 227 aa3.05□□□□□ -1.92
SNORD53-201ENST00000579969 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
SNORD53-201ENST00000579969 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
SNORD53-201ENST00000579969 SLC5A4Q9NY91 659 aa3.05□□□□□ -1.92
SNORD53-201ENST00000579969 PRKAG3Q9UGI9 489 aa3.05□□□□□ -1.92
SNORD53-201ENST00000579969 MUTYHQ9UIF7 546 aa3.05□□□□□ -1.92
SNORD53-201ENST00000579969 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
SNORD53-201ENST00000579969 FAM50BQ9Y247 325 aa3.05□□□□□ -1.92
SNORD53-201ENST00000579969 GPR179Q6PRD1 2367 aa3.05□□□□□ -1.92
SNORD53-201ENST00000579969 TRANK1O15050 2925 aa3.05□□□□□ -1.92
SNORD53-201ENST00000579969 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
SNORD53-201ENST00000579969 PTPRFP10586 1907 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD53-201ENST00000579969 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
SNORD53-201ENST00000579969 MOXD2PA6NHM9 499 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD53-201ENST00000579969 FAM196BA6NMK8 535 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD53-201ENST00000579969 USP17L15C9J2P7 530 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD53-201ENST00000579969 USP17L13C9JLJ4 530 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD53-201ENST00000579969 USP17L11C9JVI0 530 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD53-201ENST00000579969 USP17L18D6R9N7 530 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD53-201ENST00000579969 USP17L22D6RA61 530 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD53-201ENST00000579969 USP17L17D6RBQ6 530 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD53-201ENST00000579969 USP17L19D6RCP7 530 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD53-201ENST00000579969 USP17L20D6RJB6 530 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD53-201ENST00000579969 TLR3O15455 904 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
SNORD53-201ENST00000579969 ADAMTS4O75173 837 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD53-201ENST00000579969 ARHGEF15O94989 841 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD53-201ENST00000579969 CD4P01730 458 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD53-201ENST00000579969 LDHBP07195 334 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
SNORD53-201ENST00000579969 ADORA2AP29274 412 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD53-201ENST00000579969 NBL1P41271 181 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD53-201ENST00000579969 VCPP55072 806 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
SNORD53-201ENST00000579969 CCL23P55773 120 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD53-201ENST00000579969 USP17L24Q0WX57 530 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD53-201ENST00000579969 PICALMQ13492 652 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD53-201ENST00000579969 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP3.04□□□□□ -1.92
SNORD53-201ENST00000579969 TTLL4Q14679 1199 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD53-201ENST00000579969 ACAP1Q15027 740 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD53-201ENST00000579969 ST3GAL2Q16842 350 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD53-201ENST00000579969 CCDC30Q5VVM6 783 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD53-201ENST00000579969 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD53-201ENST00000579969 EP400NLQ6ZTU2 488 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD53-201ENST00000579969 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa3.04□□□□□ -1.92
SNORD53-201ENST00000579969 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.1 ms