RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000575194.5

SPNS3-204, Transcript of sphingolipid transporter 3 (putative), humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SPNS3, Length 1,721 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS3-204ENST00000575194 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
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SPNS3-204ENST00000575194 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
SPNS3-204ENST00000575194 GPR162Q16538 588 aa21.5■■□□□ 1.03
SPNS3-204ENST00000575194 STRIP1Q5VSL9 837 aa21.5■■□□□ 1.03
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SPNS3-204ENST00000575194 C16orf86Q6ZW13 317 aa21.5■■□□□ 1.03
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SPNS3-204ENST00000575194 ZNF202O95125 648 aa21.49■■□□□ 1.03
SPNS3-204ENST00000575194 RESP18Q5W5W9 173 aa21.49■■□□□ 1.03
SPNS3-204ENST00000575194 NIM1KQ8IY84 436 aa21.49■■□□□ 1.03
SPNS3-204ENST00000575194 JDP2Q8WYK2 163 aa21.49■■□□□ 1.03
SPNS3-204ENST00000575194 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
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SPNS3-204ENST00000575194 USP17L4A6NCW7 530 aa21.49■■□□□ 1.03
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SPNS3-204ENST00000575194 LMNB1P20700 586 aa21.49■■□□□ 1.03
SPNS3-204ENST00000575194 SYKP43405 635 aa21.49■■□□□ 1.03
SPNS3-204ENST00000575194 RHBDL3P58872 404 aa21.49■■□□□ 1.03
SPNS3-204ENST00000575194 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa21.49■■□□□ 1.03
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SPNS3-204ENST00000575194 USP17L1Q7RTZ2 530 aa21.49■■□□□ 1.03
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SPNS3-204ENST00000575194 PNMA1Q8ND90 353 aa21.49■■□□□ 1.03
SPNS3-204ENST00000575194 VPS54Q9P1Q0 977 aa21.49■■□□□ 1.03
SPNS3-204ENST00000575194 HPSEQ9Y251 543 aa21.49■■□□□ 1.03
SPNS3-204ENST00000575194 TPM3P06753 285 aa21.48■■□□□ 1.03
SPNS3-204ENST00000575194 PLCB2Q00722 1185 aa21.48■■□□□ 1.03
SPNS3-204ENST00000575194 GRM4Q14833 912 aa21.48■■□□□ 1.03
SPNS3-204ENST00000575194 CERS5Q8N5B7 392 aa21.48■■□□□ 1.03
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SPNS3-204ENST00000575194 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa21.47■■□□□ 1.03
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SPNS3-204ENST00000575194 SCG2P13521 617 aa21.47■■□□□ 1.03
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SPNS3-204ENST00000575194 IL17RBQ9NRM6 502 aa21.47■■□□□ 1.03
SPNS3-204ENST00000575194 FZD9O00144 591 aa21.46■■□□□ 1.03
SPNS3-204ENST00000575194 GRIN3BO60391 1043 aa21.46■■□□□ 1.03
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SPNS3-204ENST00000575194 NR5A1Q13285 461 aa21.46■■□□□ 1.03
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SPNS3-204ENST00000575194 KIAA1468Q9P260 1216 aa21.46■■□□□ 1.03
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SPNS3-204ENST00000575194 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
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SPNS3-204ENST00000575194 RAD17O75943 681 aa21.45■■□□□ 1.02
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SPNS3-204ENST00000575194 OXER1Q8TDS5 423 aa21.45■■□□□ 1.02
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SPNS3-204ENST00000575194 NEDD1Q8NHV4 660 aa21.44■■□□□ 1.02
SPNS3-204ENST00000575194 CABP5Q9NP86 173 aa21.44■■□□□ 1.02
SPNS3-204ENST00000575194 BECN2A8MW95 431 aa21.43■■□□□ 1.02
SPNS3-204ENST00000575194 PSMD14O00487 310 aa21.43■■□□□ 1.02
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SPNS3-204ENST00000575194 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
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SPNS3-204ENST00000575194 GMLQ99445 158 aa21.42■■□□□ 1.02
SPNS3-204ENST00000575194 KCNH3Q9ULD8 1083 aa21.42■■□□□ 1.02
SPNS3-204ENST00000575194 STX8Q9UNK0 236 aa21.42■■□□□ 1.02
SPNS3-204ENST00000575194 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa21.42■■□□□ 1.02
SPNS3-204ENST00000575194 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa21.41■■□□□ 1.02
SPNS3-204ENST00000575194 AP5Z1O43299 807 aa21.41■■□□□ 1.02
SPNS3-204ENST00000575194 NLRP12P59046 1061 aa21.41■■□□□ 1.02
SPNS3-204ENST00000575194 CIAPIN1Q6FI81 312 aa21.41■■□□□ 1.02
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