RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570051.5

RNPS1-226, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, humanhuman

TSL 2

Gene RNPS1, Length 735 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPS1-226ENST00000570051 BMP2KLQ5H9B9 411 aa24.52■■□□□ 1.52
RNPS1-226ENST00000570051 FAM47AQ5JRC9 791 aa24.52■■□□□ 1.52
RNPS1-226ENST00000570051 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
RNPS1-226ENST00000570051 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa24.52■■□□□ 1.52
RNPS1-226ENST00000570051 LPAR1Q92633 364 aa24.52■■□□□ 1.52
RNPS1-226ENST00000570051 NYAP2Q9P242 653 aa24.52■■□□□ 1.52
RNPS1-226ENST00000570051 MYH4Q9Y623 1939 aa24.52■■□□□ 1.52
RNPS1-226ENST00000570051 TFAP4Q01664 338 aa24.51■■□□□ 1.51
RNPS1-226ENST00000570051 CEP95Q96GE4 821 aa24.51■■□□□ 1.51
RNPS1-226ENST00000570051 TRIM47Q96LD4 638 aa24.51■■□□□ 1.51
RNPS1-226ENST00000570051 MTMR4Q9NYA4 1195 aa24.51■■□□□ 1.51
RNPS1-226ENST00000570051 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
RNPS1-226ENST00000570051 PSMC4P43686 418 aa24.5■■□□□ 1.51
RNPS1-226ENST00000570051 SPICE1Q8N0Z3 855 aa24.5■■□□□ 1.51
RNPS1-226ENST00000570051 PPP4R2Q9NY27 417 aa24.5■■□□□ 1.51
RNPS1-226ENST00000570051 MORF4L1Q9UBU8 362 aa24.5■■□□□ 1.51
RNPS1-226ENST00000570051 PTPN22Q9Y2R2 807 aa24.5■■□□□ 1.51
RNPS1-226ENST00000570051 RLFQ13129 1914 aa24.49■■□□□ 1.51
RNPS1-226ENST00000570051 SGSM2O43147 1006 aa24.49■■□□□ 1.51
RNPS1-226ENST00000570051 GNRH1P01148 92 aa24.49■■□□□ 1.51
RNPS1-226ENST00000570051 POTEEQ6S8J3 1075 aa24.49■■□□□ 1.51
RNPS1-226ENST00000570051 TBC1D10CQ8IV04 446 aa24.49■■□□□ 1.51
RNPS1-226ENST00000570051 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
RNPS1-226ENST00000570051 STAG1Q8WVM7 1258 aa24.49■■□□□ 1.51
RNPS1-226ENST00000570051 GOPCQ9HD26 462 aa24.49■■□□□ 1.51
RNPS1-226ENST00000570051 TSPY2A6NKD2 308 aa24.48■■□□□ 1.51
RNPS1-226ENST00000570051 ZNF213O14771 459 aa24.48■■□□□ 1.51
RNPS1-226ENST00000570051 WDR46O15213 610 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
RNPS1-226ENST00000570051 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
RNPS1-226ENST00000570051 FCGRTP55899 365 aa24.48■■□□□ 1.51
RNPS1-226ENST00000570051 PARP14Q460N5 1801 aa24.48■■□□□ 1.51
RNPS1-226ENST00000570051 AKNAD1Q5T1N1 836 aa24.48■■□□□ 1.51
RNPS1-226ENST00000570051 IFFO2Q5TF58 517 aa24.48■■□□□ 1.51
RNPS1-226ENST00000570051 TXNRD2Q9NNW7 524 aa24.48■■□□□ 1.51
RNPS1-226ENST00000570051 RBPJLQ9UBG7 517 aa24.48■■□□□ 1.51
RNPS1-226ENST00000570051 CLIP2Q9UDT6 1046 aa24.48■■□□□ 1.51
RNPS1-226ENST00000570051 HPS5Q9UPZ3 1129 aa24.48■■□□□ 1.51
RNPS1-226ENST00000570051 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
RNPS1-226ENST00000570051 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
RNPS1-226ENST00000570051 TTLL1O95922 423 aa24.47■■□□□ 1.51
RNPS1-226ENST00000570051 PCP11498 1178 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
RNPS1-226ENST00000570051 LBX2Q6XYB7 198 aa24.47■■□□□ 1.51
RNPS1-226ENST00000570051 MKL1Q969V6 931 aa24.47■■□□□ 1.51
RNPS1-226ENST00000570051 TANGO6Q9C0B7 1094 aa24.47■■□□□ 1.51
RNPS1-226ENST00000570051 TOMM22Q9NS69 142 aa24.47■■□□□ 1.51
RNPS1-226ENST00000570051 CTNNA3Q9UI47 895 aa24.47■■□□□ 1.51
RNPS1-226ENST00000570051 PEX10O60683 326 aa24.46■■□□□ 1.51
RNPS1-226ENST00000570051 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
RNPS1-226ENST00000570051 MFSD6Q6ZSS7 791 aa24.46■■□□□ 1.51
RNPS1-226ENST00000570051 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
RNPS1-226ENST00000570051 IL17RBQ9NRM6 502 aa24.46■■□□□ 1.51
RNPS1-226ENST00000570051 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa24.46■■□□□ 1.51
RNPS1-226ENST00000570051 A0A0G2JMZ2 1700 aa24.46■■□□□ 1.51
RNPS1-226ENST00000570051 PTH1RQ03431 593 aa24.45■■□□□ 1.5
RNPS1-226ENST00000570051 COG2Q14746 738 aa24.45■■□□□ 1.5
RNPS1-226ENST00000570051 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
RNPS1-226ENST00000570051 PAGR1Q9BTK6 254 aa24.45■■□□□ 1.5
RNPS1-226ENST00000570051 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa24.45■■□□□ 1.5
RNPS1-226ENST00000570051 NEDD4P46934 1319 aa24.44■■□□□ 1.5
RNPS1-226ENST00000570051 F5H6K3 240 aa24.44■■□□□ 1.5
RNPS1-226ENST00000570051 RAD21O60216 631 aa24.44■■□□□ 1.5
RNPS1-226ENST00000570051 NMT2O60551 498 aa24.44■■□□□ 1.5
RNPS1-226ENST00000570051 PRMT2P55345 433 aa24.44■■□□□ 1.5
RNPS1-226ENST00000570051 ERVK-9P63128 1117 aa24.44■■□□□ 1.5
RNPS1-226ENST00000570051 ERVK-24P63145 666 aa24.44■■□□□ 1.5
RNPS1-226ENST00000570051 KLRC3Q07444 240 aa24.44■■□□□ 1.5
RNPS1-226ENST00000570051 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa24.44■■□□□ 1.5
RNPS1-226ENST00000570051 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
RNPS1-226ENST00000570051 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa24.44■■□□□ 1.5
RNPS1-226ENST00000570051 SRRDQ9UH36 339 aa24.44■■□□□ 1.5
RNPS1-226ENST00000570051 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa24.44■■□□□ 1.5
RNPS1-226ENST00000570051 DOCK3Q8IZD9 2030 aa24.44■■□□□ 1.5
RNPS1-226ENST00000570051 CNMDO75829 334 aa24.43■■□□□ 1.5
RNPS1-226ENST00000570051 NDUFB10O96000 172 aa24.43■■□□□ 1.5
RNPS1-226ENST00000570051 HOXD10P28358 340 aa24.43■■□□□ 1.5
RNPS1-226ENST00000570051 NOVP48745 357 aa24.43■■□□□ 1.5
RNPS1-226ENST00000570051 FAM83BQ5T0W9 1011 aa24.43■■□□□ 1.5
RNPS1-226ENST00000570051 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa24.43■■□□□ 1.5
RNPS1-226ENST00000570051 NKX2-3Q8TAU0 364 aa24.43■■□□□ 1.5
RNPS1-226ENST00000570051 HOXC10Q9NYD6 342 aa24.43■■□□□ 1.5
RNPS1-226ENST00000570051 STX8Q9UNK0 236 aa24.43■■□□□ 1.5
RNPS1-226ENST00000570051 MYPNQ86TC9 1320 aa24.42■■□□□ 1.5
RNPS1-226ENST00000570051 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
RNPS1-226ENST00000570051 FLOT1O75955 427 aa24.42■■□□□ 1.5
RNPS1-226ENST00000570051 DSG3P32926 999 aa24.42■■□□□ 1.5
RNPS1-226ENST00000570051 PRKCZQ05513 592 aa24.42■■□□□ 1.5
RNPS1-226ENST00000570051 Q3C1V9 767 aa24.42■■□□□ 1.5
RNPS1-226ENST00000570051 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa24.42■■□□□ 1.5
RNPS1-226ENST00000570051 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa24.42■■□□□ 1.5
RNPS1-226ENST00000570051 CAPN15O75808 1086 aa24.41■■□□□ 1.5
RNPS1-226ENST00000570051 ESR2Q92731 530 aa24.41■■□□□ 1.5
RNPS1-226ENST00000570051 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
RNPS1-226ENST00000570051 BTBD7Q9P203 1132 aa24.41■■□□□ 1.5
RNPS1-226ENST00000570051 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
RNPS1-226ENST00000570051 CENPFP49454 3210 aa24.4■■□□□ 1.5
RNPS1-226ENST00000570051 CCDC85CA6NKD9 419 aa24.4■■□□□ 1.5
RNPS1-226ENST00000570051 NT5C2P49902 561 aa24.4■■□□□ 1.5
RNPS1-226ENST00000570051 FBXO28Q9NVF7 368 aa24.4■■□□□ 1.5
RNPS1-226ENST00000570051 GABRQQ9UN88 632 aa24.4■■□□□ 1.5
RNPS1-226ENST00000570051 MAP4K1Q92918 833 aa24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.8 ms