RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569019.5

CENPT-231, Transcript of centromere protein T, human

TSL 4

Gene CENPT, Length 535 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CENPT-231	ENST00000569019	ADARB2	Q9NS39	739 aa	Known RBP	14.73	□□□□□ -0.05
CENPT-231	ENST00000569019	SCAF8	Q9UPN6	1271 aa	Known RBP	14.73	□□□□□ -0.05
CENPT-231	ENST00000569019	MTMR7	Q9Y216	660 aa		14.73	□□□□□ -0.05
CENPT-231	ENST00000569019	SCN4A	P35499	1836 aa		14.73	□□□□□ -0.05
CENPT-231	ENST00000569019	ZC3H4	Q9UPT8	1303 aa	Known RBP	14.72	□□□□□ -0.05
CENPT-231	ENST00000569019	DDX11L8	A8MPP1	907 aa		14.72	□□□□□ -0.05
CENPT-231	ENST00000569019	GOLGA6L22	H0YM25	854 aa		14.72	□□□□□ -0.05
CENPT-231	ENST00000569019	PRPF3	O43395	683 aa	Known RBP	14.72	□□□□□ -0.05
CENPT-231	ENST00000569019	DEXI	O95424	95 aa		14.72	□□□□□ -0.05
CENPT-231	ENST00000569019	ATP2B2	Q01814	1243 aa		14.72	□□□□□ -0.05
CENPT-231	ENST00000569019	SEPT2	Q15019	361 aa		14.72	□□□□□ -0.05
CENPT-231	ENST00000569019	MIGA2	Q7L4E1	593 aa		14.72	□□□□□ -0.05
CENPT-231	ENST00000569019	LRRC47	Q8N1G4	583 aa	Known RBP	14.72	□□□□□ -0.05
CENPT-231	ENST00000569019	TEPSIN	Q96N21	525 aa		14.72	□□□□□ -0.05
CENPT-231	ENST00000569019	DEFB129	Q9H1M3	183 aa		14.72	□□□□□ -0.05
CENPT-231	ENST00000569019	NYAP2	Q9P242	653 aa		14.72	□□□□□ -0.05
CENPT-231	ENST00000569019	MAD2L2	Q9UI95	211 aa		14.72	□□□□□ -0.05
CENPT-231	ENST00000569019	CNTNAP5	Q8WYK1	1306 aa		14.71	□□□□□ -0.05
CENPT-231	ENST00000569019	PALM3	A6NDB9	673 aa	Predicted RBP	14.71	□□□□□ -0.05
CENPT-231	ENST00000569019	GH2	P01242	217 aa		14.71	□□□□□ -0.05
CENPT-231	ENST00000569019	PARP1	P09874	1014 aa	Known RBP	14.71	□□□□□ -0.05
CENPT-231	ENST00000569019	EEF2	P13639	858 aa	Known RBP	14.71	□□□□□ -0.05
CENPT-231	ENST00000569019	GUCY1A2	P33402	732 aa		14.71	□□□□□ -0.05
CENPT-231	ENST00000569019	HIRA	P54198	1017 aa	Predicted RBP	14.71	□□□□□ -0.05
CENPT-231	ENST00000569019	GUCY1B3	Q02153	619 aa		14.71	□□□□□ -0.05
CENPT-231	ENST00000569019	MAP3K10	Q02779	954 aa		14.71	□□□□□ -0.05
CENPT-231	ENST00000569019	ICA1	Q05084	483 aa		14.71	□□□□□ -0.05
CENPT-231	ENST00000569019	FUT2	Q10981	343 aa		14.71	□□□□□ -0.05
CENPT-231	ENST00000569019	TRIM29	Q14134	588 aa		14.71	□□□□□ -0.05
CENPT-231	ENST00000569019	RRP1B	Q14684	758 aa	Known RBP	14.71	□□□□□ -0.05
CENPT-231	ENST00000569019	SHROOM1	Q2M3G4	852 aa	Predicted RBP	14.71	□□□□□ -0.05
CENPT-231	ENST00000569019	MCTP1	Q6DN14	999 aa		14.71	□□□□□ -0.05
CENPT-231	ENST00000569019	FERMT3	Q86UX7	667 aa		14.71	□□□□□ -0.05
CENPT-231	ENST00000569019	SRBD1	Q8N5C6	995 aa	Known RBP	14.71	□□□□□ -0.05
CENPT-231	ENST00000569019	FBXO18	Q8NFZ0	1043 aa		14.71	□□□□□ -0.05
CENPT-231	ENST00000569019	AIFM3	Q96NN9	605 aa		14.71	□□□□□ -0.05
CENPT-231	ENST00000569019	LZTS2	Q9BRK4	669 aa		14.71	□□□□□ -0.05
CENPT-231	ENST00000569019	ZSCAN16	Q9H4T2	348 aa	Predicted RBP	14.71	□□□□□ -0.05
CENPT-231	ENST00000569019	GGA3	Q9NZ52	723 aa		14.71	□□□□□ -0.05
CENPT-231	ENST00000569019	DOCK1	Q14185	1865 aa		14.7	□□□□□ -0.06
CENPT-231	ENST00000569019	PTMS	P20962	102 aa		14.7	□□□□□ -0.06
CENPT-231	ENST00000569019	FOXD4L6	Q3SYB3	417 aa	Predicted RBP	14.7	□□□□□ -0.06
CENPT-231	ENST00000569019	OTUD7B	Q6GQQ9	843 aa		14.7	□□□□□ -0.06
CENPT-231	ENST00000569019	FOXD4L3	Q6VB84	417 aa	Predicted RBP	14.7	□□□□□ -0.06
CENPT-231	ENST00000569019	STAG2	Q8N3U4	1231 aa		14.7	□□□□□ -0.06
CENPT-231	ENST00000569019	MKL1	Q969V6	931 aa		14.7	□□□□□ -0.06
CENPT-231	ENST00000569019	L3MBTL3	Q96JM7	780 aa	Predicted RBP	14.7	□□□□□ -0.06
CENPT-231	ENST00000569019	RBM27	Q9P2N5	1060 aa	Known RBP	14.7	□□□□□ -0.06
CENPT-231	ENST00000569019		V9GY48	417 aa	Predicted RBP	14.7	□□□□□ -0.06
CENPT-231	ENST00000569019	PITPNM2	Q9BZ72	1349 aa		14.69	□□□□□ -0.06
CENPT-231	ENST00000569019	USP17L5	A8MUK1	530 aa		14.69	□□□□□ -0.06
CENPT-231	ENST00000569019	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		14.69	□□□□□ -0.06
CENPT-231	ENST00000569019	PDHB	P11177	359 aa		14.69	□□□□□ -0.06
CENPT-231	ENST00000569019	JAG1	P78504	1218 aa		14.69	□□□□□ -0.06
CENPT-231	ENST00000569019	REST	Q13127	1097 aa		14.69	□□□□□ -0.06
CENPT-231	ENST00000569019	ASPRV1	Q53RT3	343 aa		14.69	□□□□□ -0.06
CENPT-231	ENST00000569019	KRT40	Q6A162	431 aa		14.69	□□□□□ -0.06
CENPT-231	ENST00000569019	USP17L2	Q6R6M4	530 aa		14.69	□□□□□ -0.06
CENPT-231	ENST00000569019	HOOK2	Q96ED9	719 aa		14.69	□□□□□ -0.06
CENPT-231	ENST00000569019	CHAMP1	Q96JM3	812 aa		14.69	□□□□□ -0.06
CENPT-231	ENST00000569019	ZBTB21	Q9ULJ3	1066 aa		14.69	□□□□□ -0.06
CENPT-231	ENST00000569019	PPP2R3B	Q9Y5P8	575 aa		14.69	□□□□□ -0.06
CENPT-231	ENST00000569019	GLTPD2	A6NH11	291 aa		14.68	□□□□□ -0.06
CENPT-231	ENST00000569019	KLRF2	D3W0D1	207 aa		14.68	□□□□□ -0.06
CENPT-231	ENST00000569019	GOLGA8H	P0CJ92	632 aa		14.68	□□□□□ -0.06
CENPT-231	ENST00000569019	SNHG28	P0DPA3	235 aa		14.68	□□□□□ -0.06
CENPT-231	ENST00000569019	XBP1	P17861	261 aa		14.68	□□□□□ -0.06
CENPT-231	ENST00000569019	CAP2	P40123	477 aa		14.68	□□□□□ -0.06
CENPT-231	ENST00000569019	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	14.68	□□□□□ -0.06
CENPT-231	ENST00000569019	DCAF15	Q66K64	600 aa		14.68	□□□□□ -0.06
CENPT-231	ENST00000569019	RASGRP2	Q7LDG7	609 aa		14.68	□□□□□ -0.06
CENPT-231	ENST00000569019	ARHGEF10L	Q9HCE6	1279 aa		14.68	□□□□□ -0.06
CENPT-231	ENST00000569019	GJB4	Q9NTQ9	266 aa		14.68	□□□□□ -0.06
CENPT-231	ENST00000569019	FRMPD2	Q68DX3	1309 aa	Predicted RBP	14.67	□□□□□ -0.06
CENPT-231	ENST00000569019	WDR90	Q96KV7	1748 aa		14.67	□□□□□ -0.06
CENPT-231	ENST00000569019	hCG_1642624	A0A1W2PR95	340 aa		14.67	□□□□□ -0.06
CENPT-231	ENST00000569019	NCL	P19338	710 aa	Known RBP	14.67	□□□□□ -0.06
CENPT-231	ENST00000569019	SMARCA1	P28370	1054 aa		14.67	□□□□□ -0.06
CENPT-231	ENST00000569019	PKN1	Q16512	942 aa		14.67	□□□□□ -0.06
CENPT-231	ENST00000569019	SIAH1	Q8IUQ4	282 aa		14.67	□□□□□ -0.06
CENPT-231	ENST00000569019	DCAF4	Q8WV16	495 aa		14.67	□□□□□ -0.06
CENPT-231	ENST00000569019	DCPS	Q96C86	337 aa	Known RBP	14.67	□□□□□ -0.06
CENPT-231	ENST00000569019	SPZ1	Q9BXG8	430 aa		14.67	□□□□□ -0.06
CENPT-231	ENST00000569019	SYNPO2	Q9UMS6	1093 aa		14.67	□□□□□ -0.06
CENPT-231	ENST00000569019	PHF20L1	A8MW92	1017 aa		14.66	□□□□□ -0.06
CENPT-231	ENST00000569019	ASNS	P08243	561 aa		14.66	□□□□□ -0.06
CENPT-231	ENST00000569019	SCG2	P13521	617 aa		14.66	□□□□□ -0.06
CENPT-231	ENST00000569019	DNM1	Q05193	864 aa	Known RBP	14.66	□□□□□ -0.06
CENPT-231	ENST00000569019	ZNF543	Q08ER8	600 aa		14.66	□□□□□ -0.06
CENPT-231	ENST00000569019	PFKFB3	Q16875	520 aa	Predicted RBP	14.66	□□□□□ -0.06
CENPT-231	ENST00000569019	CCDC96	Q2M329	555 aa		14.66	□□□□□ -0.06
CENPT-231	ENST00000569019	GPATCH4	Q5T3I0	446 aa	Known RBP	14.66	□□□□□ -0.06
CENPT-231	ENST00000569019	SLFN13	Q68D06	897 aa		14.66	□□□□□ -0.06
CENPT-231	ENST00000569019	USP50	Q70EL3	339 aa	Predicted RBP	14.66	□□□□□ -0.06
CENPT-231	ENST00000569019	GMCL1P1	Q8NEA9	526 aa		14.66	□□□□□ -0.06
CENPT-231	ENST00000569019	PIBF1	Q8WXW3	757 aa		14.66	□□□□□ -0.06
CENPT-231	ENST00000569019	ZNF341	Q9BYN7	854 aa		14.66	□□□□□ -0.06
CENPT-231	ENST00000569019	GPCPD1	Q9NPB8	672 aa		14.66	□□□□□ -0.06
CENPT-231	ENST00000569019	GINM1	Q9NU53	330 aa		14.66	□□□□□ -0.06
CENPT-231	ENST00000569019	CNPY2	Q9Y2B0	182 aa		14.66	□□□□□ -0.06

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.2 ms