RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567642.1

PPP4C-211, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

TSL 2

Gene PPP4C, Length 658 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4C-211ENST00000567642 LBX2Q6XYB7 198 aa25.14■■□□□ 1.62
PPP4C-211ENST00000567642 APPBP2Q92624 585 aa25.14■■□□□ 1.62
PPP4C-211ENST00000567642 USP6NLQ92738 828 aa25.14■■□□□ 1.62
PPP4C-211ENST00000567642 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
PPP4C-211ENST00000567642 SH2D4AQ9H788 454 aa25.14■■□□□ 1.62
PPP4C-211ENST00000567642 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
PPP4C-211ENST00000567642 SPICE1Q8N0Z3 855 aa25.13■■□□□ 1.61
PPP4C-211ENST00000567642 STK11IPQ8N1F8 1099 aa25.13■■□□□ 1.61
PPP4C-211ENST00000567642 OSBP2Q969R2 916 aa25.13■■□□□ 1.61
PPP4C-211ENST00000567642 APBA2Q99767 749 aa25.13■■□□□ 1.61
PPP4C-211ENST00000567642 HOXC10Q9NYD6 342 aa25.13■■□□□ 1.61
PPP4C-211ENST00000567642 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa25.13■■□□□ 1.61
PPP4C-211ENST00000567642 PARP14Q460N5 1801 aa25.13■■□□□ 1.61
PPP4C-211ENST00000567642 CEP290O15078 2479 aa25.12■■□□□ 1.61
PPP4C-211ENST00000567642 ERC2O15083 957 aa25.12■■□□□ 1.61
PPP4C-211ENST00000567642 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
PPP4C-211ENST00000567642 MAP2K5Q13163 448 aa25.12■■□□□ 1.61
PPP4C-211ENST00000567642 CCL14Q16627 93 aa25.12■■□□□ 1.61
PPP4C-211ENST00000567642 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa25.12■■□□□ 1.61
PPP4C-211ENST00000567642 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
PPP4C-211ENST00000567642 SIAH1Q8IUQ4 282 aa25.12■■□□□ 1.61
PPP4C-211ENST00000567642 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
PPP4C-211ENST00000567642 CRBNQ96SW2 442 aa25.12■■□□□ 1.61
PPP4C-211ENST00000567642 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
PPP4C-211ENST00000567642 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
PPP4C-211ENST00000567642 TMX2Q9Y320 296 aa25.12■■□□□ 1.61
PPP4C-211ENST00000567642 ALPK3Q96L96 1907 aa25.12■■□□□ 1.61
PPP4C-211ENST00000567642 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
PPP4C-211ENST00000567642 TTC41PQ6P2S7 1318 aa25.12■■□□□ 1.61
PPP4C-211ENST00000567642 MINDY4BA8MYZ0 360 aa25.11■■□□□ 1.61
PPP4C-211ENST00000567642 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
PPP4C-211ENST00000567642 LPAR1Q92633 364 aa25.11■■□□□ 1.61
PPP4C-211ENST00000567642 VCPKMTQ9H867 229 aa25.11■■□□□ 1.61
PPP4C-211ENST00000567642 A0A0G2JMZ2 1700 aa25.1■■□□□ 1.61
PPP4C-211ENST00000567642 SLC15A5A6NIM6 579 aa25.1■■□□□ 1.61
PPP4C-211ENST00000567642 GSG1L2A8MUP6 293 aa25.1■■□□□ 1.61
PPP4C-211ENST00000567642 EEF2P13639 858 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
PPP4C-211ENST00000567642 PTPREP23469 700 aa25.1■■□□□ 1.61
PPP4C-211ENST00000567642 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
PPP4C-211ENST00000567642 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa25.1■■□□□ 1.61
PPP4C-211ENST00000567642 NECAB2Q7Z6G3 386 aa25.1■■□□□ 1.61
PPP4C-211ENST00000567642 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
PPP4C-211ENST00000567642 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
PPP4C-211ENST00000567642 NR2E3Q9Y5X4 410 aa25.1■■□□□ 1.61
PPP4C-211ENST00000567642 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
PPP4C-211ENST00000567642 MYH4Q9Y623 1939 aa25.1■■□□□ 1.61
PPP4C-211ENST00000567642 GPAA1O43292 621 aa25.09■■□□□ 1.61
PPP4C-211ENST00000567642 RAD21O60216 631 aa25.09■■□□□ 1.61
PPP4C-211ENST00000567642 FLOT1O75955 427 aa25.09■■□□□ 1.61
PPP4C-211ENST00000567642 APPP05067 770 aa25.09■■□□□ 1.61
PPP4C-211ENST00000567642 SBK1Q52WX2 424 aa25.09■■□□□ 1.61
PPP4C-211ENST00000567642 GIMAP6Q6P9H5 292 aa25.09■■□□□ 1.61
PPP4C-211ENST00000567642 ANKLE1Q8NAG6 615 aa25.09■■□□□ 1.61
PPP4C-211ENST00000567642 KANSL2Q9H9L4 492 aa25.09■■□□□ 1.61
PPP4C-211ENST00000567642 MKNK2Q9HBH9 465 aa25.09■■□□□ 1.61
PPP4C-211ENST00000567642 M0R2C6 588 aa25.08■■□□□ 1.61
PPP4C-211ENST00000567642 EVI5O60447 810 aa25.08■■□□□ 1.61
PPP4C-211ENST00000567642 DSG3P32926 999 aa25.08■■□□□ 1.61
PPP4C-211ENST00000567642 TDO2P48775 406 aa25.08■■□□□ 1.61
PPP4C-211ENST00000567642 PLS1Q14651 629 aa25.08■■□□□ 1.61
PPP4C-211ENST00000567642 FSD1Q9BTV5 496 aa25.08■■□□□ 1.61
PPP4C-211ENST00000567642 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.6
PPP4C-211ENST00000567642 FRMPD3Q5JV73 1810 aa25.07■■□□□ 1.6
PPP4C-211ENST00000567642 WDR46O15213 610 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
PPP4C-211ENST00000567642 GNAT2P19087 354 aa25.07■■□□□ 1.6
PPP4C-211ENST00000567642 PI4K2BQ8TCG2 481 aa25.07■■□□□ 1.6
PPP4C-211ENST00000567642 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
PPP4C-211ENST00000567642 SPATC1LQ9H0A9 340 aa25.07■■□□□ 1.6
PPP4C-211ENST00000567642 MX1P20591 662 aa25.06■■□□□ 1.6
PPP4C-211ENST00000567642 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
PPP4C-211ENST00000567642 GRB14Q14449 540 aa25.06■■□□□ 1.6
PPP4C-211ENST00000567642 ANKRD45Q5TZF3 282 aa25.06■■□□□ 1.6
PPP4C-211ENST00000567642 MFSD14CQ5VZR4 134 aa25.06■■□□□ 1.6
PPP4C-211ENST00000567642 CHRDL2Q6WN34 429 aa25.06■■□□□ 1.6
PPP4C-211ENST00000567642 MB21D1Q8N884 522 aa25.06■■□□□ 1.6
PPP4C-211ENST00000567642 ATG4CQ96DT6 458 aa25.06■■□□□ 1.6
PPP4C-211ENST00000567642 GOPCQ9HD26 462 aa25.06■■□□□ 1.6
PPP4C-211ENST00000567642 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
PPP4C-211ENST00000567642 NBPF3Q9H094 633 aa25.05■■□□□ 1.6
PPP4C-211ENST00000567642 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
PPP4C-211ENST00000567642 FLRT1Q9NZU1 646 aa25.05■■□□□ 1.6
PPP4C-211ENST00000567642 OGDHLQ9ULD0 1010 aa25.05■■□□□ 1.6
PPP4C-211ENST00000567642 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
PPP4C-211ENST00000567642 ERCC3P19447 782 aa25.04■■□□□ 1.6
PPP4C-211ENST00000567642 RASA1P20936 1047 aa25.04■■□□□ 1.6
PPP4C-211ENST00000567642 DPP9Q86TI2 863 aa25.04■■□□□ 1.6
PPP4C-211ENST00000567642 NPLOC4Q8TAT6 608 aa25.04■■□□□ 1.6
PPP4C-211ENST00000567642 ZNF236Q9UL36 1845 aa25.03■■□□□ 1.6
PPP4C-211ENST00000567642 NCAPG2Q86XI2 1143 aa25.03■■□□□ 1.6
PPP4C-211ENST00000567642 SHCBP1Q8NEM2 672 aa25.03■■□□□ 1.6
PPP4C-211ENST00000567642 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP25.03■■□□□ 1.6
PPP4C-211ENST00000567642 NACAP1Q9BZK3 213 aa25.03■■□□□ 1.6
PPP4C-211ENST00000567642 C11orf49Q9H6J7 331 aa25.03■■□□□ 1.6
PPP4C-211ENST00000567642 ROBO3Q96MS0 1386 aa25.03■■□□□ 1.6
PPP4C-211ENST00000567642 STRNO43815 780 aa25.02■■□□□ 1.6
PPP4C-211ENST00000567642 HOXC6P09630 235 aa25.02■■□□□ 1.6
PPP4C-211ENST00000567642 ADORA2AP29274 412 aa25.02■■□□□ 1.6
PPP4C-211ENST00000567642 CNGA1P29973 690 aa25.02■■□□□ 1.6
PPP4C-211ENST00000567642 IFNL3Q8IZI9 196 aa25.02■■□□□ 1.6
PPP4C-211ENST00000567642 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
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