RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566452.1

BBS2-215, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 2, human

TSL 2

Gene BBS2, Length 299 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS2-215	ENST00000566452	PDZRN4	Q6ZMN7	1036 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	EXOC8	Q8IYI6	725 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	ZBTB38	Q8NAP3	1195 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	MORC4	Q8TE76	937 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	ANTXR1	Q9H6X2	564 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	CACNA2D2	Q9NY47	1150 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	SHROOM2	Q13796	1616 aa		4.96	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	IRS4	O14654	1257 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	PRC1	O43663	620 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	PDE8A	O60658	829 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	NAT2	P11245	290 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	TBC1D8B	Q0IIM8	1120 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	PABPC4	Q13310	644 aa	Known RBP eCLIP	4.95	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	BRDT	Q58F21	947 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	WWC2	Q6AWC2	1192 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	UNC5A	Q6ZN44	842 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	ILDR2	Q71H61	639 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	NLRC3	Q7RTR2	1065 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	JAML	Q86YT9	394 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	C8orf48	Q96LL4	319 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	IGFLR1	Q9H665	355 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	SOX17	Q9H6I2	414 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	GABBR1	Q9UBS5	961 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	TACC3	Q9Y6A5	838 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	EID1	Q9Y6B2	187 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	SNCAIP	Q9Y6H5	919 aa		4.95	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452		A0A087X0B3	334 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	TNFRSF10C	O14798	259 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	PEX14	O75381	377 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	NME1	P15531	152 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	ZNF143	P52747	638 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	EPHB1	P54762	984 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	PDE4B	Q07343	736 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	FNDC3B	Q53EP0	1204 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	CCSAP	Q6IQ19	270 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	HDX	Q7Z353	690 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	RNF180	Q86T96	592 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	FAM35A	Q86V20	835 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	DDX42	Q86XP3	938 aa	Known RBP eCLIP	4.94	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	CACTIN-AS1	Q8N1I8	211 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	POU5F2	Q8N7G0	328 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	WFDC12	Q8WWY7	111 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	KIF2C	Q99661	725 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	RUSC1	Q9BVN2	902 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	NCOA5	Q9HCD5	579 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	KRT82	Q9NSB4	513 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	REV1	Q9UBZ9	1251 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	PCDHA4	Q9UN74	947 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	MAPRE3	Q9UPY8	281 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	GRIN2A	Q12879	1464 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	MAPKBP1	O60336	1514 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452		H3BRJ5	948 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	GFRA2	O00451	464 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	PLD2	O14939	933 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	LILRB5	O75023	590 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	ACR	P10323	421 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	CPB1	P15086	417 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	CPE	P16870	476 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	PLCG1	P19174	1290 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	POU3F3	P20264	500 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	IREB2	P48200	963 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	NFKB2	Q00653	900 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	SLC7A5	Q01650	507 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	ZYX	Q15942	572 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	C21orf62-AS1	Q17RA5	79 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	BBS9	Q3SYG4	887 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	CDCP2	Q5VXM1	449 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	KIAA1211L	Q6NV74	962 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	ELMSAN1	Q6PJG2	1045 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	C20orf204	Q6ZNR8	217 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	GPBAR1	Q8TDU6	330 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	TNFRSF25	Q93038	417 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	ATG4C	Q96DT6	458 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	PLPPR2	Q96GM1	343 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	IPO9	Q96P70	1041 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	LACRT	Q9GZZ8	138 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	SMG9	Q9H0W8	520 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	CNNM2	Q9H8M5	875 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	FRRS1L	Q9P0K9	344 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	LTBP3	Q9NS15	1303 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	CUX1	P39880	1505 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	ADAMTS12	P58397	1594 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	SLC22A31	A6NKX4	558 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	KRTAP9-7	A8MTY7	169 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	GSG1L2	A8MUP6	293 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	ADAMTS4	O75173	837 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	EIF3J	O75822	258 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	CYP11A1	P05108	521 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	CDC27	P30260	824 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	EVA1C	P58658	441 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	TMEM201	Q5SNT2	666 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	LRFN4	Q6PJG9	635 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS2-215	ENST00000566452	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		4.92	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.3 ms