RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564966.5

PPP4C-208, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

TSL 2

Gene PPP4C, Length 1,122 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4C-208ENST00000564966 COG2Q14746 738 aa30.42■■■□□ 2.46
PPP4C-208ENST00000564966 CCL14Q16627 93 aa30.42■■■□□ 2.46
PPP4C-208ENST00000564966 MORN1Q5T089 497 aa30.42■■■□□ 2.46
PPP4C-208ENST00000564966 CHRDL2Q6WN34 429 aa30.42■■■□□ 2.46
PPP4C-208ENST00000564966 SPICE1Q8N0Z3 855 aa30.42■■■□□ 2.46
PPP4C-208ENST00000564966 STK11IPQ8N1F8 1099 aa30.42■■■□□ 2.46
PPP4C-208ENST00000564966 KBTBD3Q8NAB2 608 aa30.42■■■□□ 2.46
PPP4C-208ENST00000564966 CCDC17Q96LX7 622 aa30.42■■■□□ 2.46
PPP4C-208ENST00000564966 HOXC10Q9NYD6 342 aa30.42■■■□□ 2.46
PPP4C-208ENST00000564966 MAP2K5Q13163 448 aa30.41■■■□□ 2.46
PPP4C-208ENST00000564966 CTR9Q6PD62 1173 aa30.41■■■□□ 2.46
PPP4C-208ENST00000564966 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP30.41■■■□□ 2.46
PPP4C-208ENST00000564966 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP30.41■■■□□ 2.46
PPP4C-208ENST00000564966 C16orf86Q6ZW13 317 aa30.4■■■□□ 2.46
PPP4C-208ENST00000564966 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP30.4■■■□□ 2.46
PPP4C-208ENST00000564966 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP30.39■■■□□ 2.46
PPP4C-208ENST00000564966 FLOT1O75955 427 aa30.39■■■□□ 2.46
PPP4C-208ENST00000564966 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP30.39■■■□□ 2.46
PPP4C-208ENST00000564966 PLS1Q14651 629 aa30.39■■■□□ 2.46
PPP4C-208ENST00000564966 LBX2Q6XYB7 198 aa30.39■■■□□ 2.46
PPP4C-208ENST00000564966 ANKLE1Q8NAG6 615 aa30.39■■■□□ 2.46
PPP4C-208ENST00000564966 LPAR1Q92633 364 aa30.39■■■□□ 2.46
PPP4C-208ENST00000564966 USP6NLQ92738 828 aa30.39■■■□□ 2.46
PPP4C-208ENST00000564966 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP30.39■■■□□ 2.46
PPP4C-208ENST00000564966 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa30.39■■■□□ 2.46
PPP4C-208ENST00000564966 SLC15A5A6NIM6 579 aa30.38■■■□□ 2.45
PPP4C-208ENST00000564966 MINDY4BA8MYZ0 360 aa30.38■■■□□ 2.45
PPP4C-208ENST00000564966 RRP1P56182 461 aaKnown RBP30.38■■■□□ 2.45
PPP4C-208ENST00000564966 APPBP2Q92624 585 aa30.38■■■□□ 2.45
PPP4C-208ENST00000564966 ERC2O15083 957 aa30.37■■■□□ 2.45
PPP4C-208ENST00000564966 APPP05067 770 aa30.37■■■□□ 2.45
PPP4C-208ENST00000564966 PTPREP23469 700 aa30.37■■■□□ 2.45
PPP4C-208ENST00000564966 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP30.37■■■□□ 2.45
PPP4C-208ENST00000564966 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa30.37■■■□□ 2.45
PPP4C-208ENST00000564966 MFSD14CQ5VZR4 134 aa30.37■■■□□ 2.45
PPP4C-208ENST00000564966 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP30.37■■■□□ 2.45
PPP4C-208ENST00000564966 VCPKMTQ9H867 229 aa30.37■■■□□ 2.45
PPP4C-208ENST00000564966 TMX2Q9Y320 296 aa30.37■■■□□ 2.45
PPP4C-208ENST00000564966 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP30.36■■■□□ 2.45
PPP4C-208ENST00000564966 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa30.36■■■□□ 2.45
PPP4C-208ENST00000564966 OSBP2Q969R2 916 aa30.36■■■□□ 2.45
PPP4C-208ENST00000564966 NBPF3Q9H094 633 aa30.36■■■□□ 2.45
PPP4C-208ENST00000564966 MKNK2Q9HBH9 465 aa30.36■■■□□ 2.45
PPP4C-208ENST00000564966 EEF2P13639 858 aaKnown RBP30.35■■■□□ 2.45
PPP4C-208ENST00000564966 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP30.35■■■□□ 2.45
PPP4C-208ENST00000564966 TDO2P48775 406 aa30.35■■■□□ 2.45
PPP4C-208ENST00000564966 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP30.35■■■□□ 2.45
PPP4C-208ENST00000564966 KANSL2Q9H9L4 492 aa30.35■■■□□ 2.45
PPP4C-208ENST00000564966 GPAA1O43292 621 aa30.34■■■□□ 2.45
PPP4C-208ENST00000564966 DPP9Q86TI2 863 aa30.34■■■□□ 2.45
PPP4C-208ENST00000564966 SIAH1Q8IUQ4 282 aa30.34■■■□□ 2.45
PPP4C-208ENST00000564966 SPATC1LQ9H0A9 340 aa30.34■■■□□ 2.45
PPP4C-208ENST00000564966 C11orf49Q9H6J7 331 aa30.34■■■□□ 2.45
PPP4C-208ENST00000564966 TTC41PQ6P2S7 1318 aa30.33■■■□□ 2.45
PPP4C-208ENST00000564966 WDR46O15213 610 aaKnown RBP30.33■■■□□ 2.45
PPP4C-208ENST00000564966 CNGA1P29973 690 aa30.33■■■□□ 2.45
PPP4C-208ENST00000564966 DSG3P32926 999 aa30.33■■■□□ 2.45
PPP4C-208ENST00000564966 MB21D1Q8N884 522 aa30.33■■■□□ 2.45
PPP4C-208ENST00000564966 ATG4CQ96DT6 458 aa30.33■■■□□ 2.45
PPP4C-208ENST00000564966 FSD1Q9BTV5 496 aa30.33■■■□□ 2.45
PPP4C-208ENST00000564966 GOPCQ9HD26 462 aa30.33■■■□□ 2.45
PPP4C-208ENST00000564966 OGDHLQ9ULD0 1010 aa30.33■■■□□ 2.45
PPP4C-208ENST00000564966 GSG1L2A8MUP6 293 aa30.32■■■□□ 2.44
PPP4C-208ENST00000564966 GNAT2P19087 354 aa30.32■■■□□ 2.44
PPP4C-208ENST00000564966 GRB14Q14449 540 aa30.32■■■□□ 2.44
PPP4C-208ENST00000564966 NCAPG2Q86XI2 1143 aa30.32■■■□□ 2.44
PPP4C-208ENST00000564966 C7orf61Q8IZ16 206 aa30.32■■■□□ 2.44
PPP4C-208ENST00000564966 M0R2C6 588 aa30.31■■■□□ 2.44
PPP4C-208ENST00000564966 ERCC3P19447 782 aa30.31■■■□□ 2.44
PPP4C-208ENST00000564966 GIMAP6Q6P9H5 292 aa30.31■■■□□ 2.44
PPP4C-208ENST00000564966 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP30.31■■■□□ 2.44
PPP4C-208ENST00000564966 CRBNQ96SW2 442 aa30.31■■■□□ 2.44
PPP4C-208ENST00000564966 FLRT1Q9NZU1 646 aa30.31■■■□□ 2.44
PPP4C-208ENST00000564966 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP30.3■■■□□ 2.44
PPP4C-208ENST00000564966 SBK1Q52WX2 424 aa30.3■■■□□ 2.44
PPP4C-208ENST00000564966 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP30.3■■■□□ 2.44
PPP4C-208ENST00000564966 MX1P20591 662 aa30.29■■■□□ 2.44
PPP4C-208ENST00000564966 ADORA2AP29274 412 aa30.29■■■□□ 2.44
PPP4C-208ENST00000564966 NPLOC4Q8TAT6 608 aa30.29■■■□□ 2.44
PPP4C-208ENST00000564966 STRNO43815 780 aa30.28■■■□□ 2.44
PPP4C-208ENST00000564966 CYP2C19P33261 490 aa30.28■■■□□ 2.44
PPP4C-208ENST00000564966 ANKRD45Q5TZF3 282 aa30.28■■■□□ 2.44
PPP4C-208ENST00000564966 SHCBP1Q8NEM2 672 aa30.28■■■□□ 2.44
PPP4C-208ENST00000564966 NACAP1Q9BZK3 213 aa30.28■■■□□ 2.44
PPP4C-208ENST00000564966 PCDH10Q9P2E7 1040 aa30.28■■■□□ 2.44
PPP4C-208ENST00000564966 RASA1P20936 1047 aa30.27■■■□□ 2.44
PPP4C-208ENST00000564966 FAM83BQ5T0W9 1011 aa30.27■■■□□ 2.44
PPP4C-208ENST00000564966 PI4K2BQ8TCG2 481 aa30.27■■■□□ 2.44
PPP4C-208ENST00000564966 MROH8Q9H579 483 aa30.27■■■□□ 2.44
PPP4C-208ENST00000564966 ZNF287Q9HBT7 754 aa30.27■■■□□ 2.44
PPP4C-208ENST00000564966 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP30.27■■■□□ 2.44
PPP4C-208ENST00000564966 SLC5A4Q9NY91 659 aa30.27■■■□□ 2.44
PPP4C-208ENST00000564966 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa30.26■■■□□ 2.43
PPP4C-208ENST00000564966 PRDM1O75626 825 aa30.26■■■□□ 2.43
PPP4C-208ENST00000564966 HOXC6P09630 235 aa30.26■■■□□ 2.43
PPP4C-208ENST00000564966 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP30.26■■■□□ 2.43
PPP4C-208ENST00000564966 FBXO28Q9NVF7 368 aa30.26■■■□□ 2.43
PPP4C-208ENST00000564966 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP30.25■■■□□ 2.43
PPP4C-208ENST00000564966 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP30.25■■■□□ 2.43
PPP4C-208ENST00000564966 LHX8Q68G74 356 aa30.25■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.3 ms