RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564649.1

TMEM208-209, Transcript of transmembrane protein 208, human

TSL 2

Gene TMEM208, Length 514 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMEM208-209	ENST00000564649	CWC22	Q9HCG8	908 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
TMEM208-209	ENST00000564649	NYAP2	Q9P242	653 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TMEM208-209	ENST00000564649	HPS5	Q9UPZ3	1129 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TMEM208-209	ENST00000564649	SMC3	Q9UQE7	1217 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TMEM208-209	ENST00000564649	CCDC196	A0A1B0GTZ2	297 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TMEM208-209	ENST00000564649	CCDC85C	A6NKD9	419 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TMEM208-209	ENST00000564649	PHF20L1	A8MW92	1017 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TMEM208-209	ENST00000564649	CTNND1	O60716	968 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TMEM208-209	ENST00000564649	ASNS	P08243	561 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TMEM208-209	ENST00000564649	NOV	P48745	357 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TMEM208-209	ENST00000564649	ICA1	Q05084	483 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TMEM208-209	ENST00000564649	ST3GAL1	Q11201	340 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TMEM208-209	ENST00000564649	FANCB	Q8NB91	859 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TMEM208-209	ENST00000564649	CTCFL	Q8NI51	663 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TMEM208-209	ENST00000564649	LLPH	Q9BRT6	129 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TMEM208-209	ENST00000564649	NCOA5	Q9HCD5	579 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TMEM208-209	ENST00000564649	GINM1	Q9NU53	330 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TMEM208-209	ENST00000564649	ZBTB21	Q9ULJ3	1066 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TMEM208-209	ENST00000564649	ABT1	Q9ULW3	272 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TMEM208-209	ENST00000564649	GREB1L	Q9C091	1923 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
TMEM208-209	ENST00000564649	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
TMEM208-209	ENST00000564649	CDKL5	O76039	1030 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TMEM208-209	ENST00000564649	EEF2	P13639	858 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
TMEM208-209	ENST00000564649	KIF5B	P33176	963 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TMEM208-209	ENST00000564649	GUCY1A2	P33402	732 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TMEM208-209	ENST00000564649	SHROOM1	Q2M3G4	852 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
TMEM208-209	ENST00000564649	CLEC10A	Q8IUN9	316 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TMEM208-209	ENST00000564649	CDCA5	Q96FF9	252 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TMEM208-209	ENST00000564649	CAPNS2	Q96L46	248 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TMEM208-209	ENST00000564649	GLIS2	Q9BZE0	524 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
TMEM208-209	ENST00000564649	ARHGEF10L	Q9HCE6	1279 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TMEM208-209	ENST00000564649	RBM28	Q9NW13	759 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
TMEM208-209	ENST00000564649	ZNF112	Q9UJU3	913 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TMEM208-209	ENST00000564649	MTMR7	Q9Y216	660 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TMEM208-209	ENST00000564649	TRPM7	Q96QT4	1865 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TMEM208-209	ENST00000564649	NID2	Q14112	1375 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TMEM208-209	ENST00000564649	ADD1	P35611	737 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
TMEM208-209	ENST00000564649	JAG1	P78504	1218 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TMEM208-209	ENST00000564649	TROAP	Q12815	778 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TMEM208-209	ENST00000564649	PRKG1	Q13976	671 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TMEM208-209	ENST00000564649	DLK2	Q6UY11	383 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TMEM208-209	ENST00000564649	LRRC47	Q8N1G4	583 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
TMEM208-209	ENST00000564649	MKL1	Q969V6	931 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TMEM208-209	ENST00000564649	WRNIP1	Q96S55	665 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TMEM208-209	ENST00000564649	MAP3K14	Q99558	947 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TMEM208-209	ENST00000564649	MYH4	Q9Y623	1939 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TMEM208-209	ENST00000564649	CASP8AP2	Q9UKL3	1982 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TMEM208-209	ENST00000564649	GJB2	P29033	226 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TMEM208-209	ENST00000564649	CDC27	P30260	824 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TMEM208-209	ENST00000564649	INPP5B	P32019	993 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TMEM208-209	ENST00000564649	IREB2	P48200	963 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
TMEM208-209	ENST00000564649	GNAQ	P50148	359 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TMEM208-209	ENST00000564649	HMGN5	P82970	282 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
TMEM208-209	ENST00000564649	FMR1	Q06787	632 aa	Known RBP eCLIP	13.71	□□□□□ -0.21
TMEM208-209	ENST00000564649	TTLL12	Q14166	644 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
TMEM208-209	ENST00000564649	GRM4	Q14833	912 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TMEM208-209	ENST00000564649	SCYL3	Q8IZE3	742 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TMEM208-209	ENST00000564649	FAM184A	Q8NB25	1140 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TMEM208-209	ENST00000564649	NSUN7	Q8NE18	718 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
TMEM208-209	ENST00000564649	PICK1	Q9NRD5	415 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TMEM208-209	ENST00000564649	FAM217B	Q9NTX9	383 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
TMEM208-209	ENST00000564649	ATAD5	Q96QE3	1844 aa		13.71	□□□□□ -0.22
TMEM208-209	ENST00000564649	PTPDC1	A2A3K4	754 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TMEM208-209	ENST00000564649	RAD21	O60216	631 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TMEM208-209	ENST00000564649	USP2	O75604	605 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
TMEM208-209	ENST00000564649	CTDNEP1	O95476	244 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TMEM208-209	ENST00000564649	PARP1	P09874	1014 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
TMEM208-209	ENST00000564649	ECE1	P42892	770 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TMEM208-209	ENST00000564649	MAP3K9	P80192	1104 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TMEM208-209	ENST00000564649	SSRP1	Q08945	709 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
TMEM208-209	ENST00000564649	CST9	Q5W186	159 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TMEM208-209	ENST00000564649	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TMEM208-209	ENST00000564649	SIAH1	Q8IUQ4	282 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TMEM208-209	ENST00000564649	SMARCC2	Q8TAQ2	1214 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TMEM208-209	ENST00000564649	DDX11	Q96FC9	970 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TMEM208-209	ENST00000564649	SH2D4A	Q9H788	454 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TMEM208-209	ENST00000564649	SYNPO2	Q9UMS6	1093 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TMEM208-209	ENST00000564649	FZD1	Q9UP38	647 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TMEM208-209	ENST00000564649	KIF3A	Q9Y496	699 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TMEM208-209	ENST00000564649	SSC5D	A1L4H1	1573 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TMEM208-209	ENST00000564649	USP17L5	A8MUK1	530 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TMEM208-209	ENST00000564649	JAK2	O60674	1132 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TMEM208-209	ENST00000564649	DTNB	O60941	627 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TMEM208-209	ENST00000564649	PDHB	P11177	359 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TMEM208-209	ENST00000564649	IFNAR1	P17181	557 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TMEM208-209	ENST00000564649	SLFN13	Q68D06	897 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TMEM208-209	ENST00000564649	TRIM22	Q8IYM9	498 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TMEM208-209	ENST00000564649	DDX55	Q8NHQ9	600 aa	Known RBP eCLIP	13.69	□□□□□ -0.22	3e-6	■■■■■ 38.3
TMEM208-209	ENST00000564649	ZKSCAN4	Q969J2	545 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
TMEM208-209	ENST00000564649	LZTS2	Q9BRK4	669 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TMEM208-209	ENST00000564649	BEGAIN	Q9BUH8	593 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TMEM208-209	ENST00000564649	AS3MT	Q9HBK9	375 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TMEM208-209	ENST00000564649	GOPC	Q9HD26	462 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TMEM208-209	ENST00000564649	ORC3	Q9UBD5	711 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
TMEM208-209	ENST00000564649	CSAD	Q9Y600	493 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TMEM208-209	ENST00000564649	TLL2	Q9Y6L7	1015 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TMEM208-209	ENST00000564649	DOCK1	Q14185	1865 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TMEM208-209	ENST00000564649		F5H6K3	240 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TMEM208-209	ENST00000564649	PPFIA3	O75145	1194 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TMEM208-209	ENST00000564649	MAP2K2	P36507	400 aa		13.68	□□□□□ -0.22

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