RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550044.1

CS-217, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 546 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-217ENST00000550044 DPYSL4O14531 572 aa11.67□□□□□ -0.54
CS-217ENST00000550044 ADCY3O60266 1144 aa11.67□□□□□ -0.54
CS-217ENST00000550044 RNF40O75150 1001 aa11.67□□□□□ -0.54
CS-217ENST00000550044 INHAP05111 366 aa11.67□□□□□ -0.54
CS-217ENST00000550044 ELNP15502 786 aa11.67□□□□□ -0.54
CS-217ENST00000550044 RGS3P49796 1198 aa11.67□□□□□ -0.54
CS-217ENST00000550044 FCGRTP55899 365 aa11.67□□□□□ -0.54
CS-217ENST00000550044 RHBDL3P58872 404 aa11.67□□□□□ -0.54
CS-217ENST00000550044 MAP3K12Q12852 859 aa11.67□□□□□ -0.54
CS-217ENST00000550044 PKDCCQ504Y2 493 aa11.67□□□□□ -0.54
CS-217ENST00000550044 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa11.67□□□□□ -0.54
CS-217ENST00000550044 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
CS-217ENST00000550044 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
CS-217ENST00000550044 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
CS-217ENST00000550044 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP11.67□□□□□ -0.54
CS-217ENST00000550044 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
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CS-217ENST00000550044 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
CS-217ENST00000550044 ECHDC1Q9NTX5 307 aa11.67□□□□□ -0.54
CS-217ENST00000550044 MYH2Q9UKX2 1941 aa11.66□□□□□ -0.54
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CS-217ENST00000550044 SYN1P17600 705 aa11.66□□□□□ -0.54
CS-217ENST00000550044 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
CS-217ENST00000550044 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
CS-217ENST00000550044 LRIT3Q3SXY7 679 aa11.66□□□□□ -0.54
CS-217ENST00000550044 ANKRD23Q86SG2 305 aa11.66□□□□□ -0.54
CS-217ENST00000550044 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
CS-217ENST00000550044 TDHQ8IZJ6 230 aa11.66□□□□□ -0.54
CS-217ENST00000550044 MIGA1Q8NAN2 632 aa11.66□□□□□ -0.54
CS-217ENST00000550044 HAUS7Q99871 368 aa11.66□□□□□ -0.54
CS-217ENST00000550044 IDI2Q9BXS1 227 aa11.66□□□□□ -0.54
CS-217ENST00000550044 ZMYND15Q9H091 742 aa11.66□□□□□ -0.54
CS-217ENST00000550044 PAG1Q9NWQ8 432 aa11.66□□□□□ -0.54
CS-217ENST00000550044 ENTPD3O75355 529 aa11.65□□□□□ -0.54
CS-217ENST00000550044 ZMYND10O75800 440 aa11.65□□□□□ -0.54
CS-217ENST00000550044 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
CS-217ENST00000550044 SLURP2P0DP57 97 aa11.65□□□□□ -0.54
CS-217ENST00000550044 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
CS-217ENST00000550044 PPATQ06203 517 aa11.65□□□□□ -0.54
CS-217ENST00000550044 SLFNL1Q499Z3 407 aa11.65□□□□□ -0.54
CS-217ENST00000550044 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa11.65□□□□□ -0.54
CS-217ENST00000550044 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa11.65□□□□□ -0.54
CS-217ENST00000550044 NECAB2Q7Z6G3 386 aa11.65□□□□□ -0.54
CS-217ENST00000550044 TEX11Q8IYF3 940 aa11.65□□□□□ -0.54
CS-217ENST00000550044 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
CS-217ENST00000550044 RPTORQ8N122 1335 aa11.64□□□□□ -0.55
CS-217ENST00000550044 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
CS-217ENST00000550044 CYP2C8P10632 490 aa11.64□□□□□ -0.55
CS-217ENST00000550044 BCRP11274 1271 aa11.64□□□□□ -0.55
CS-217ENST00000550044 INPP5BP32019 993 aa11.64□□□□□ -0.55
CS-217ENST00000550044 FLT3LGP49771 235 aa11.64□□□□□ -0.55
CS-217ENST00000550044 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa11.64□□□□□ -0.55
CS-217ENST00000550044 GPATCH3Q96I76 525 aa11.64□□□□□ -0.55
CS-217ENST00000550044 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
CS-217ENST00000550044 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
CS-217ENST00000550044 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
CS-217ENST00000550044 ZNF532Q9HCE3 1301 aa11.63□□□□□ -0.55
CS-217ENST00000550044 IGSF3O75054 1194 aa11.63□□□□□ -0.55
CS-217ENST00000550044 CHGBP05060 677 aa11.63□□□□□ -0.55
CS-217ENST00000550044 PDE6AP16499 860 aa11.63□□□□□ -0.55
CS-217ENST00000550044 E2F4Q16254 413 aa11.63□□□□□ -0.55
CS-217ENST00000550044 DCAF15Q66K64 600 aa11.63□□□□□ -0.55
CS-217ENST00000550044 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa11.63□□□□□ -0.55
CS-217ENST00000550044 SMC5Q8IY18 1101 aa11.63□□□□□ -0.55
CS-217ENST00000550044 HOOK2Q96ED9 719 aa11.63□□□□□ -0.55
CS-217ENST00000550044 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
CS-217ENST00000550044 LNPKQ9C0E8 428 aa11.63□□□□□ -0.55
CS-217ENST00000550044 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
CS-217ENST00000550044 PRDM6Q9NQX0 595 aa11.63□□□□□ -0.55
CS-217ENST00000550044 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa11.62□□□□□ -0.55
CS-217ENST00000550044 DGAT1O75907 488 aa11.62□□□□□ -0.55
CS-217ENST00000550044 MX1P20591 662 aa11.62□□□□□ -0.55
CS-217ENST00000550044 PRSS12P56730 875 aa11.62□□□□□ -0.55
CS-217ENST00000550044 CAMK2BQ13554 666 aa11.62□□□□□ -0.55
CS-217ENST00000550044 MOGSQ13724 837 aa11.62□□□□□ -0.55
CS-217ENST00000550044 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
CS-217ENST00000550044 FAM161BQ96MY7 647 aa11.62□□□□□ -0.55
CS-217ENST00000550044 ZNF341Q9BYN7 854 aa11.62□□□□□ -0.55
CS-217ENST00000550044 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP11.62□□□□□ -0.55
CS-217ENST00000550044 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
CS-217ENST00000550044 PNMA3Q9UL41 463 aa11.62□□□□□ -0.55
CS-217ENST00000550044 KCNH4Q9UQ05 1017 aa11.62□□□□□ -0.55
CS-217ENST00000550044 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa11.62□□□□□ -0.55
CS-217ENST00000550044 TTC41PQ6P2S7 1318 aa11.61□□□□□ -0.55
CS-217ENST00000550044 AK9Q5TCS8 1911 aa11.61□□□□□ -0.55
CS-217ENST00000550044 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa11.61□□□□□ -0.55
CS-217ENST00000550044 FAM196BA6NMK8 535 aa11.61□□□□□ -0.55
CS-217ENST00000550044 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
CS-217ENST00000550044 ERC2O15083 957 aa11.61□□□□□ -0.55
CS-217ENST00000550044 CAPN2P17655 700 aa11.61□□□□□ -0.55
CS-217ENST00000550044 ADD2P35612 726 aa11.61□□□□□ -0.55
CS-217ENST00000550044 USP5P45974 858 aa11.61□□□□□ -0.55
CS-217ENST00000550044 PI4K2BQ8TCG2 481 aa11.61□□□□□ -0.55
CS-217ENST00000550044 PXYLP1Q8TE99 480 aa11.61□□□□□ -0.55
CS-217ENST00000550044 TATDN2Q93075 761 aa11.61□□□□□ -0.55
CS-217ENST00000550044 GUCD1Q96NT3 240 aa11.61□□□□□ -0.55
CS-217ENST00000550044 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP11.61□□□□□ -0.55
CS-217ENST00000550044 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
CS-217ENST00000550044 PALD1Q9ULE6 856 aa11.61□□□□□ -0.55
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