RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545204.1

MDM2-233, Transcript of MDM2 proto-oncogene, human

TSL 5 BASIC

Gene MDM2, Length 398 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MDM2-233	ENST00000545204	GINM1	Q9NU53	330 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MDM2-233	ENST00000545204	MBNL3	Q9NUK0	354 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
MDM2-233	ENST00000545204	PPT2	Q9UMR5	302 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MDM2-233	ENST00000545204	LRRN2	O75325	713 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MDM2-233	ENST00000545204	RNASE1	P07998	156 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
MDM2-233	ENST00000545204	SRF	P11831	508 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MDM2-233	ENST00000545204	SOX9	P48436	509 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MDM2-233	ENST00000545204	ZP2	Q05996	745 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MDM2-233	ENST00000545204	MCTP1	Q6DN14	999 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MDM2-233	ENST00000545204	SLC23A3	Q6PIS1	610 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MDM2-233	ENST00000545204	PI4K2B	Q8TCG2	481 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MDM2-233	ENST00000545204	UBE2F	Q969M7	185 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MDM2-233	ENST00000545204	GPR62	Q9BZJ7	368 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MDM2-233	ENST00000545204	ACBD3	Q9H3P7	528 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MDM2-233	ENST00000545204	CCSER2	Q9H7U1	834 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MDM2-233	ENST00000545204	LMCD1	Q9NZU5	365 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MDM2-233	ENST00000545204	ZSWIM5	Q9P217	1185 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MDM2-233	ENST00000545204	KCNH3	Q9ULD8	1083 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MDM2-233	ENST00000545204	EFR3B	Q9Y2G0	817 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MDM2-233	ENST00000545204	ACR	P10323	421 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MDM2-233	ENST00000545204	CHMP4BP1	P59074	171 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MDM2-233	ENST00000545204	RNF4	P78317	190 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MDM2-233	ENST00000545204	GAB4	Q2WGN9	574 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MDM2-233	ENST00000545204	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
MDM2-233	ENST00000545204	INTS3	Q68E01	1043 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
MDM2-233	ENST00000545204	TMPRSS7	Q7RTY8	843 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MDM2-233	ENST00000545204	TAB3	Q8N5C8	712 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
MDM2-233	ENST00000545204	RBBP8NL	Q8NC74	664 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
MDM2-233	ENST00000545204	SLC9A7	Q96T83	725 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MDM2-233	ENST00000545204	TRIT1	Q9H3H1	467 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
MDM2-233	ENST00000545204	CARS2	Q9HA77	564 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
MDM2-233	ENST00000545204	PRDM7	Q9NQW5	492 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MDM2-233	ENST00000545204	WASH4P	A8MWX3	477 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MDM2-233	ENST00000545204	CLEC3A	O75596	197 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MDM2-233	ENST00000545204	TAL1	P17542	331 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
MDM2-233	ENST00000545204	ERCC5	P28715	1186 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
MDM2-233	ENST00000545204	FBXW10	Q5XX13	1052 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MDM2-233	ENST00000545204	CCDC81	Q6ZN84	652 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MDM2-233	ENST00000545204	LSR	Q86X29	649 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
MDM2-233	ENST00000545204	TMEM192	Q8IY95	271 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MDM2-233	ENST00000545204	LRRN4CL	Q8ND94	238 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MDM2-233	ENST00000545204	SLC6A18	Q96N87	628 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MDM2-233	ENST00000545204	TM9SF2	Q99805	663 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MDM2-233	ENST00000545204	RC3H2	Q9HBD1	1191 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
MDM2-233	ENST00000545204	GPATCH2	Q9NW75	528 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MDM2-233	ENST00000545204	INPP5F	Q9Y2H2	1132 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MDM2-233	ENST00000545204	SHISA3	A0PJX4	238 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MDM2-233	ENST00000545204	ESR1	P03372	595 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MDM2-233	ENST00000545204	ITGB5	P18084	799 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MDM2-233	ENST00000545204	TPP2	P29144	1249 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
MDM2-233	ENST00000545204	NBPF9	Q3BBW0	867 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MDM2-233	ENST00000545204	TSPYL5	Q86VY4	417 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
MDM2-233	ENST00000545204	KRTAP1-3	Q8IUG1	177 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MDM2-233	ENST00000545204	IGSF5	Q9NSI5	407 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MDM2-233	ENST00000545204	GUCY2C	P25092	1073 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MDM2-233	ENST00000545204	GIPR	P48546	466 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MDM2-233	ENST00000545204	NASP	P49321	788 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
MDM2-233	ENST00000545204	NMI	Q13287	307 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
MDM2-233	ENST00000545204	RUFY4	Q6ZNE9	571 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MDM2-233	ENST00000545204	CREG2	Q8IUH2	290 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MDM2-233	ENST00000545204	SEC16B	Q96JE7	1060 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MDM2-233	ENST00000545204	ZNF512B	Q96KM6	892 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
MDM2-233	ENST00000545204	DHRS1	Q96LJ7	313 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MDM2-233	ENST00000545204	SRRT	Q9BXP5	876 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
MDM2-233	ENST00000545204	SUCO	Q9UBS9	1254 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
MDM2-233	ENST00000545204	DUSP13	Q9UII6	198 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MDM2-233	ENST00000545204	FAM86C2P	A6NEL3	165 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MDM2-233	ENST00000545204		E9PSI1	815 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MDM2-233	ENST00000545204	PAPLN	O95428	1278 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MDM2-233	ENST00000545204	PMS1	P54277	932 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
MDM2-233	ENST00000545204	EIF6	P56537	245 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
MDM2-233	ENST00000545204	SNW1	Q13573	536 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
MDM2-233	ENST00000545204	ZYX	Q15942	572 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
MDM2-233	ENST00000545204	TMC3	Q7Z5M5	1100 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MDM2-233	ENST00000545204	ATG4D	Q86TL0	474 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
MDM2-233	ENST00000545204	FLAD1	Q8NFF5	587 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MDM2-233	ENST00000545204	ENOX1	Q8TC92	643 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
MDM2-233	ENST00000545204	SYTL5	Q8TDW5	730 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
MDM2-233	ENST00000545204	SHD	Q96IW2	340 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MDM2-233	ENST00000545204	ALPK1	Q96QP1	1244 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MDM2-233	ENST00000545204	CRBN	Q96SW2	442 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MDM2-233	ENST00000545204	HDAC8	Q9BY41	377 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MDM2-233	ENST00000545204		C9IYK1	514 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-233	ENST00000545204	JUNB	P17275	347 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-233	ENST00000545204	ATF4	P18848	351 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-233	ENST00000545204	LTK	P29376	864 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-233	ENST00000545204	EGR3	Q06889	387 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-233	ENST00000545204	CLEC16A	Q2KHT3	1053 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-233	ENST00000545204	UNC5A	Q6ZN44	842 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-233	ENST00000545204	C19orf47	Q8N9M1	422 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-233	ENST00000545204	OR6P1	Q8NGX9	317 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-233	ENST00000545204	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-233	ENST00000545204	PRDM14	Q9GZV8	571 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-233	ENST00000545204	MKRN2	Q9H000	416 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-233	ENST00000545204	ASCC2	Q9H1I8	757 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-233	ENST00000545204	C19orf73	Q9NVV2	129 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-233	ENST00000545204	SLAMF8	Q9P0V8	285 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-233	ENST00000545204	STRIP2	Q9ULQ0	834 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-233	ENST00000545204	CTNND2	Q9UQB3	1225 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-233	ENST00000545204	PCDHA11	Q9Y5I1	949 aa		5.01	□□□□□ -1.61

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