RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544584.1

CLSTN3-215, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 546 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-215ENST00000544584 SMC5Q8IY18 1101 aa6.66□□□□□ -1.34
CLSTN3-215ENST00000544584 PXYLP1Q8TE99 480 aa6.66□□□□□ -1.34
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CLSTN3-215ENST00000544584 NUDT12Q9BQG2 462 aa6.66□□□□□ -1.34
CLSTN3-215ENST00000544584 TANGO6Q9C0B7 1094 aa6.66□□□□□ -1.34
CLSTN3-215ENST00000544584 LNPKQ9C0E8 428 aa6.66□□□□□ -1.34
CLSTN3-215ENST00000544584 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
CLSTN3-215ENST00000544584 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
CLSTN3-215ENST00000544584 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa6.66□□□□□ -1.34
CLSTN3-215ENST00000544584 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa6.66□□□□□ -1.34
CLSTN3-215ENST00000544584 CTNNA3Q9UI47 895 aa6.66□□□□□ -1.34
CLSTN3-215ENST00000544584 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa6.66□□□□□ -1.34
CLSTN3-215ENST00000544584 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa6.66□□□□□ -1.34
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CLSTN3-215ENST00000544584 SLC25A27O95847 323 aa6.65□□□□□ -1.34
CLSTN3-215ENST00000544584 TTLL1O95922 423 aa6.65□□□□□ -1.34
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CLSTN3-215ENST00000544584 IRF5Q13568 498 aa6.65□□□□□ -1.34
CLSTN3-215ENST00000544584 MOGSQ13724 837 aa6.65□□□□□ -1.34
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CLSTN3-215ENST00000544584 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa6.65□□□□□ -1.34
CLSTN3-215ENST00000544584 TREML2Q5T2D2 321 aa6.65□□□□□ -1.34
CLSTN3-215ENST00000544584 WDR78Q5VTH9 848 aa6.65□□□□□ -1.34
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CLSTN3-215ENST00000544584 CASC1Q6TDU7 716 aa6.65□□□□□ -1.34
CLSTN3-215ENST00000544584 LBX2Q6XYB7 198 aa6.65□□□□□ -1.34
CLSTN3-215ENST00000544584 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa6.65□□□□□ -1.34
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CLSTN3-215ENST00000544584 GDF15Q99988 308 aa6.65□□□□□ -1.34
CLSTN3-215ENST00000544584 OSBPL3Q9H4L5 887 aa6.65□□□□□ -1.34
CLSTN3-215ENST00000544584 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
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CLSTN3-215ENST00000544584 NYAP2Q9P242 653 aa6.65□□□□□ -1.34
CLSTN3-215ENST00000544584 MORF4L1Q9UBU8 362 aa6.65□□□□□ -1.34
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CLSTN3-215ENST00000544584 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa6.65□□□□□ -1.34
CLSTN3-215ENST00000544584 OTOFQ9HC10 1997 aa6.65□□□□□ -1.34
CLSTN3-215ENST00000544584 RPTORQ8N122 1335 aa6.65□□□□□ -1.35
CLSTN3-215ENST00000544584 DOCK1Q14185 1865 aa6.64□□□□□ -1.35
CLSTN3-215ENST00000544584 TSPY2A6NKD2 308 aa6.64□□□□□ -1.35
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CLSTN3-215ENST00000544584 ADCY3O60266 1144 aa6.64□□□□□ -1.35
CLSTN3-215ENST00000544584 FLOT1O75955 427 aa6.64□□□□□ -1.35
CLSTN3-215ENST00000544584 HMGCRP04035 888 aa6.64□□□□□ -1.35
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CLSTN3-215ENST00000544584 VCAM1P19320 739 aa6.64□□□□□ -1.35
CLSTN3-215ENST00000544584 FLT3LGP49771 235 aa6.64□□□□□ -1.35
CLSTN3-215ENST00000544584 ERVK-9P63128 1117 aa6.64□□□□□ -1.35
CLSTN3-215ENST00000544584 ERVK-24P63145 666 aa6.64□□□□□ -1.35
CLSTN3-215ENST00000544584 ALX1Q15699 326 aa6.64□□□□□ -1.35
CLSTN3-215ENST00000544584 TSHZ3Q63HK5 1081 aa6.64□□□□□ -1.35
CLSTN3-215ENST00000544584 PLEKHH3Q7Z736 793 aa6.64□□□□□ -1.35
CLSTN3-215ENST00000544584 CHURC1Q8WUH1 139 aa6.64□□□□□ -1.35
CLSTN3-215ENST00000544584 SNX27Q96L92 541 aa6.64□□□□□ -1.35
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CLSTN3-215ENST00000544584 RNF208Q9H0X6 261 aa6.64□□□□□ -1.35
CLSTN3-215ENST00000544584 MROH8Q9H579 483 aa6.64□□□□□ -1.35
CLSTN3-215ENST00000544584 TOMM22Q9NS69 142 aa6.64□□□□□ -1.35
CLSTN3-215ENST00000544584 EMILIN3Q9NT22 766 aa6.64□□□□□ -1.35
CLSTN3-215ENST00000544584 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
CLSTN3-215ENST00000544584 TMX2Q9Y320 296 aa6.64□□□□□ -1.35
CLSTN3-215ENST00000544584 MYH1P12882 1939 aa6.64□□□□□ -1.35
CLSTN3-215ENST00000544584 SLC15A5A6NIM6 579 aa6.63□□□□□ -1.35
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF213O14771 459 aa6.63□□□□□ -1.35
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CLSTN3-215ENST00000544584 ZBED4O75132 1171 aa6.63□□□□□ -1.35
CLSTN3-215ENST00000544584 ZMYM6O95789 1325 aa6.63□□□□□ -1.35
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CLSTN3-215ENST00000544584 PLS1Q14651 629 aa6.63□□□□□ -1.35
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CLSTN3-215ENST00000544584 RCSD1Q6JBY9 416 aa6.63□□□□□ -1.35
CLSTN3-215ENST00000544584 MFSD6Q6ZSS7 791 aa6.63□□□□□ -1.35
CLSTN3-215ENST00000544584 DPP9Q86TI2 863 aa6.63□□□□□ -1.35
CLSTN3-215ENST00000544584 IQCA1Q86XH1 822 aa6.63□□□□□ -1.35
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CLSTN3-215ENST00000544584 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CLSTN3-215ENST00000544584 SHCBP1Q8NEM2 672 aa6.63□□□□□ -1.35
CLSTN3-215ENST00000544584 ESR2Q92731 530 aa6.63□□□□□ -1.35
CLSTN3-215ENST00000544584 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CLSTN3-215ENST00000544584 DYNLL2Q96FJ2 89 aa6.63□□□□□ -1.35
CLSTN3-215ENST00000544584 ROBO3Q96MS0 1386 aa6.63□□□□□ -1.35
CLSTN3-215ENST00000544584 GUCD1Q96NT3 240 aa6.63□□□□□ -1.35
CLSTN3-215ENST00000544584 ADGRA2Q96PE1 1338 aa6.63□□□□□ -1.35
CLSTN3-215ENST00000544584 CNNM2Q9H8M5 875 aa6.63□□□□□ -1.35
CLSTN3-215ENST00000544584 CLIP2Q9UDT6 1046 aa6.63□□□□□ -1.35
CLSTN3-215ENST00000544584 FBXO40Q9UH90 709 aa6.63□□□□□ -1.35
CLSTN3-215ENST00000544584 FOCADQ5VW36 1801 aa6.62□□□□□ -1.35
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