RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542720.1

LATS1-205, Transcript of large tumor suppressor kinase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene LATS1, Length 1,096 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LATS1-205ENST00000542720 MTMR4Q9NYA4 1195 aa20.87■□□□□ 0.93
LATS1-205ENST00000542720 NYAP2Q9P242 653 aa20.87■□□□□ 0.93
LATS1-205ENST00000542720 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa20.87■□□□□ 0.93
LATS1-205ENST00000542720 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
LATS1-205ENST00000542720 ADGRA2Q96PE1 1338 aa20.86■□□□□ 0.93
LATS1-205ENST00000542720 VCAM1P19320 739 aa20.86■□□□□ 0.93
LATS1-205ENST00000542720 CASC1Q6TDU7 716 aa20.86■□□□□ 0.93
LATS1-205ENST00000542720 SPICE1Q8N0Z3 855 aa20.86■□□□□ 0.93
LATS1-205ENST00000542720 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
LATS1-205ENST00000542720 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
LATS1-205ENST00000542720 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
LATS1-205ENST00000542720 PLIN4Q96Q06 1357 aa20.85■□□□□ 0.93
LATS1-205ENST00000542720 LAMA4Q16363 1823 aa20.85■□□□□ 0.93
LATS1-205ENST00000542720 OSBPP22059 807 aa20.85■□□□□ 0.93
LATS1-205ENST00000542720 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
LATS1-205ENST00000542720 C17orf99Q6UX52 265 aa20.85■□□□□ 0.93
LATS1-205ENST00000542720 VCPKMTQ9H867 229 aa20.85■□□□□ 0.93
LATS1-205ENST00000542720 B4E1Z4 1266 aa20.84■□□□□ 0.93
LATS1-205ENST00000542720 RAD21O60216 631 aa20.84■□□□□ 0.93
LATS1-205ENST00000542720 FKTNO75072 461 aa20.84■□□□□ 0.93
LATS1-205ENST00000542720 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
LATS1-205ENST00000542720 CAP1Q01518 475 aa20.84■□□□□ 0.93
LATS1-205ENST00000542720 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP20.84■□□□□ 0.93
LATS1-205ENST00000542720 MKL1Q969V6 931 aa20.84■□□□□ 0.93
LATS1-205ENST00000542720 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
LATS1-205ENST00000542720 SH2D4AQ9H788 454 aa20.84■□□□□ 0.93
LATS1-205ENST00000542720 USP17L15C9J2P7 530 aa20.83■□□□□ 0.93
LATS1-205ENST00000542720 USP17L13C9JLJ4 530 aa20.83■□□□□ 0.93
LATS1-205ENST00000542720 USP17L11C9JVI0 530 aa20.83■□□□□ 0.93
LATS1-205ENST00000542720 USP17L18D6R9N7 530 aa20.83■□□□□ 0.93
LATS1-205ENST00000542720 USP17L22D6RA61 530 aa20.83■□□□□ 0.93
LATS1-205ENST00000542720 USP17L17D6RBQ6 530 aa20.83■□□□□ 0.93
LATS1-205ENST00000542720 USP17L19D6RCP7 530 aa20.83■□□□□ 0.93
LATS1-205ENST00000542720 USP17L20D6RJB6 530 aa20.83■□□□□ 0.93
LATS1-205ENST00000542720 PEX10O60683 326 aa20.83■□□□□ 0.93
LATS1-205ENST00000542720 KDM4AO75164 1064 aa20.83■□□□□ 0.93
LATS1-205ENST00000542720 TTLL1O95922 423 aa20.83■□□□□ 0.93
LATS1-205ENST00000542720 PCP11498 1178 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
LATS1-205ENST00000542720 SP3Q02447 781 aa20.83■□□□□ 0.93
LATS1-205ENST00000542720 USP17L24Q0WX57 530 aa20.83■□□□□ 0.93
LATS1-205ENST00000542720 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa20.83■□□□□ 0.93
LATS1-205ENST00000542720 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
LATS1-205ENST00000542720 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa20.83■□□□□ 0.93
LATS1-205ENST00000542720 F5H6K3 240 aa20.82■□□□□ 0.92
LATS1-205ENST00000542720 BCRP11274 1271 aa20.82■□□□□ 0.92
LATS1-205ENST00000542720 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
LATS1-205ENST00000542720 KLRC3Q07444 240 aa20.82■□□□□ 0.92
LATS1-205ENST00000542720 NECTIN1Q15223 517 aa20.82■□□□□ 0.92
LATS1-205ENST00000542720 POTEEQ6S8J3 1075 aa20.82■□□□□ 0.92
LATS1-205ENST00000542720 STOX1Q6ZVD7 989 aa20.82■□□□□ 0.92
LATS1-205ENST00000542720 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
LATS1-205ENST00000542720 ESR2Q92731 530 aa20.82■□□□□ 0.92
LATS1-205ENST00000542720 CHMP4CQ96CF2 233 aa20.82■□□□□ 0.92
LATS1-205ENST00000542720 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa20.82■□□□□ 0.92
LATS1-205ENST00000542720 PNMA3Q9UL41 463 aa20.82■□□□□ 0.92
LATS1-205ENST00000542720 STX8Q9UNK0 236 aa20.82■□□□□ 0.92
LATS1-205ENST00000542720 E7EWF7 191 aa20.81■□□□□ 0.92
LATS1-205ENST00000542720 SLC27A2O14975 620 aa20.81■□□□□ 0.92
LATS1-205ENST00000542720 CD99L2Q8TCZ2 262 aa20.81■□□□□ 0.92
LATS1-205ENST00000542720 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
LATS1-205ENST00000542720 GOPCQ9HD26 462 aa20.81■□□□□ 0.92
LATS1-205ENST00000542720 ZSWIM5Q9P217 1185 aa20.81■□□□□ 0.92
LATS1-205ENST00000542720 MYH4Q9Y623 1939 aa20.8■□□□□ 0.92
LATS1-205ENST00000542720 NDUFB10O96000 172 aa20.8■□□□□ 0.92
LATS1-205ENST00000542720 NOVP48745 357 aa20.8■□□□□ 0.92
LATS1-205ENST00000542720 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP20.8■□□□□ 0.92
LATS1-205ENST00000542720 HERVK_113P62684 666 aa20.8■□□□□ 0.92
LATS1-205ENST00000542720 CREB3L3Q68CJ9 461 aa20.8■□□□□ 0.92
LATS1-205ENST00000542720 CYB5R4Q7L1T6 521 aa20.8■□□□□ 0.92
LATS1-205ENST00000542720 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa20.8■□□□□ 0.92
LATS1-205ENST00000542720 LPAR1Q92633 364 aa20.8■□□□□ 0.92
LATS1-205ENST00000542720 KRT23Q9C075 422 aa20.8■□□□□ 0.92
LATS1-205ENST00000542720 HTTP42858 3142 aa20.8■□□□□ 0.92
LATS1-205ENST00000542720 WDR46O15213 610 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
LATS1-205ENST00000542720 CTGFP29279 349 aa20.79■□□□□ 0.92
LATS1-205ENST00000542720 FAM83BQ5T0W9 1011 aa20.79■□□□□ 0.92
LATS1-205ENST00000542720 RCSD1Q6JBY9 416 aa20.79■□□□□ 0.92
LATS1-205ENST00000542720 TANGO6Q9C0B7 1094 aa20.79■□□□□ 0.92
LATS1-205ENST00000542720 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa20.79■□□□□ 0.92
LATS1-205ENST00000542720 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa20.79■□□□□ 0.92
LATS1-205ENST00000542720 POTEFA5A3E0 1075 aa20.78■□□□□ 0.92
LATS1-205ENST00000542720 SLFN13Q68D06 897 aa20.78■□□□□ 0.92
LATS1-205ENST00000542720 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
LATS1-205ENST00000542720 RASGRP2Q7LDG7 609 aa20.78■□□□□ 0.92
LATS1-205ENST00000542720 TMEM47Q9BQJ4 181 aa20.78■□□□□ 0.92
LATS1-205ENST00000542720 CNNM2Q9H8M5 875 aa20.78■□□□□ 0.92
LATS1-205ENST00000542720 TXNRD2Q9NNW7 524 aa20.78■□□□□ 0.92
LATS1-205ENST00000542720 FBXO28Q9NVF7 368 aa20.78■□□□□ 0.92
LATS1-205ENST00000542720 RBPJLQ9UBG7 517 aa20.78■□□□□ 0.92
LATS1-205ENST00000542720 MTMR7Q9Y216 660 aa20.78■□□□□ 0.92
LATS1-205ENST00000542720 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP20.77■□□□□ 0.92
LATS1-205ENST00000542720 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP20.77■□□□□ 0.92
LATS1-205ENST00000542720 COG2Q14746 738 aa20.77■□□□□ 0.92
LATS1-205ENST00000542720 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa20.77■□□□□ 0.92
LATS1-205ENST00000542720 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa20.76■□□□□ 0.91
LATS1-205ENST00000542720 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP20.76■□□□□ 0.91
LATS1-205ENST00000542720 CNMDO75829 334 aa20.76■□□□□ 0.91
LATS1-205ENST00000542720 FLOT1O75955 427 aa20.76■□□□□ 0.91
LATS1-205ENST00000542720 MCCP23508 829 aa20.76■□□□□ 0.91
LATS1-205ENST00000542720 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.8 ms