RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539921.5

SNHG1-211, Transcript of small nucleolar RNA host gene 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SNHG1, Length 1,071 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG1-211ENST00000539921 YIPF3Q9GZM5 350 aa6.86□□□□□ -1.31
SNHG1-211ENST00000539921 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
SNHG1-211ENST00000539921 ADGRB3O60242 1522 aa6.86□□□□□ -1.31
SNHG1-211ENST00000539921 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP6.86□□□□□ -1.31
SNHG1-211ENST00000539921 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
SNHG1-211ENST00000539921 BCL9O00512 1426 aa6.85□□□□□ -1.31
SNHG1-211ENST00000539921 CD109Q6YHK3 1445 aa6.85□□□□□ -1.31
SNHG1-211ENST00000539921 WDR17Q8IZU2 1322 aa6.85□□□□□ -1.31
SNHG1-211ENST00000539921 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
SNHG1-211ENST00000539921 AGPSO00116 658 aa6.85□□□□□ -1.31
SNHG1-211ENST00000539921 EVI5O60447 810 aa6.85□□□□□ -1.31
SNHG1-211ENST00000539921 ZBED4O75132 1171 aa6.85□□□□□ -1.31
SNHG1-211ENST00000539921 NR1I2O75469 434 aa6.85□□□□□ -1.31
SNHG1-211ENST00000539921 KRT38O76015 456 aa6.85□□□□□ -1.31
SNHG1-211ENST00000539921 GGCXP38435 758 aa6.85□□□□□ -1.31
SNHG1-211ENST00000539921 NEK2P51955 445 aa6.85□□□□□ -1.31
SNHG1-211ENST00000539921 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
SNHG1-211ENST00000539921 AMPD2Q01433 879 aa6.85□□□□□ -1.31
SNHG1-211ENST00000539921 MYO1EQ12965 1108 aa6.85□□□□□ -1.31
SNHG1-211ENST00000539921 SPIDRQ14159 915 aa6.85□□□□□ -1.31
SNHG1-211ENST00000539921 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
SNHG1-211ENST00000539921 MSL1Q68DK7 614 aa6.85□□□□□ -1.31
SNHG1-211ENST00000539921 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
SNHG1-211ENST00000539921 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa6.85□□□□□ -1.31
SNHG1-211ENST00000539921 LRRC49Q8IUZ0 686 aa6.85□□□□□ -1.31
SNHG1-211ENST00000539921 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
SNHG1-211ENST00000539921 AOPEPQ8N6M6 819 aa6.85□□□□□ -1.31
SNHG1-211ENST00000539921 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
SNHG1-211ENST00000539921 STKLD1Q8NE28 680 aa6.85□□□□□ -1.31
SNHG1-211ENST00000539921 ENGASEQ8NFI3 743 aa6.85□□□□□ -1.31
SNHG1-211ENST00000539921 SH3TC2Q8TF17 1288 aa6.85□□□□□ -1.31
SNHG1-211ENST00000539921 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
SNHG1-211ENST00000539921 TEKT4Q8WW24 435 aa6.85□□□□□ -1.31
SNHG1-211ENST00000539921 IFT43Q96FT9 208 aa6.85□□□□□ -1.31
SNHG1-211ENST00000539921 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
SNHG1-211ENST00000539921 MIS12Q9H081 205 aa6.85□□□□□ -1.31
SNHG1-211ENST00000539921 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa6.85□□□□□ -1.31
SNHG1-211ENST00000539921 TBCCD1Q9NVR7 557 aa6.85□□□□□ -1.31
SNHG1-211ENST00000539921 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP6.85□□□□□ -1.31
SNHG1-211ENST00000539921 RTEL1Q9NZ71 1219 aa6.85□□□□□ -1.31
SNHG1-211ENST00000539921 IFNKQ9P0W0 207 aa6.85□□□□□ -1.31
SNHG1-211ENST00000539921 RCOR1Q9UKL0 485 aa6.85□□□□□ -1.31
SNHG1-211ENST00000539921 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa6.85□□□□□ -1.31
SNHG1-211ENST00000539921 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
SNHG1-211ENST00000539921 QRICH2Q9H0J4 1663 aa6.84□□□□□ -1.31
SNHG1-211ENST00000539921 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa6.84□□□□□ -1.31
SNHG1-211ENST00000539921 ADGRB1O14514 1584 aa6.84□□□□□ -1.31
SNHG1-211ENST00000539921 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa6.84□□□□□ -1.31
SNHG1-211ENST00000539921 ANO9A1A5B4 782 aa6.84□□□□□ -1.31
SNHG1-211ENST00000539921 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
SNHG1-211ENST00000539921 BTBD19C9JJ37 291 aa6.84□□□□□ -1.31
SNHG1-211ENST00000539921 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
SNHG1-211ENST00000539921 ZNF202O95125 648 aa6.84□□□□□ -1.31
SNHG1-211ENST00000539921 ANP32DO95626 131 aa6.84□□□□□ -1.31
SNHG1-211ENST00000539921 PDHBP11177 359 aa6.84□□□□□ -1.31
SNHG1-211ENST00000539921 RXRBP28702 533 aa6.84□□□□□ -1.31
SNHG1-211ENST00000539921 STIP1P31948 543 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
SNHG1-211ENST00000539921 SCTRP47872 440 aa6.84□□□□□ -1.31
SNHG1-211ENST00000539921 SERPINB8P50452 374 aa6.84□□□□□ -1.31
SNHG1-211ENST00000539921 ZNF131P52739 623 aa6.84□□□□□ -1.31
SNHG1-211ENST00000539921 EPHB4P54760 987 aa6.84□□□□□ -1.31
SNHG1-211ENST00000539921 INHBCP55103 352 aa6.84□□□□□ -1.31
SNHG1-211ENST00000539921 EVX2Q03828 476 aa6.84□□□□□ -1.31
SNHG1-211ENST00000539921 MFSD10Q14728 455 aa6.84□□□□□ -1.31
SNHG1-211ENST00000539921 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
SNHG1-211ENST00000539921 CAMK4Q16566 473 aa6.84□□□□□ -1.31
SNHG1-211ENST00000539921 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa6.84□□□□□ -1.31
SNHG1-211ENST00000539921 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
SNHG1-211ENST00000539921 RUFY3Q7L099 469 aa6.84□□□□□ -1.31
SNHG1-211ENST00000539921 CATIPQ7Z7H3 387 aa6.84□□□□□ -1.31
SNHG1-211ENST00000539921 NLRP14Q86W24 1093 aa6.84□□□□□ -1.31
SNHG1-211ENST00000539921 KIAA0825Q8IV33 1275 aa6.84□□□□□ -1.31
SNHG1-211ENST00000539921 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa6.84□□□□□ -1.31
SNHG1-211ENST00000539921 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
SNHG1-211ENST00000539921 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
SNHG1-211ENST00000539921 IQCDQ96DY2 449 aa6.84□□□□□ -1.31
SNHG1-211ENST00000539921 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
SNHG1-211ENST00000539921 ZNF570Q96NI8 536 aa6.84□□□□□ -1.31
SNHG1-211ENST00000539921 NDST4Q9H3R1 872 aa6.84□□□□□ -1.31
SNHG1-211ENST00000539921 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
SNHG1-211ENST00000539921 HYPKQ9NX55 129 aa6.84□□□□□ -1.31
SNHG1-211ENST00000539921 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa6.84□□□□□ -1.31
SNHG1-211ENST00000539921 TRIM35Q9UPQ4 493 aa6.84□□□□□ -1.31
SNHG1-211ENST00000539921 LRRC42Q9Y546 428 aa6.84□□□□□ -1.31
SNHG1-211ENST00000539921 ATP7AQ04656 1500 aa6.84□□□□□ -1.31
SNHG1-211ENST00000539921 CHD1O14646 1710 aa6.84□□□□□ -1.31
SNHG1-211ENST00000539921 ANKARQ7Z5J8 1434 aa6.84□□□□□ -1.32
SNHG1-211ENST00000539921 ARHGEF10O15013 1369 aa6.83□□□□□ -1.32
SNHG1-211ENST00000539921 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa6.83□□□□□ -1.32
SNHG1-211ENST00000539921 LRRC7Q96NW7 1537 aa6.83□□□□□ -1.32
SNHG1-211ENST00000539921 M0R2C6 588 aa6.83□□□□□ -1.32
SNHG1-211ENST00000539921 HAX1O00165 279 aa6.83□□□□□ -1.32
SNHG1-211ENST00000539921 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
SNHG1-211ENST00000539921 CYP27B1O15528 508 aa6.83□□□□□ -1.32
SNHG1-211ENST00000539921 PHACTR2O75167 634 aa6.83□□□□□ -1.32
SNHG1-211ENST00000539921 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
SNHG1-211ENST00000539921 TPPPO94811 219 aa6.83□□□□□ -1.32
SNHG1-211ENST00000539921 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
SNHG1-211ENST00000539921 FLT3P36888 993 aa6.83□□□□□ -1.32
SNHG1-211ENST00000539921 TMPOP42166 694 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
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