RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538433.5

PPFIBP1-208, Transcript of PPFIA binding protein 1, human

TSL 3

Gene PPFIBP1, Length 609 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPFIBP1-208	ENST00000538433	MLEC	Q14165	292 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PPFIBP1-208	ENST00000538433	NR0B2	Q15466	257 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PPFIBP1-208	ENST00000538433	KCNA10	Q16322	511 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PPFIBP1-208	ENST00000538433	LCE4A	Q5TA78	99 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PPFIBP1-208	ENST00000538433	LCNL1	Q6ZST4	164 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PPFIBP1-208	ENST00000538433	SPPL2C	Q8IUH8	684 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PPFIBP1-208	ENST00000538433	RELL1	Q8IUW5	271 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PPFIBP1-208	ENST00000538433	CCDC74B	Q96LY2	380 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PPFIBP1-208	ENST00000538433	RNF32	Q9H0A6	362 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PPFIBP1-208	ENST00000538433	CWC22	Q9HCG8	908 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PPFIBP1-208	ENST00000538433	MRS2	Q9HD23	443 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PPFIBP1-208	ENST00000538433	CD320	Q9NPF0	282 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PPFIBP1-208	ENST00000538433	KLHL3	Q9UH77	587 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PPFIBP1-208	ENST00000538433	PCDHA11	Q9Y5I1	949 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PPFIBP1-208	ENST00000538433	PRR36	Q9H6K5	1346 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PPFIBP1-208	ENST00000538433	ETV2	O00321	342 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PPFIBP1-208	ENST00000538433	SORBS3	O60504	671 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPFIBP1-208	ENST00000538433	PF4	P02776	101 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPFIBP1-208	ENST00000538433	CTSH	P09668	335 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPFIBP1-208	ENST00000538433	PDIA4	P13667	645 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PPFIBP1-208	ENST00000538433	GBP2	P32456	591 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PPFIBP1-208	ENST00000538433	TRHR	P34981	398 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PPFIBP1-208	ENST00000538433	CLEC16A	Q2KHT3	1053 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPFIBP1-208	ENST00000538433	SNAP47	Q5SQN1	464 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPFIBP1-208	ENST00000538433	AMIGO3	Q86WK7	504 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPFIBP1-208	ENST00000538433	PHACTR4	Q8IZ21	702 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPFIBP1-208	ENST00000538433	KCNN1	Q92952	543 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPFIBP1-208	ENST00000538433	RHOV	Q96L33	236 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPFIBP1-208	ENST00000538433	KREMEN1	Q96MU8	473 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPFIBP1-208	ENST00000538433	TMEM74	Q96NL1	305 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPFIBP1-208	ENST00000538433	ASCC2	Q9H1I8	757 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PPFIBP1-208	ENST00000538433	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPFIBP1-208	ENST00000538433	REV1	Q9UBZ9	1251 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPFIBP1-208	ENST00000538433	RBM47	A0AV96	593 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PPFIBP1-208	ENST00000538433	HTR3B	O95264	441 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PPFIBP1-208	ENST00000538433	SNX17	Q15036	470 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PPFIBP1-208	ENST00000538433	ANKS4B	Q8N8V4	417 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PPFIBP1-208	ENST00000538433	RSRP1	Q9BUV0	290 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PPFIBP1-208	ENST00000538433	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PPFIBP1-208	ENST00000538433	VTI1B	Q9UEU0	232 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PPFIBP1-208	ENST00000538433	RAPGEFL1	Q9UHV5	662 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PPFIBP1-208	ENST00000538433	SMG5	Q9UPR3	1016 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PPFIBP1-208	ENST00000538433	YBX2	Q9Y2T7	364 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PPFIBP1-208	ENST00000538433		F6X3S4	739 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PPFIBP1-208	ENST00000538433	NUAK1	O60285	661 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PPFIBP1-208	ENST00000538433	SEMA7A	O75326	666 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PPFIBP1-208	ENST00000538433	LINC00310	P59036	64 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PPFIBP1-208	ENST00000538433	RNF4	P78317	190 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PPFIBP1-208	ENST00000538433	MPP2	Q14168	576 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PPFIBP1-208	ENST00000538433	LILRA6	Q6PI73	481 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PPFIBP1-208	ENST00000538433	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PPFIBP1-208	ENST00000538433	BAHD1	Q8TBE0	780 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PPFIBP1-208	ENST00000538433	ENOX1	Q8TC92	643 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PPFIBP1-208	ENST00000538433	FAM161B	Q96MY7	647 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PPFIBP1-208	ENST00000538433	KCNK12	Q9HB15	430 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PPFIBP1-208	ENST00000538433	SP110	Q9HB58	689 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PPFIBP1-208	ENST00000538433	CHURC1-FNTB	B4DL54	471 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PPFIBP1-208	ENST00000538433	RBAK-RBAKDN	I3L0D1	243 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PPFIBP1-208	ENST00000538433	GRIN3B	O60391	1043 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PPFIBP1-208	ENST00000538433	PEX10	O60683	326 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PPFIBP1-208	ENST00000538433	LRRN2	O75325	713 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PPFIBP1-208	ENST00000538433	GBP1	P32455	592 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PPFIBP1-208	ENST00000538433	TEK	Q02763	1124 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PPFIBP1-208	ENST00000538433	DNAJC14	Q6Y2X3	702 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
PPFIBP1-208	ENST00000538433	RNF111	Q6ZNA4	994 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PPFIBP1-208	ENST00000538433	REC114	Q7Z4M0	266 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PPFIBP1-208	ENST00000538433	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PPFIBP1-208	ENST00000538433	GOLM1	Q8NBJ4	401 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PPFIBP1-208	ENST00000538433	INTS4	Q96HW7	963 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
PPFIBP1-208	ENST00000538433	GPR160	Q9UJ42	338 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PPFIBP1-208	ENST00000538433	POLR3K	Q9Y2Y1	108 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
PPFIBP1-208	ENST00000538433	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PPFIBP1-208	ENST00000538433	SHISA3	A0PJX4	238 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PPFIBP1-208	ENST00000538433	ZBTB7C	A1YPR0	619 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PPFIBP1-208	ENST00000538433	ERCC3	P19447	782 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PPFIBP1-208	ENST00000538433	PDE6B	P35913	854 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PPFIBP1-208	ENST00000538433	DLG4	P78352	724 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PPFIBP1-208	ENST00000538433	FAM160A1	Q05DH4	1040 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PPFIBP1-208	ENST00000538433	NMI	Q13287	307 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
PPFIBP1-208	ENST00000538433	CWF19L2	Q2TBE0	894 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
PPFIBP1-208	ENST00000538433	TIGD5	Q53EQ6	642 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PPFIBP1-208	ENST00000538433	TMEM132E	Q6IEE7	984 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PPFIBP1-208	ENST00000538433	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PPFIBP1-208	ENST00000538433	TTLL10	Q6ZVT0	673 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PPFIBP1-208	ENST00000538433	ZNF605	Q86T29	641 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PPFIBP1-208	ENST00000538433	SYTL5	Q8TDW5	730 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
PPFIBP1-208	ENST00000538433	KIF2C	Q99661	725 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PPFIBP1-208	ENST00000538433	CSTF2T	Q9H0L4	616 aa	Known RBP eCLIP	4.81	□□□□□ -1.64
PPFIBP1-208	ENST00000538433	SSU72P8	A0A1W2PR75	194 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PPFIBP1-208	ENST00000538433	MINDY4B	A8MYZ0	360 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PPFIBP1-208	ENST00000538433	RGS13	O14921	159 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PPFIBP1-208	ENST00000538433	RAG1	P15918	1043 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PPFIBP1-208	ENST00000538433	RAD51AP2	Q09MP3	1159 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PPFIBP1-208	ENST00000538433	DAGLB	Q8NCG7	672 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PPFIBP1-208	ENST00000538433	LINC01599	Q8WXQ3	324 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PPFIBP1-208	ENST00000538433	MCOLN1	Q9GZU1	580 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PPFIBP1-208	ENST00000538433	BCL11A	Q9H165	835 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PPFIBP1-208	ENST00000538433	ZNF552	Q9H707	407 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
PPFIBP1-208	ENST00000538433	TEX51	A0A1B0GUA7	166 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PPFIBP1-208	ENST00000538433	RFXAP	O00287	272 aa		4.79	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.5 ms