RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520986.5

DENND3-215, Transcript of DENN domain containing 3, humanhuman

TSL 2

Gene DENND3, Length 899 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND3-215ENST00000520986 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP28.19■■■□□ 2.1
DENND3-215ENST00000520986 PPP4R2Q9NY27 417 aa28.19■■■□□ 2.1
DENND3-215ENST00000520986 ORC4O43929 436 aa28.18■■■□□ 2.1
DENND3-215ENST00000520986 HERVK_113P62684 666 aa28.18■■■□□ 2.1
DENND3-215ENST00000520986 FAM110CQ1W6H9 321 aa28.18■■■□□ 2.1
DENND3-215ENST00000520986 LPAR1Q92633 364 aa28.18■■■□□ 2.1
DENND3-215ENST00000520986 CEP95Q96GE4 821 aa28.18■■■□□ 2.1
DENND3-215ENST00000520986 NYAP2Q9P242 653 aa28.18■■■□□ 2.1
DENND3-215ENST00000520986 MGAMO43451 1857 aa28.18■■■□□ 2.1
DENND3-215ENST00000520986 MYH4Q9Y623 1939 aa28.18■■■□□ 2.1
DENND3-215ENST00000520986 ARHGEF6Q15052 776 aa28.17■■■□□ 2.1
DENND3-215ENST00000520986 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP28.17■■■□□ 2.1
DENND3-215ENST00000520986 SPICE1Q8N0Z3 855 aa28.17■■■□□ 2.1
DENND3-215ENST00000520986 MTMR4Q9NYA4 1195 aa28.17■■■□□ 2.1
DENND3-215ENST00000520986 SGSM2O43147 1006 aa28.16■■■□□ 2.1
DENND3-215ENST00000520986 PSMC4P43686 418 aa28.16■■■□□ 2.1
DENND3-215ENST00000520986 TBC1D10CQ8IV04 446 aa28.16■■■□□ 2.1
DENND3-215ENST00000520986 TRIM47Q96LD4 638 aa28.16■■■□□ 2.1
DENND3-215ENST00000520986 TSPY2A6NKD2 308 aa28.15■■■□□ 2.1
DENND3-215ENST00000520986 ZNF213O14771 459 aa28.15■■■□□ 2.1
DENND3-215ENST00000520986 PEX10O60683 326 aa28.15■■■□□ 2.1
DENND3-215ENST00000520986 AKNAD1Q5T1N1 836 aa28.15■■■□□ 2.1
DENND3-215ENST00000520986 POTEEQ6S8J3 1075 aa28.15■■■□□ 2.1
DENND3-215ENST00000520986 STAG1Q8WVM7 1258 aa28.15■■■□□ 2.1
DENND3-215ENST00000520986 CLIP2Q9UDT6 1046 aa28.15■■■□□ 2.1
DENND3-215ENST00000520986 PTPN22Q9Y2R2 807 aa28.15■■■□□ 2.1
DENND3-215ENST00000520986 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP28.14■■■□□ 2.1
DENND3-215ENST00000520986 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP28.14■■■□□ 2.1
DENND3-215ENST00000520986 GOPCQ9HD26 462 aa28.14■■■□□ 2.1
DENND3-215ENST00000520986 TXNRD2Q9NNW7 524 aa28.14■■■□□ 2.1
DENND3-215ENST00000520986 TOMM22Q9NS69 142 aa28.14■■■□□ 2.1
DENND3-215ENST00000520986 MORF4L1Q9UBU8 362 aa28.14■■■□□ 2.1
DENND3-215ENST00000520986 RLFQ13129 1914 aa28.14■■■□□ 2.09
DENND3-215ENST00000520986 CCDC85CA6NKD9 419 aa28.13■■■□□ 2.09
DENND3-215ENST00000520986 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP28.13■■■□□ 2.09
DENND3-215ENST00000520986 TTLL1O95922 423 aa28.13■■■□□ 2.09
DENND3-215ENST00000520986 MFSD6Q6ZSS7 791 aa28.13■■■□□ 2.09
DENND3-215ENST00000520986 MKL1Q969V6 931 aa28.13■■■□□ 2.09
DENND3-215ENST00000520986 TANGO6Q9C0B7 1094 aa28.13■■■□□ 2.09
DENND3-215ENST00000520986 IL17RBQ9NRM6 502 aa28.13■■■□□ 2.09
DENND3-215ENST00000520986 RBPJLQ9UBG7 517 aa28.13■■■□□ 2.09
DENND3-215ENST00000520986 CTNNA3Q9UI47 895 aa28.13■■■□□ 2.09
DENND3-215ENST00000520986 HPS5Q9UPZ3 1129 aa28.13■■■□□ 2.09
DENND3-215ENST00000520986 WDR46O15213 610 aaKnown RBP28.12■■■□□ 2.09
DENND3-215ENST00000520986 GNRH1P01148 92 aa28.12■■■□□ 2.09
DENND3-215ENST00000520986 PCP11498 1178 aaKnown RBP28.12■■■□□ 2.09
DENND3-215ENST00000520986 FCGRTP55899 365 aa28.12■■■□□ 2.09
DENND3-215ENST00000520986 PTH1RQ03431 593 aa28.12■■■□□ 2.09
DENND3-215ENST00000520986 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP28.12■■■□□ 2.09
DENND3-215ENST00000520986 PARP14Q460N5 1801 aa28.12■■■□□ 2.09
DENND3-215ENST00000520986 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP28.11■■■□□ 2.09
DENND3-215ENST00000520986 RAD21O60216 631 aa28.11■■■□□ 2.09
DENND3-215ENST00000520986 NMT2O60551 498 aa28.11■■■□□ 2.09
DENND3-215ENST00000520986 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP28.11■■■□□ 2.09
DENND3-215ENST00000520986 NKX2-3Q8TAU0 364 aa28.11■■■□□ 2.09
DENND3-215ENST00000520986 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP28.11■■■□□ 2.09
DENND3-215ENST00000520986 NEDD4P46934 1319 aa28.11■■■□□ 2.09
DENND3-215ENST00000520986 F5H6K3 240 aa28.1■■■□□ 2.09
DENND3-215ENST00000520986 KLRC3Q07444 240 aa28.1■■■□□ 2.09
DENND3-215ENST00000520986 COG2Q14746 738 aa28.1■■■□□ 2.09
DENND3-215ENST00000520986 LBX2Q6XYB7 198 aa28.1■■■□□ 2.09
DENND3-215ENST00000520986 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP28.1■■■□□ 2.09
DENND3-215ENST00000520986 PAGR1Q9BTK6 254 aa28.1■■■□□ 2.09
DENND3-215ENST00000520986 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa28.1■■■□□ 2.09
DENND3-215ENST00000520986 CNMDO75829 334 aa28.09■■■□□ 2.09
DENND3-215ENST00000520986 NDUFB10O96000 172 aa28.09■■■□□ 2.09
DENND3-215ENST00000520986 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa28.09■■■□□ 2.09
DENND3-215ENST00000520986 SRRDQ9UH36 339 aa28.09■■■□□ 2.09
DENND3-215ENST00000520986 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa28.09■■■□□ 2.09
DENND3-215ENST00000520986 A0A0G2JMZ2 1700 aa28.09■■■□□ 2.09
DENND3-215ENST00000520986 ERVK-9P63128 1117 aa28.08■■■□□ 2.09
DENND3-215ENST00000520986 ERVK-24P63145 666 aa28.08■■■□□ 2.09
DENND3-215ENST00000520986 Q3C1V9 767 aa28.08■■■□□ 2.09
DENND3-215ENST00000520986 FAM83BQ5T0W9 1011 aa28.08■■■□□ 2.09
DENND3-215ENST00000520986 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa28.08■■■□□ 2.09
DENND3-215ENST00000520986 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa28.08■■■□□ 2.09
DENND3-215ENST00000520986 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP28.07■■■□□ 2.08
DENND3-215ENST00000520986 FLOT1O75955 427 aa28.07■■■□□ 2.08
DENND3-215ENST00000520986 HOXD10P28358 340 aa28.07■■■□□ 2.08
DENND3-215ENST00000520986 NOVP48745 357 aa28.07■■■□□ 2.08
DENND3-215ENST00000520986 PRMT2P55345 433 aa28.07■■■□□ 2.08
DENND3-215ENST00000520986 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa28.07■■■□□ 2.08
DENND3-215ENST00000520986 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa28.07■■■□□ 2.08
DENND3-215ENST00000520986 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP28.07■■■□□ 2.08
DENND3-215ENST00000520986 HOXC10Q9NYD6 342 aa28.07■■■□□ 2.08
DENND3-215ENST00000520986 BTBD7Q9P203 1132 aa28.07■■■□□ 2.08
DENND3-215ENST00000520986 STX8Q9UNK0 236 aa28.07■■■□□ 2.08
DENND3-215ENST00000520986 DSG3P32926 999 aa28.06■■■□□ 2.08
DENND3-215ENST00000520986 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa28.06■■■□□ 2.08
DENND3-215ENST00000520986 FBXO28Q9NVF7 368 aa28.06■■■□□ 2.08
DENND3-215ENST00000520986 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP28.06■■■□□ 2.08
DENND3-215ENST00000520986 MYPNQ86TC9 1320 aa28.06■■■□□ 2.08
DENND3-215ENST00000520986 PRKCZQ05513 592 aa28.05■■■□□ 2.08
DENND3-215ENST00000520986 DOCK3Q8IZD9 2030 aa28.05■■■□□ 2.08
DENND3-215ENST00000520986 ESR2Q92731 530 aa28.05■■■□□ 2.08
DENND3-215ENST00000520986 MAP4K1Q92918 833 aa28.05■■■□□ 2.08
DENND3-215ENST00000520986 ATG4CQ96DT6 458 aa28.05■■■□□ 2.08
DENND3-215ENST00000520986 GABRQQ9UN88 632 aa28.05■■■□□ 2.08
DENND3-215ENST00000520986 PORCNQ9H237 461 aa28.04■■■□□ 2.08
DENND3-215ENST00000520986 B4E1Z4 1266 aa28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.8 ms