RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000518720.5

TSNARE1-202, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

TSL 4

Gene TSNARE1, Length 583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-202ENST00000518720 TMEM87BQ96K49 555 aa20.13■□□□□ 0.81
TSNARE1-202ENST00000518720 TMEM47Q9BQJ4 181 aa20.13■□□□□ 0.81
TSNARE1-202ENST00000518720 KAT14Q9H8E8 782 aa20.13■□□□□ 0.81
TSNARE1-202ENST00000518720 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa20.13■□□□□ 0.81
TSNARE1-202ENST00000518720 GOPCQ9HD26 462 aa20.13■□□□□ 0.81
TSNARE1-202ENST00000518720 TMOD4Q9NZQ9 345 aa20.13■□□□□ 0.81
TSNARE1-202ENST00000518720 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
TSNARE1-202ENST00000518720 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
TSNARE1-202ENST00000518720 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa20.12■□□□□ 0.81
TSNARE1-202ENST00000518720 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
TSNARE1-202ENST00000518720 VEGFBP49765 207 aa20.12■□□□□ 0.81
TSNARE1-202ENST00000518720 USP14P54578 494 aa20.12■□□□□ 0.81
TSNARE1-202ENST00000518720 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
TSNARE1-202ENST00000518720 SEC23AQ15436 765 aa20.12■□□□□ 0.81
TSNARE1-202ENST00000518720 CCL15Q16663 113 aa20.12■□□□□ 0.81
TSNARE1-202ENST00000518720 USP17L2Q6R6M4 530 aa20.12■□□□□ 0.81
TSNARE1-202ENST00000518720 NFXL1Q6ZNB6 911 aa20.12■□□□□ 0.81
TSNARE1-202ENST00000518720 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
TSNARE1-202ENST00000518720 DGKHQ86XP1 1220 aa20.12■□□□□ 0.81
TSNARE1-202ENST00000518720 SPICE1Q8N0Z3 855 aa20.12■□□□□ 0.81
TSNARE1-202ENST00000518720 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa20.12■□□□□ 0.81
TSNARE1-202ENST00000518720 VCPKMTQ9H867 229 aa20.12■□□□□ 0.81
TSNARE1-202ENST00000518720 LY9Q9HBG7 655 aa20.12■□□□□ 0.81
TSNARE1-202ENST00000518720 SENP2Q9HC62 589 aa20.12■□□□□ 0.81
TSNARE1-202ENST00000518720 TMX2Q9Y320 296 aa20.12■□□□□ 0.81
TSNARE1-202ENST00000518720 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
TSNARE1-202ENST00000518720 C19orf81C9J6K1 198 aa20.11■□□□□ 0.81
TSNARE1-202ENST00000518720 NOGQ13253 232 aa20.11■□□□□ 0.81
TSNARE1-202ENST00000518720 Q6ZUG5 572 aa20.11■□□□□ 0.81
TSNARE1-202ENST00000518720 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa20.11■□□□□ 0.81
TSNARE1-202ENST00000518720 IL17RAQ96F46 866 aa20.11■□□□□ 0.81
TSNARE1-202ENST00000518720 TTC14Q96N46 770 aa20.11■□□□□ 0.81
TSNARE1-202ENST00000518720 PDRG1Q9NUG6 133 aa20.11■□□□□ 0.81
TSNARE1-202ENST00000518720 NDUFB10O96000 172 aa20.1■□□□□ 0.81
TSNARE1-202ENST00000518720 CETPP11597 493 aa20.1■□□□□ 0.81
TSNARE1-202ENST00000518720 NOVP48745 357 aa20.1■□□□□ 0.81
TSNARE1-202ENST00000518720 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa20.1■□□□□ 0.81
TSNARE1-202ENST00000518720 RASGRP2Q7LDG7 609 aa20.1■□□□□ 0.81
TSNARE1-202ENST00000518720 PNMA1Q8ND90 353 aa20.1■□□□□ 0.81
TSNARE1-202ENST00000518720 MKL1Q969V6 931 aa20.1■□□□□ 0.81
TSNARE1-202ENST00000518720 MS4A4AQ96JQ5 239 aa20.1■□□□□ 0.81
TSNARE1-202ENST00000518720 ZIC5Q96T25 663 aa20.1■□□□□ 0.81
TSNARE1-202ENST00000518720 KIF2CQ99661 725 aa20.1■□□□□ 0.81
TSNARE1-202ENST00000518720 MTA3Q9BTC8 594 aa20.1■□□□□ 0.81
TSNARE1-202ENST00000518720 EMILIN3Q9NT22 766 aa20.1■□□□□ 0.81
TSNARE1-202ENST00000518720 PARP14Q460N5 1801 aa20.09■□□□□ 0.81
TSNARE1-202ENST00000518720 CCDC69A6NI79 296 aa20.09■□□□□ 0.81
TSNARE1-202ENST00000518720 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
TSNARE1-202ENST00000518720 CCDC96Q2M329 555 aa20.09■□□□□ 0.81
TSNARE1-202ENST00000518720 SH3D19Q5HYK7 790 aa20.09■□□□□ 0.81
TSNARE1-202ENST00000518720 SLFN13Q68D06 897 aa20.09■□□□□ 0.81
TSNARE1-202ENST00000518720 BRI3BPQ8WY22 251 aa20.09■□□□□ 0.81
TSNARE1-202ENST00000518720 ANKS1AQ92625 1134 aa20.09■□□□□ 0.81
TSNARE1-202ENST00000518720 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
TSNARE1-202ENST00000518720 F5H6K3 240 aa20.08■□□□□ 0.81
TSNARE1-202ENST00000518720 VCAM1P19320 739 aa20.08■□□□□ 0.81
TSNARE1-202ENST00000518720 NEK4P51957 841 aa20.08■□□□□ 0.81
TSNARE1-202ENST00000518720 KLRC3Q07444 240 aa20.08■□□□□ 0.81
TSNARE1-202ENST00000518720 SREBF2Q12772 1141 aa20.08■□□□□ 0.81
TSNARE1-202ENST00000518720 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
TSNARE1-202ENST00000518720 CATIPQ7Z7H3 387 aa20.08■□□□□ 0.81
TSNARE1-202ENST00000518720 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
TSNARE1-202ENST00000518720 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa20.08■□□□□ 0.81
TSNARE1-202ENST00000518720 LPAR1Q92633 364 aa20.08■□□□□ 0.81
TSNARE1-202ENST00000518720 BRF1Q92994 677 aa20.08■□□□□ 0.81
TSNARE1-202ENST00000518720 C12orf42Q96LP6 360 aa20.08■□□□□ 0.81
TSNARE1-202ENST00000518720 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
TSNARE1-202ENST00000518720 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa20.08■□□□□ 0.81
TSNARE1-202ENST00000518720 LIFRP42702 1097 aa20.07■□□□□ 0.8
TSNARE1-202ENST00000518720 APOBRQ0VD83 1088 aa20.07■□□□□ 0.8
TSNARE1-202ENST00000518720 MOGSQ13724 837 aa20.07■□□□□ 0.8
TSNARE1-202ENST00000518720 RABEP1Q15276 862 aa20.07■□□□□ 0.8
TSNARE1-202ENST00000518720 TREML2Q5T2D2 321 aa20.07■□□□□ 0.8
TSNARE1-202ENST00000518720 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
TSNARE1-202ENST00000518720 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa20.07■□□□□ 0.8
TSNARE1-202ENST00000518720 ZNF654Q8IZM8 581 aa20.07■□□□□ 0.8
TSNARE1-202ENST00000518720 NUP133Q8WUM0 1156 aa20.07■□□□□ 0.8
TSNARE1-202ENST00000518720 MYL10Q9BUA6 226 aa20.07■□□□□ 0.8
TSNARE1-202ENST00000518720 TANGO6Q9C0B7 1094 aa20.07■□□□□ 0.8
TSNARE1-202ENST00000518720 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
TSNARE1-202ENST00000518720 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa20.07■□□□□ 0.8
TSNARE1-202ENST00000518720 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
TSNARE1-202ENST00000518720 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa20.06■□□□□ 0.8
TSNARE1-202ENST00000518720 BTBD19C9JJ37 291 aa20.06■□□□□ 0.8
TSNARE1-202ENST00000518720 WDR46O15213 610 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
TSNARE1-202ENST00000518720 SLC1A4P43007 532 aa20.06■□□□□ 0.8
TSNARE1-202ENST00000518720 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
TSNARE1-202ENST00000518720 FAM83BQ5T0W9 1011 aa20.06■□□□□ 0.8
TSNARE1-202ENST00000518720 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
TSNARE1-202ENST00000518720 MICU3Q86XE3 530 aa20.06■□□□□ 0.8
TSNARE1-202ENST00000518720 SLC12A7Q9Y666 1083 aa20.06■□□□□ 0.8
TSNARE1-202ENST00000518720 PDHBP11177 359 aa20.05■□□□□ 0.8
TSNARE1-202ENST00000518720 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa20.05■□□□□ 0.8
TSNARE1-202ENST00000518720 TMTC2Q8N394 836 aa20.05■□□□□ 0.8
TSNARE1-202ENST00000518720 DCAF4Q8WV16 495 aa20.05■□□□□ 0.8
TSNARE1-202ENST00000518720 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
TSNARE1-202ENST00000518720 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
TSNARE1-202ENST00000518720 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
TSNARE1-202ENST00000518720 GOLGA8BA8MQT2 603 aa20.04■□□□□ 0.8
TSNARE1-202ENST00000518720 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.9 ms