RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514128.1

SIMC1-211, Transcript of SUMO interacting motifs containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene SIMC1, Length 697 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIMC1-211ENST00000514128 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa29.27■■■□□ 2.28
SIMC1-211ENST00000514128 MAP2K5Q13163 448 aa29.27■■■□□ 2.28
SIMC1-211ENST00000514128 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa29.27■■■□□ 2.28
SIMC1-211ENST00000514128 NECAB2Q7Z6G3 386 aa29.27■■■□□ 2.28
SIMC1-211ENST00000514128 CLEC10AQ8IUN9 316 aa29.27■■■□□ 2.28
SIMC1-211ENST00000514128 USP6NLQ92738 828 aa29.27■■■□□ 2.28
SIMC1-211ENST00000514128 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP29.27■■■□□ 2.28
SIMC1-211ENST00000514128 EVI5O60447 810 aa29.26■■■□□ 2.27
SIMC1-211ENST00000514128 COG2Q14746 738 aa29.26■■■□□ 2.27
SIMC1-211ENST00000514128 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP29.26■■■□□ 2.27
SIMC1-211ENST00000514128 APPBP2Q92624 585 aa29.26■■■□□ 2.27
SIMC1-211ENST00000514128 HOXC10Q9NYD6 342 aa29.26■■■□□ 2.27
SIMC1-211ENST00000514128 BTBD7Q9P203 1132 aa29.26■■■□□ 2.27
SIMC1-211ENST00000514128 SLC15A5A6NIM6 579 aa29.25■■■□□ 2.27
SIMC1-211ENST00000514128 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP29.25■■■□□ 2.27
SIMC1-211ENST00000514128 CTR9Q6PD62 1173 aa29.25■■■□□ 2.27
SIMC1-211ENST00000514128 RLFQ13129 1914 aa29.24■■■□□ 2.27
SIMC1-211ENST00000514128 RRP1P56182 461 aaKnown RBP29.24■■■□□ 2.27
SIMC1-211ENST00000514128 ATP2B2Q01814 1243 aa29.24■■■□□ 2.27
SIMC1-211ENST00000514128 CCL14Q16627 93 aa29.24■■■□□ 2.27
SIMC1-211ENST00000514128 CHRDL2Q6WN34 429 aa29.24■■■□□ 2.27
SIMC1-211ENST00000514128 SPICE1Q8N0Z3 855 aa29.24■■■□□ 2.27
SIMC1-211ENST00000514128 VCPKMTQ9H867 229 aa29.24■■■□□ 2.27
SIMC1-211ENST00000514128 TMX2Q9Y320 296 aa29.24■■■□□ 2.27
SIMC1-211ENST00000514128 PARP14Q460N5 1801 aa29.24■■■□□ 2.27
SIMC1-211ENST00000514128 ALPK3Q96L96 1907 aa29.24■■■□□ 2.27
SIMC1-211ENST00000514128 TTC41PQ6P2S7 1318 aa29.23■■■□□ 2.27
SIMC1-211ENST00000514128 ERC2O15083 957 aa29.23■■■□□ 2.27
SIMC1-211ENST00000514128 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP29.23■■■□□ 2.27
SIMC1-211ENST00000514128 FLOT1O75955 427 aa29.23■■■□□ 2.27
SIMC1-211ENST00000514128 PTPREP23469 700 aa29.23■■■□□ 2.27
SIMC1-211ENST00000514128 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP29.23■■■□□ 2.27
SIMC1-211ENST00000514128 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP29.23■■■□□ 2.27
SIMC1-211ENST00000514128 ZNF236Q9UL36 1845 aa29.22■■■□□ 2.27
SIMC1-211ENST00000514128 SMIM22K7EJ46 135 aa29.22■■■□□ 2.27
SIMC1-211ENST00000514128 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP29.22■■■□□ 2.27
SIMC1-211ENST00000514128 MFSD14CQ5VZR4 134 aa29.22■■■□□ 2.27
SIMC1-211ENST00000514128 MB21D1Q8N884 522 aa29.22■■■□□ 2.27
SIMC1-211ENST00000514128 NBPF3Q9H094 633 aa29.22■■■□□ 2.27
SIMC1-211ENST00000514128 KANSL2Q9H9L4 492 aa29.22■■■□□ 2.27
SIMC1-211ENST00000514128 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP29.22■■■□□ 2.27
SIMC1-211ENST00000514128 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa29.22■■■□□ 2.27
SIMC1-211ENST00000514128 WDR46O15213 610 aaKnown RBP29.21■■■□□ 2.27
SIMC1-211ENST00000514128 GIMAP6Q6P9H5 292 aa29.21■■■□□ 2.27
SIMC1-211ENST00000514128 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP29.21■■■□□ 2.27
SIMC1-211ENST00000514128 GOPCQ9HD26 462 aa29.21■■■□□ 2.27
SIMC1-211ENST00000514128 FRMPD3Q5JV73 1810 aa29.21■■■□□ 2.27
SIMC1-211ENST00000514128 GNAT2P19087 354 aa29.2■■■□□ 2.26
SIMC1-211ENST00000514128 GRB14Q14449 540 aa29.2■■■□□ 2.26
SIMC1-211ENST00000514128 OSBP2Q969R2 916 aa29.2■■■□□ 2.26
SIMC1-211ENST00000514128 SPATC1LQ9H0A9 340 aa29.2■■■□□ 2.26
SIMC1-211ENST00000514128 PCDH10Q9P2E7 1040 aa29.2■■■□□ 2.26
SIMC1-211ENST00000514128 OGDHLQ9ULD0 1010 aa29.2■■■□□ 2.26
SIMC1-211ENST00000514128 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP29.2■■■□□ 2.26
SIMC1-211ENST00000514128 GPAA1O43292 621 aa29.19■■■□□ 2.26
SIMC1-211ENST00000514128 RAD21O60216 631 aa29.19■■■□□ 2.26
SIMC1-211ENST00000514128 EEF2P13639 858 aaKnown RBP29.19■■■□□ 2.26
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SIMC1-211ENST00000514128 PLS1Q14651 629 aa29.19■■■□□ 2.26
SIMC1-211ENST00000514128 SBK1Q52WX2 424 aa29.19■■■□□ 2.26
SIMC1-211ENST00000514128 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa29.19■■■□□ 2.26
SIMC1-211ENST00000514128 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP29.19■■■□□ 2.26
SIMC1-211ENST00000514128 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP29.18■■■□□ 2.26
SIMC1-211ENST00000514128 ROBO3Q96MS0 1386 aa29.18■■■□□ 2.26
SIMC1-211ENST00000514128 GSG1L2A8MUP6 293 aa29.18■■■□□ 2.26
SIMC1-211ENST00000514128 MINDY4BA8MYZ0 360 aa29.18■■■□□ 2.26
SIMC1-211ENST00000514128 APPP05067 770 aa29.18■■■□□ 2.26
SIMC1-211ENST00000514128 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP29.18■■■□□ 2.26
SIMC1-211ENST00000514128 DSG3P32926 999 aa29.18■■■□□ 2.26
SIMC1-211ENST00000514128 SIAH1Q8IUQ4 282 aa29.18■■■□□ 2.26
SIMC1-211ENST00000514128 SHCBP1Q8NEM2 672 aa29.18■■■□□ 2.26
SIMC1-211ENST00000514128 C11orf49Q9H6J7 331 aa29.18■■■□□ 2.26
SIMC1-211ENST00000514128 MKNK2Q9HBH9 465 aa29.18■■■□□ 2.26
SIMC1-211ENST00000514128 HOXC6P09630 235 aa29.17■■■□□ 2.26
SIMC1-211ENST00000514128 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP29.17■■■□□ 2.26
SIMC1-211ENST00000514128 DPP9Q86TI2 863 aa29.17■■■□□ 2.26
SIMC1-211ENST00000514128 ATG4CQ96DT6 458 aa29.17■■■□□ 2.26
SIMC1-211ENST00000514128 FSD1Q9BTV5 496 aa29.17■■■□□ 2.26
SIMC1-211ENST00000514128 STRNO43815 780 aa29.16■■■□□ 2.26
SIMC1-211ENST00000514128 ERCC3P19447 782 aa29.16■■■□□ 2.26
SIMC1-211ENST00000514128 STK11IPQ8N1F8 1099 aa29.16■■■□□ 2.26
SIMC1-211ENST00000514128 ZNF287Q9HBT7 754 aa29.16■■■□□ 2.26
SIMC1-211ENST00000514128 MYH4Q9Y623 1939 aa29.16■■■□□ 2.26
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SIMC1-211ENST00000514128 MX1P20591 662 aa29.15■■■□□ 2.26
SIMC1-211ENST00000514128 NCAPG2Q86XI2 1143 aa29.15■■■□□ 2.26
SIMC1-211ENST00000514128 MROH8Q9H579 483 aa29.15■■■□□ 2.26
SIMC1-211ENST00000514128 ADORA2AP29274 412 aa29.14■■■□□ 2.26
SIMC1-211ENST00000514128 C7orf61Q8IZ16 206 aa29.14■■■□□ 2.26
SIMC1-211ENST00000514128 PI4K2BQ8TCG2 481 aa29.14■■■□□ 2.26
SIMC1-211ENST00000514128 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP29.14■■■□□ 2.26
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SIMC1-211ENST00000514128 SLC5A4Q9NY91 659 aa29.14■■■□□ 2.26
SIMC1-211ENST00000514128 FLRT1Q9NZU1 646 aa29.14■■■□□ 2.26
SIMC1-211ENST00000514128 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP29.14■■■□□ 2.26
SIMC1-211ENST00000514128 RASA1P20936 1047 aa29.13■■■□□ 2.25
SIMC1-211ENST00000514128 CNGA1P29973 690 aa29.13■■■□□ 2.25
SIMC1-211ENST00000514128 NPLOC4Q8TAT6 608 aa29.13■■■□□ 2.25
SIMC1-211ENST00000514128 CRBNQ96SW2 442 aa29.13■■■□□ 2.25
SIMC1-211ENST00000514128 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP29.13■■■□□ 2.25
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