RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513267.2

ANKDD1A-208, Transcript of ankyrin repeat and death domain containing 1A, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ANKDD1A, Length 1,448 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKDD1A-208ENST00000513267 FGRP09769 529 aa22.6■■□□□ 1.21
ANKDD1A-208ENST00000513267 HERVK_113P62684 666 aa22.6■■□□□ 1.21
ANKDD1A-208ENST00000513267 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
ANKDD1A-208ENST00000513267 MFSD6Q6ZSS7 791 aa22.6■■□□□ 1.21
ANKDD1A-208ENST00000513267 SPICE1Q8N0Z3 855 aa22.6■■□□□ 1.21
ANKDD1A-208ENST00000513267 LPAR1Q92633 364 aa22.6■■□□□ 1.21
ANKDD1A-208ENST00000513267 CEP95Q96GE4 821 aa22.6■■□□□ 1.21
ANKDD1A-208ENST00000513267 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa22.6■■□□□ 1.21
ANKDD1A-208ENST00000513267 GOPCQ9HD26 462 aa22.6■■□□□ 1.21
ANKDD1A-208ENST00000513267 NYAP2Q9P242 653 aa22.6■■□□□ 1.21
ANKDD1A-208ENST00000513267 CLIP2Q9UDT6 1046 aa22.6■■□□□ 1.21
ANKDD1A-208ENST00000513267 MGAMO43451 1857 aa22.6■■□□□ 1.21
ANKDD1A-208ENST00000513267 SGSM2O43147 1006 aa22.59■■□□□ 1.21
ANKDD1A-208ENST00000513267 ORC4O43929 436 aa22.59■■□□□ 1.21
ANKDD1A-208ENST00000513267 PSMC4P43686 418 aa22.59■■□□□ 1.21
ANKDD1A-208ENST00000513267 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa22.59■■□□□ 1.21
ANKDD1A-208ENST00000513267 MTMR4Q9NYA4 1195 aa22.59■■□□□ 1.21
ANKDD1A-208ENST00000513267 LAMA4Q16363 1823 aa22.59■■□□□ 1.21
ANKDD1A-208ENST00000513267 CENPFP49454 3210 aa22.59■■□□□ 1.21
ANKDD1A-208ENST00000513267 HTTP42858 3142 aa22.59■■□□□ 1.21
ANKDD1A-208ENST00000513267 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
ANKDD1A-208ENST00000513267 TTLL1O95922 423 aa22.58■■□□□ 1.21
ANKDD1A-208ENST00000513267 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
ANKDD1A-208ENST00000513267 FAM110CQ1W6H9 321 aa22.58■■□□□ 1.21
ANKDD1A-208ENST00000513267 AKNAD1Q5T1N1 836 aa22.58■■□□□ 1.21
ANKDD1A-208ENST00000513267 TANGO6Q9C0B7 1094 aa22.58■■□□□ 1.21
ANKDD1A-208ENST00000513267 NBPF3Q9H094 633 aa22.58■■□□□ 1.21
ANKDD1A-208ENST00000513267 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
ANKDD1A-208ENST00000513267 PLIN4Q96Q06 1357 aa22.58■■□□□ 1.2
ANKDD1A-208ENST00000513267 PCP11498 1178 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
ANKDD1A-208ENST00000513267 TBC1D10CQ8IV04 446 aa22.57■■□□□ 1.2
ANKDD1A-208ENST00000513267 STAG1Q8WVM7 1258 aa22.57■■□□□ 1.2
ANKDD1A-208ENST00000513267 ABHD8Q96I13 439 aa22.57■■□□□ 1.2
ANKDD1A-208ENST00000513267 CTGFP29279 349 aa22.57■■□□□ 1.2
ANKDD1A-208ENST00000513267 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
ANKDD1A-208ENST00000513267 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
ANKDD1A-208ENST00000513267 MKL1Q969V6 931 aa22.57■■□□□ 1.2
ANKDD1A-208ENST00000513267 TRIM47Q96LD4 638 aa22.57■■□□□ 1.2
ANKDD1A-208ENST00000513267 PTPN22Q9Y2R2 807 aa22.57■■□□□ 1.2
ANKDD1A-208ENST00000513267 F5H6K3 240 aa22.56■■□□□ 1.2
ANKDD1A-208ENST00000513267 WDR46O15213 610 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
ANKDD1A-208ENST00000513267 GNRH1P01148 92 aa22.56■■□□□ 1.2
ANKDD1A-208ENST00000513267 FCGRTP55899 365 aa22.56■■□□□ 1.2
ANKDD1A-208ENST00000513267 PTH1RQ03431 593 aa22.56■■□□□ 1.2
ANKDD1A-208ENST00000513267 KLRC3Q07444 240 aa22.56■■□□□ 1.2
ANKDD1A-208ENST00000513267 COG2Q14746 738 aa22.56■■□□□ 1.2
ANKDD1A-208ENST00000513267 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa22.56■■□□□ 1.2
ANKDD1A-208ENST00000513267 PAGR1Q9BTK6 254 aa22.56■■□□□ 1.2
ANKDD1A-208ENST00000513267 IL17RBQ9NRM6 502 aa22.56■■□□□ 1.2
ANKDD1A-208ENST00000513267 HOXC10Q9NYD6 342 aa22.56■■□□□ 1.2
ANKDD1A-208ENST00000513267 RBPJLQ9UBG7 517 aa22.56■■□□□ 1.2
ANKDD1A-208ENST00000513267 MORF4L1Q9UBU8 362 aa22.56■■□□□ 1.2
ANKDD1A-208ENST00000513267 STX8Q9UNK0 236 aa22.56■■□□□ 1.2
ANKDD1A-208ENST00000513267 NMT2O60551 498 aa22.55■■□□□ 1.2
ANKDD1A-208ENST00000513267 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa22.55■■□□□ 1.2
ANKDD1A-208ENST00000513267 DOCK3Q8IZD9 2030 aa22.54■■□□□ 1.2
ANKDD1A-208ENST00000513267 PEX10O60683 326 aa22.54■■□□□ 1.2
ANKDD1A-208ENST00000513267 FLOT1O75955 427 aa22.54■■□□□ 1.2
ANKDD1A-208ENST00000513267 HOXD10P28358 340 aa22.54■■□□□ 1.2
ANKDD1A-208ENST00000513267 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa22.54■■□□□ 1.2
ANKDD1A-208ENST00000513267 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
ANKDD1A-208ENST00000513267 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa22.54■■□□□ 1.2
ANKDD1A-208ENST00000513267 TXNRD2Q9NNW7 524 aa22.54■■□□□ 1.2
ANKDD1A-208ENST00000513267 ERVK-9P63128 1117 aa22.53■■□□□ 1.2
ANKDD1A-208ENST00000513267 ERVK-24P63145 666 aa22.53■■□□□ 1.2
ANKDD1A-208ENST00000513267 FAM83BQ5T0W9 1011 aa22.53■■□□□ 1.2
ANKDD1A-208ENST00000513267 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
ANKDD1A-208ENST00000513267 ESR2Q92731 530 aa22.53■■□□□ 1.2
ANKDD1A-208ENST00000513267 HPS5Q9UPZ3 1129 aa22.53■■□□□ 1.2
ANKDD1A-208ENST00000513267 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa22.53■■□□□ 1.2
ANKDD1A-208ENST00000513267 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
ANKDD1A-208ENST00000513267 RLFQ13129 1914 aa22.53■■□□□ 1.2
ANKDD1A-208ENST00000513267 NEDD4P46934 1319 aa22.52■■□□□ 1.2
ANKDD1A-208ENST00000513267 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
ANKDD1A-208ENST00000513267 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
ANKDD1A-208ENST00000513267 NDUFB10O96000 172 aa22.52■■□□□ 1.2
ANKDD1A-208ENST00000513267 POTEEQ6S8J3 1075 aa22.52■■□□□ 1.2
ANKDD1A-208ENST00000513267 CASC1Q6TDU7 716 aa22.52■■□□□ 1.2
ANKDD1A-208ENST00000513267 LBX2Q6XYB7 198 aa22.52■■□□□ 1.2
ANKDD1A-208ENST00000513267 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
ANKDD1A-208ENST00000513267 SRRDQ9UH36 339 aa22.52■■□□□ 1.2
ANKDD1A-208ENST00000513267 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa22.52■■□□□ 1.2
ANKDD1A-208ENST00000513267 CAPN15O75808 1086 aa22.51■■□□□ 1.19
ANKDD1A-208ENST00000513267 DSG3P32926 999 aa22.51■■□□□ 1.19
ANKDD1A-208ENST00000513267 PRMT2P55345 433 aa22.51■■□□□ 1.19
ANKDD1A-208ENST00000513267 Q3C1V9 767 aa22.51■■□□□ 1.19
ANKDD1A-208ENST00000513267 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
ANKDD1A-208ENST00000513267 MAP4K1Q92918 833 aa22.51■■□□□ 1.19
ANKDD1A-208ENST00000513267 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa22.51■■□□□ 1.19
ANKDD1A-208ENST00000513267 PARP14Q460N5 1801 aa22.51■■□□□ 1.19
ANKDD1A-208ENST00000513267 CCDC85CA6NKD9 419 aa22.5■■□□□ 1.19
ANKDD1A-208ENST00000513267 CDC45O75419 566 aa22.5■■□□□ 1.19
ANKDD1A-208ENST00000513267 SLFN13Q68D06 897 aa22.5■■□□□ 1.19
ANKDD1A-208ENST00000513267 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa22.5■■□□□ 1.19
ANKDD1A-208ENST00000513267 COA7Q96BR5 231 aa22.5■■□□□ 1.19
ANKDD1A-208ENST00000513267 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa22.5■■□□□ 1.19
ANKDD1A-208ENST00000513267 MYPNQ86TC9 1320 aa22.5■■□□□ 1.19
ANKDD1A-208ENST00000513267 B4E1Z4 1266 aa22.49■■□□□ 1.19
ANKDD1A-208ENST00000513267 KDM4AO75164 1064 aa22.49■■□□□ 1.19
ANKDD1A-208ENST00000513267 CNMDO75829 334 aa22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.5 ms