RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509368.6

PDE4D-218, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,809 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-218ENST00000509368 GAL3ST3Q96A11 431 aa2.97□□□□□ -1.93
PDE4D-218ENST00000509368 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP2.97□□□□□ -1.93
PDE4D-218ENST00000509368 PLVAPQ9BX97 442 aa2.97□□□□□ -1.93
PDE4D-218ENST00000509368 TNKS2Q9H2K2 1166 aa2.97□□□□□ -1.93
PDE4D-218ENST00000509368 RNF114Q9Y508 228 aa2.97□□□□□ -1.93
PDE4D-218ENST00000509368 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP2.97□□□□□ -1.93
PDE4D-218ENST00000509368 CCDC85CA6NKD9 419 aa2.97□□□□□ -1.93
PDE4D-218ENST00000509368 FAM177BA6PVY3 158 aa2.97□□□□□ -1.93
PDE4D-218ENST00000509368 TLR3O15455 904 aaKnown RBP2.97□□□□□ -1.93
PDE4D-218ENST00000509368 ADCY3O60266 1144 aa2.97□□□□□ -1.93
PDE4D-218ENST00000509368 ALX3O95076 343 aa2.97□□□□□ -1.93
PDE4D-218ENST00000509368 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP2.97□□□□□ -1.93
PDE4D-218ENST00000509368 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP2.97□□□□□ -1.93
PDE4D-218ENST00000509368 DHCR24Q15392 516 aa2.97□□□□□ -1.93
PDE4D-218ENST00000509368 LCE5AQ5TCM9 118 aa2.97□□□□□ -1.93
PDE4D-218ENST00000509368 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP2.97□□□□□ -1.93
PDE4D-218ENST00000509368 GK5Q6ZS86 529 aa2.97□□□□□ -1.93
PDE4D-218ENST00000509368 RNF180Q86T96 592 aa2.97□□□□□ -1.93
PDE4D-218ENST00000509368 SCUBE1Q8IWY4 988 aa2.97□□□□□ -1.93
PDE4D-218ENST00000509368 FBXO27Q8NI29 283 aa2.97□□□□□ -1.93
PDE4D-218ENST00000509368 RIN3Q8TB24 985 aa2.97□□□□□ -1.93
PDE4D-218ENST00000509368 CNNM2Q9H8M5 875 aa2.97□□□□□ -1.93
PDE4D-218ENST00000509368 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP2.97□□□□□ -1.93
PDE4D-218ENST00000509368 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa2.97□□□□□ -1.93
PDE4D-218ENST00000509368 COMMD10Q9Y6G5 202 aa2.97□□□□□ -1.93
PDE4D-218ENST00000509368 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa2.96□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 GSG1L2A8MUP6 293 aa2.96□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 UPK3BL1B0FP48 263 aa2.96□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 UPK3BL2E5RIL1 263 aa2.96□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 TSPAN6O43657 245 aa2.96□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 SUSD5O60279 629 aa2.96□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 BRINP1O60477 761 aa2.96□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 ALAS2P22557 587 aa2.96□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 PDE4BQ07343 736 aa2.96□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 FAPQ12884 760 aa2.96□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 BIRC2Q13490 618 aa2.96□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 TRIM61Q5EBN2 209 aa2.96□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa2.96□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 UBASH3BQ8TF42 649 aa2.96□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 PMM1Q92871 262 aa2.96□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 DHRS1Q96LJ7 313 aa2.96□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 FRRS1LQ9P0K9 344 aa2.96□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 CD2APQ9Y5K6 639 aa2.96□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 A0A0A0MRY4 1105 aa2.96□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 TRAV20A0A0B4J274 112 aa2.96□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 EFCAB14O75071 495 aa2.96□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 RASGRP1O95267 797 aa2.96□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 FAM153BP0C7A2 387 aa2.96□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 NME1P15531 152 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 RHBDL3P58872 404 aa2.96□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 NFKB2Q00653 900 aa2.96□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 NXNQ6DKJ4 435 aa2.96□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 HDXQ7Z353 690 aa2.96□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP2.96□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 DHRS4Q9BTZ2 278 aa2.96□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 GFRA2O00451 464 aa2.95□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 FSCN2O14926 492 aa2.95□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 ALDH1L1O75891 902 aa2.95□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 KRT18P05783 430 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 FGFR1P11362 822 aa2.95□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 RBM10P98175 930 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 SLC7A5Q01650 507 aa2.95□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 PPP2R5EQ16537 467 aa2.95□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 SLC10A6Q3KNW5 377 aa2.95□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 VHLLQ6RSH7 139 aa2.95□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 SPATC1Q76KD6 591 aa2.95□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 PDZD3Q86UT5 571 aa2.95□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 KIF18BQ86Y91 864 aa2.95□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 ORAI3Q9BRQ5 295 aa2.95□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 PHLDB1Q86UU1 1377 aa2.95□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 GOLGA6CA6NDK9 693 aa2.95□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 GOLGA6BA6NDN3 693 aa2.95□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 HTR3BO95264 441 aa2.95□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 MYL1P05976 194 aa2.95□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 GOLGA6DP0CG33 693 aa2.95□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 GNALP38405 381 aa2.95□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 CHRNA4P43681 627 aa2.95□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 SEPT6Q14141 434 aa2.95□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 PPP2R5AQ15172 486 aa2.95□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 UNC5AQ6ZN44 842 aa2.95□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 NLRC3Q7RTR2 1065 aa2.95□□□□□ -1.94
PDE4D-218ENST00000509368 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa2.95□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.3 ms