RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000499601.2

AC008393.1-201, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene AC008393.1, Length 1,454 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC008393.1-201ENST00000499601 RXRAP19793 462 aa21.52■■□□□ 1.04
AC008393.1-201ENST00000499601 KIF5BP33176 963 aa21.52■■□□□ 1.04
AC008393.1-201ENST00000499601 C1QTNF8P60827 252 aa21.52■■□□□ 1.04
AC008393.1-201ENST00000499601 PRKG1Q13976 671 aa21.52■■□□□ 1.04
AC008393.1-201ENST00000499601 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa21.52■■□□□ 1.04
AC008393.1-201ENST00000499601 PICK1Q9NRD5 415 aa21.52■■□□□ 1.04
AC008393.1-201ENST00000499601 CDKL5O76039 1030 aa21.52■■□□□ 1.03
AC008393.1-201ENST00000499601 MAP3K9P80192 1104 aa21.52■■□□□ 1.03
AC008393.1-201ENST00000499601 CHADLQ6NUI6 762 aa21.52■■□□□ 1.03
AC008393.1-201ENST00000499601 SIAH1Q8IUQ4 282 aa21.52■■□□□ 1.03
AC008393.1-201ENST00000499601 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa21.52■■□□□ 1.03
AC008393.1-201ENST00000499601 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.03
AC008393.1-201ENST00000499601 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.03
AC008393.1-201ENST00000499601 FOXD4L1Q9NU39 408 aa21.52■■□□□ 1.03
AC008393.1-201ENST00000499601 USP17L5A8MUK1 530 aa21.51■■□□□ 1.03
AC008393.1-201ENST00000499601 GRM4Q14833 912 aa21.51■■□□□ 1.03
AC008393.1-201ENST00000499601 MAP3K11Q16584 847 aa21.51■■□□□ 1.03
AC008393.1-201ENST00000499601 ARMC9Q7Z3E5 817 aa21.51■■□□□ 1.03
AC008393.1-201ENST00000499601 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
AC008393.1-201ENST00000499601 FZD1Q9UP38 647 aa21.51■■□□□ 1.03
AC008393.1-201ENST00000499601 SMC3Q9UQE7 1217 aa21.51■■□□□ 1.03
AC008393.1-201ENST00000499601 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa21.5■■□□□ 1.03
AC008393.1-201ENST00000499601 CDC27P30260 824 aa21.5■■□□□ 1.03
AC008393.1-201ENST00000499601 ADD1P35611 737 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
AC008393.1-201ENST00000499601 GNAQP50148 359 aa21.5■■□□□ 1.03
AC008393.1-201ENST00000499601 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
AC008393.1-201ENST00000499601 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa21.5■■□□□ 1.03
AC008393.1-201ENST00000499601 AS3MTQ9HBK9 375 aa21.5■■□□□ 1.03
AC008393.1-201ENST00000499601 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
AC008393.1-201ENST00000499601 TMX2Q9Y320 296 aa21.5■■□□□ 1.03
AC008393.1-201ENST00000499601 CSADQ9Y600 493 aa21.5■■□□□ 1.03
AC008393.1-201ENST00000499601 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
AC008393.1-201ENST00000499601 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa21.49■■□□□ 1.03
AC008393.1-201ENST00000499601 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
AC008393.1-201ENST00000499601 UNCXA6NJT0 531 aa21.48■■□□□ 1.03
AC008393.1-201ENST00000499601 TRAF5O00463 557 aa21.48■■□□□ 1.03
AC008393.1-201ENST00000499601 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
AC008393.1-201ENST00000499601 SNHG28P0DPA3 235 aa21.48■■□□□ 1.03
AC008393.1-201ENST00000499601 PDHBP11177 359 aa21.48■■□□□ 1.03
AC008393.1-201ENST00000499601 PTPRAP18433 802 aa21.48■■□□□ 1.03
AC008393.1-201ENST00000499601 FKBP1BP68106 108 aa21.48■■□□□ 1.03
AC008393.1-201ENST00000499601 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
AC008393.1-201ENST00000499601 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa21.48■■□□□ 1.03
AC008393.1-201ENST00000499601 DCAF4Q8WV16 495 aa21.48■■□□□ 1.03
AC008393.1-201ENST00000499601 GOPCQ9HD26 462 aa21.48■■□□□ 1.03
AC008393.1-201ENST00000499601 MTMR7Q9Y216 660 aa21.48■■□□□ 1.03
AC008393.1-201ENST00000499601 OTOFQ9HC10 1997 aa21.48■■□□□ 1.03
AC008393.1-201ENST00000499601 A0A1W2PRG0 241 aa21.47■■□□□ 1.03
AC008393.1-201ENST00000499601 IFNAR1P17181 557 aa21.47■■□□□ 1.03
AC008393.1-201ENST00000499601 ASPRV1Q53RT3 343 aa21.47■■□□□ 1.03
AC008393.1-201ENST00000499601 LZTS2Q9BRK4 669 aa21.47■■□□□ 1.03
AC008393.1-201ENST00000499601 WDR18Q9BV38 432 aa21.47■■□□□ 1.03
AC008393.1-201ENST00000499601 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
AC008393.1-201ENST00000499601 MAD2L2Q9UI95 211 aa21.47■■□□□ 1.03
AC008393.1-201ENST00000499601 KIF3AQ9Y496 699 aa21.47■■□□□ 1.03
AC008393.1-201ENST00000499601 PTPDC1A2A3K4 754 aa21.46■■□□□ 1.03
AC008393.1-201ENST00000499601 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
AC008393.1-201ENST00000499601 F5H6K3 240 aa21.46■■□□□ 1.03
AC008393.1-201ENST00000499601 CTDNEP1O95476 244 aa21.46■■□□□ 1.03
AC008393.1-201ENST00000499601 GJB2P29033 226 aa21.46■■□□□ 1.03
AC008393.1-201ENST00000499601 ECE1P42892 770 aa21.46■■□□□ 1.03
AC008393.1-201ENST00000499601 KLRC3Q07444 240 aa21.46■■□□□ 1.03
AC008393.1-201ENST00000499601 VGLL4Q14135 290 aa21.46■■□□□ 1.03
AC008393.1-201ENST00000499601 NTRK3Q16288 839 aa21.46■■□□□ 1.03
AC008393.1-201ENST00000499601 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
AC008393.1-201ENST00000499601 SLFN13Q68D06 897 aa21.46■■□□□ 1.03
AC008393.1-201ENST00000499601 TMTC3Q6ZXV5 915 aa21.46■■□□□ 1.03
AC008393.1-201ENST00000499601 ACER1Q8TDN7 264 aa21.46■■□□□ 1.03
AC008393.1-201ENST00000499601 FEZ1Q99689 392 aa21.46■■□□□ 1.03
AC008393.1-201ENST00000499601 ZNF408Q9H9D4 720 aa21.46■■□□□ 1.03
AC008393.1-201ENST00000499601 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa21.46■■□□□ 1.03
AC008393.1-201ENST00000499601 GMCL1Q96IK5 515 aa21.45■■□□□ 1.03
AC008393.1-201ENST00000499601 VCPKMTQ9H867 229 aa21.45■■□□□ 1.03
AC008393.1-201ENST00000499601 RAD21O60216 631 aa21.45■■□□□ 1.02
AC008393.1-201ENST00000499601 JAK2O60674 1132 aa21.45■■□□□ 1.02
AC008393.1-201ENST00000499601 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
AC008393.1-201ENST00000499601 SLC1A4P43007 532 aa21.45■■□□□ 1.02
AC008393.1-201ENST00000499601 USP14P54578 494 aa21.45■■□□□ 1.02
AC008393.1-201ENST00000499601 ZNF543Q08ER8 600 aa21.45■■□□□ 1.02
AC008393.1-201ENST00000499601 USP17L2Q6R6M4 530 aa21.45■■□□□ 1.02
AC008393.1-201ENST00000499601 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
AC008393.1-201ENST00000499601 TRIM22Q8IYM9 498 aa21.45■■□□□ 1.02
AC008393.1-201ENST00000499601 ZNF280CQ8ND82 737 aa21.45■■□□□ 1.02
AC008393.1-201ENST00000499601 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa21.45■■□□□ 1.02
AC008393.1-201ENST00000499601 STK36Q9NRP7 1315 aa21.44■■□□□ 1.02
AC008393.1-201ENST00000499601 USP17L10C9JJH3 530 aa21.44■■□□□ 1.02
AC008393.1-201ENST00000499601 KIF3CO14782 793 aa21.44■■□□□ 1.02
AC008393.1-201ENST00000499601 NDUFB10O96000 172 aa21.44■■□□□ 1.02
AC008393.1-201ENST00000499601 SMARCA1P28370 1054 aa21.44■■□□□ 1.02
AC008393.1-201ENST00000499601 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
AC008393.1-201ENST00000499601 CCDC96Q2M329 555 aa21.44■■□□□ 1.02
AC008393.1-201ENST00000499601 C2orf69Q8N8R5 385 aa21.44■■□□□ 1.02
AC008393.1-201ENST00000499601 FAM184AQ8NB25 1140 aa21.44■■□□□ 1.02
AC008393.1-201ENST00000499601 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
AC008393.1-201ENST00000499601 ZHX2Q9Y6X8 837 aa21.44■■□□□ 1.02
AC008393.1-201ENST00000499601 KLRF2D3W0D1 207 aa21.43■■□□□ 1.02
AC008393.1-201ENST00000499601 CELF2O95319 508 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
AC008393.1-201ENST00000499601 PLEKHA8P1O95397 391 aa21.43■■□□□ 1.02
AC008393.1-201ENST00000499601 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
AC008393.1-201ENST00000499601 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.9 ms