RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498648.5

STRADB-210, Transcript of STE20-related kinase adaptor beta, humanhuman

TSL 3

Gene STRADB, Length 535 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADB-210ENST00000498648 FOXC1Q12948 553 aa6.15□□□□□ -1.42
STRADB-210ENST00000498648 ABCB5Q2M3G0 1257 aa6.15□□□□□ -1.42
STRADB-210ENST00000498648 MINDY4Q4G0A6 757 aa6.15□□□□□ -1.42
STRADB-210ENST00000498648 CEP135Q66GS9 1140 aa6.15□□□□□ -1.42
STRADB-210ENST00000498648 KRBA2Q6ZNG9 492 aa6.15□□□□□ -1.42
STRADB-210ENST00000498648 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
STRADB-210ENST00000498648 MORC1Q86VD1 984 aa6.15□□□□□ -1.42
STRADB-210ENST00000498648 PPFIBP1Q86W92 1011 aa6.15□□□□□ -1.42
STRADB-210ENST00000498648 AMOTL1Q8IY63 956 aa6.15□□□□□ -1.42
STRADB-210ENST00000498648 OR2W6PQ8NHA6 318 aa6.15□□□□□ -1.42
STRADB-210ENST00000498648 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
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STRADB-210ENST00000498648 LRP2BPQ9P2M1 347 aa6.15□□□□□ -1.42
STRADB-210ENST00000498648 KLHL3Q9UH77 587 aa6.15□□□□□ -1.42
STRADB-210ENST00000498648 HCN2Q9UL51 889 aa6.15□□□□□ -1.42
STRADB-210ENST00000498648 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
STRADB-210ENST00000498648 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
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STRADB-210ENST00000498648 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
STRADB-210ENST00000498648 MAPTP10636 758 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
STRADB-210ENST00000498648 PYGMP11217 842 aa6.14□□□□□ -1.43
STRADB-210ENST00000498648 COL6A1P12109 1028 aa6.14□□□□□ -1.43
STRADB-210ENST00000498648 PHKG2P15735 406 aa6.14□□□□□ -1.43
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STRADB-210ENST00000498648 PMS1P54277 932 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
STRADB-210ENST00000498648 GRB10Q13322 594 aa6.14□□□□□ -1.43
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STRADB-210ENST00000498648 GBX1Q14549 363 aa6.14□□□□□ -1.43
STRADB-210ENST00000498648 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
STRADB-210ENST00000498648 PTPN21Q16825 1174 aa6.14□□□□□ -1.43
STRADB-210ENST00000498648 HFE2Q6ZVN8 426 aa6.14□□□□□ -1.43
STRADB-210ENST00000498648 HDXQ7Z353 690 aa6.14□□□□□ -1.43
STRADB-210ENST00000498648 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
STRADB-210ENST00000498648 PAF1Q8N7H5 531 aa6.14□□□□□ -1.43
STRADB-210ENST00000498648 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
STRADB-210ENST00000498648 LRRN4CLQ8ND94 238 aa6.14□□□□□ -1.43
STRADB-210ENST00000498648 SCLYQ96I15 445 aa6.14□□□□□ -1.43
STRADB-210ENST00000498648 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
STRADB-210ENST00000498648 ADAM19Q9H013 955 aa6.14□□□□□ -1.43
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STRADB-210ENST00000498648 APEX2Q9UBZ4 518 aa6.14□□□□□ -1.43
STRADB-210ENST00000498648 ADAM30Q9UKF2 790 aa6.14□□□□□ -1.43
STRADB-210ENST00000498648 LZTS1Q9Y250 596 aa6.14□□□□□ -1.43
STRADB-210ENST00000498648 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
STRADB-210ENST00000498648 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
STRADB-210ENST00000498648 RASSF10A6NK89 507 aa6.13□□□□□ -1.43
STRADB-210ENST00000498648 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa6.13□□□□□ -1.43
STRADB-210ENST00000498648 RAG1P15918 1043 aa6.13□□□□□ -1.43
STRADB-210ENST00000498648 SMPD1P17405 629 aa6.13□□□□□ -1.43
STRADB-210ENST00000498648 PTPRAP18433 802 aa6.13□□□□□ -1.43
STRADB-210ENST00000498648 SERPINB3P29508 390 aa6.13□□□□□ -1.43
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STRADB-210ENST00000498648 CFAP100Q494V2 611 aa6.13□□□□□ -1.43
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STRADB-210ENST00000498648 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
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STRADB-210ENST00000498648 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
STRADB-210ENST00000498648 ACSBG1Q96GR2 724 aa6.13□□□□□ -1.43
STRADB-210ENST00000498648 DHRS1Q96LJ7 313 aa6.13□□□□□ -1.43
STRADB-210ENST00000498648 HAUS7Q99871 368 aa6.13□□□□□ -1.43
STRADB-210ENST00000498648 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
STRADB-210ENST00000498648 ORAI3Q9BRQ5 295 aa6.13□□□□□ -1.43
STRADB-210ENST00000498648 SLC13A1Q9BZW2 595 aa6.13□□□□□ -1.43
STRADB-210ENST00000498648 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
STRADB-210ENST00000498648 TTLL8A6PVC2 850 aa6.12□□□□□ -1.43
STRADB-210ENST00000498648 M0R2C6 588 aa6.12□□□□□ -1.43
STRADB-210ENST00000498648 PGRP06401 933 aa6.12□□□□□ -1.43
STRADB-210ENST00000498648 MAN1A1P33908 653 aa6.12□□□□□ -1.43
STRADB-210ENST00000498648 INAVAQ3KP66 663 aa6.12□□□□□ -1.43
STRADB-210ENST00000498648 TMEM240Q5SV17 173 aa6.12□□□□□ -1.43
STRADB-210ENST00000498648 C6orf118Q5T5N4 469 aa6.12□□□□□ -1.43
STRADB-210ENST00000498648 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
STRADB-210ENST00000498648 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
STRADB-210ENST00000498648 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
STRADB-210ENST00000498648 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa6.12□□□□□ -1.43
STRADB-210ENST00000498648 CYFIP1Q7L576 1253 aa6.12□□□□□ -1.43
STRADB-210ENST00000498648 TMEM192Q8IY95 271 aa6.12□□□□□ -1.43
STRADB-210ENST00000498648 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP6.12□□□□□ -1.43
STRADB-210ENST00000498648 SLC6A18Q96N87 628 aa6.12□□□□□ -1.43
STRADB-210ENST00000498648 LGR4Q9BXB1 951 aa6.12□□□□□ -1.43
STRADB-210ENST00000498648 KLHL25Q9H0H3 589 aa6.12□□□□□ -1.43
STRADB-210ENST00000498648 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP6.12□□□□□ -1.43
STRADB-210ENST00000498648 ATG3Q9NT62 314 aa6.12□□□□□ -1.43
STRADB-210ENST00000498648 FAM86C1Q9NVL1 165 aa6.12□□□□□ -1.43
STRADB-210ENST00000498648 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa6.12□□□□□ -1.43
STRADB-210ENST00000498648 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa6.11□□□□□ -1.43
STRADB-210ENST00000498648 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
STRADB-210ENST00000498648 FZD9O00144 591 aa6.11□□□□□ -1.43
STRADB-210ENST00000498648 APAF1O14727 1248 aa6.11□□□□□ -1.43
STRADB-210ENST00000498648 ERC2O15083 957 aa6.11□□□□□ -1.43
STRADB-210ENST00000498648 TBX1O43435 398 aa6.11□□□□□ -1.43
STRADB-210ENST00000498648 CBFA2T2O43439 604 aa6.11□□□□□ -1.43
STRADB-210ENST00000498648 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
STRADB-210ENST00000498648 MYL3P08590 195 aa6.11□□□□□ -1.43
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