RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498007.1

HLA-B-255, Transcript of major histocompatibility complex, class I, B, humanhuman

Gene HLA-B, Length 1,087 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-B-255ENST00000498007 ADGRA2Q96PE1 1338 aa23.38■■□□□ 1.33
HLA-B-255ENST00000498007 B4E1Z4 1266 aa23.38■■□□□ 1.33
HLA-B-255ENST00000498007 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa23.38■■□□□ 1.33
HLA-B-255ENST00000498007 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
HLA-B-255ENST00000498007 PRDM10Q9NQV6 1147 aa23.38■■□□□ 1.33
HLA-B-255ENST00000498007 IL17RBQ9NRM6 502 aa23.38■■□□□ 1.33
HLA-B-255ENST00000498007 TAF6LQ9Y6J9 622 aa23.38■■□□□ 1.33
HLA-B-255ENST00000498007 FKTNO75072 461 aa23.37■■□□□ 1.33
HLA-B-255ENST00000498007 KDM4AO75164 1064 aa23.37■■□□□ 1.33
HLA-B-255ENST00000498007 LPAR1Q92633 364 aa23.37■■□□□ 1.33
HLA-B-255ENST00000498007 TANGO6Q9C0B7 1094 aa23.37■■□□□ 1.33
HLA-B-255ENST00000498007 CNNM2Q9H8M5 875 aa23.37■■□□□ 1.33
HLA-B-255ENST00000498007 USP17L15C9J2P7 530 aa23.36■■□□□ 1.33
HLA-B-255ENST00000498007 USP17L13C9JLJ4 530 aa23.36■■□□□ 1.33
HLA-B-255ENST00000498007 USP17L11C9JVI0 530 aa23.36■■□□□ 1.33
HLA-B-255ENST00000498007 USP17L18D6R9N7 530 aa23.36■■□□□ 1.33
HLA-B-255ENST00000498007 USP17L22D6RA61 530 aa23.36■■□□□ 1.33
HLA-B-255ENST00000498007 USP17L17D6RBQ6 530 aa23.36■■□□□ 1.33
HLA-B-255ENST00000498007 USP17L19D6RCP7 530 aa23.36■■□□□ 1.33
HLA-B-255ENST00000498007 USP17L20D6RJB6 530 aa23.36■■□□□ 1.33
HLA-B-255ENST00000498007 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
HLA-B-255ENST00000498007 USP17L24Q0WX57 530 aa23.36■■□□□ 1.33
HLA-B-255ENST00000498007 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
HLA-B-255ENST00000498007 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa23.36■■□□□ 1.33
HLA-B-255ENST00000498007 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa23.36■■□□□ 1.33
HLA-B-255ENST00000498007 KRT23Q9C075 422 aa23.36■■□□□ 1.33
HLA-B-255ENST00000498007 TRDNQ13061 729 aa23.35■■□□□ 1.33
HLA-B-255ENST00000498007 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa23.35■■□□□ 1.33
HLA-B-255ENST00000498007 E7EWF7 191 aa23.34■■□□□ 1.33
HLA-B-255ENST00000498007 WDR46O15213 610 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
HLA-B-255ENST00000498007 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
HLA-B-255ENST00000498007 HERVK_113P62684 666 aa23.34■■□□□ 1.33
HLA-B-255ENST00000498007 SP3Q02447 781 aa23.34■■□□□ 1.33
HLA-B-255ENST00000498007 CREB3L3Q68CJ9 461 aa23.34■■□□□ 1.33
HLA-B-255ENST00000498007 C17orf99Q6UX52 265 aa23.34■■□□□ 1.33
HLA-B-255ENST00000498007 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa23.34■■□□□ 1.33
HLA-B-255ENST00000498007 F5H6K3 240 aa23.33■■□□□ 1.33
HLA-B-255ENST00000498007 SLC27A2O14975 620 aa23.33■■□□□ 1.33
HLA-B-255ENST00000498007 NDUFB10O96000 172 aa23.33■■□□□ 1.33
HLA-B-255ENST00000498007 KLRC3Q07444 240 aa23.33■■□□□ 1.33
HLA-B-255ENST00000498007 FAM83BQ5T0W9 1011 aa23.33■■□□□ 1.33
HLA-B-255ENST00000498007 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
HLA-B-255ENST00000498007 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa23.33■■□□□ 1.33
HLA-B-255ENST00000498007 STOX1Q6ZVD7 989 aa23.33■■□□□ 1.33
HLA-B-255ENST00000498007 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
HLA-B-255ENST00000498007 IQCA1Q86XH1 822 aa23.33■■□□□ 1.33
HLA-B-255ENST00000498007 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa23.33■■□□□ 1.33
HLA-B-255ENST00000498007 CD99L2Q8TCZ2 262 aa23.33■■□□□ 1.33
HLA-B-255ENST00000498007 MKL1Q969V6 931 aa23.33■■□□□ 1.33
HLA-B-255ENST00000498007 CHMP4CQ96CF2 233 aa23.33■■□□□ 1.33
HLA-B-255ENST00000498007 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
HLA-B-255ENST00000498007 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
HLA-B-255ENST00000498007 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa23.33■■□□□ 1.33
HLA-B-255ENST00000498007 PARP14Q460N5 1801 aa23.33■■□□□ 1.32
HLA-B-255ENST00000498007 BCRP11274 1271 aa23.32■■□□□ 1.32
HLA-B-255ENST00000498007 NT5C2P49902 561 aa23.32■■□□□ 1.32
HLA-B-255ENST00000498007 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
HLA-B-255ENST00000498007 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa23.32■■□□□ 1.32
HLA-B-255ENST00000498007 MTMR7Q9Y216 660 aa23.32■■□□□ 1.32
HLA-B-255ENST00000498007 REC8O95072 547 aa23.31■■□□□ 1.32
HLA-B-255ENST00000498007 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
HLA-B-255ENST00000498007 NECTIN1Q15223 517 aa23.31■■□□□ 1.32
HLA-B-255ENST00000498007 SLFN13Q68D06 897 aa23.31■■□□□ 1.32
HLA-B-255ENST00000498007 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa23.31■■□□□ 1.32
HLA-B-255ENST00000498007 NCOA7Q8NI08 942 aa23.31■■□□□ 1.32
HLA-B-255ENST00000498007 ERO1AQ96HE7 468 aa23.31■■□□□ 1.32
HLA-B-255ENST00000498007 UBAC1Q9BSL1 405 aa23.31■■□□□ 1.32
HLA-B-255ENST00000498007 ZSWIM5Q9P217 1185 aa23.31■■□□□ 1.32
HLA-B-255ENST00000498007 FLOT1O75955 427 aa23.3■■□□□ 1.32
HLA-B-255ENST00000498007 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
HLA-B-255ENST00000498007 RNF20Q5VTR2 975 aa23.3■■□□□ 1.32
HLA-B-255ENST00000498007 CYB5R4Q7L1T6 521 aa23.3■■□□□ 1.32
HLA-B-255ENST00000498007 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
HLA-B-255ENST00000498007 TMEM47Q9BQJ4 181 aa23.3■■□□□ 1.32
HLA-B-255ENST00000498007 PAGR1Q9BTK6 254 aa23.3■■□□□ 1.32
HLA-B-255ENST00000498007 A0A0G2JMZ2 1700 aa23.3■■□□□ 1.32
HLA-B-255ENST00000498007 TNKSO95271 1327 aa23.3■■□□□ 1.32
HLA-B-255ENST00000498007 RLFQ13129 1914 aa23.29■■□□□ 1.32
HLA-B-255ENST00000498007 PEX10O60683 326 aa23.29■■□□□ 1.32
HLA-B-255ENST00000498007 TOP1P11387 765 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
HLA-B-255ENST00000498007 NOVP48745 357 aa23.29■■□□□ 1.32
HLA-B-255ENST00000498007 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
HLA-B-255ENST00000498007 RCSD1Q6JBY9 416 aa23.29■■□□□ 1.32
HLA-B-255ENST00000498007 RASGRP2Q7LDG7 609 aa23.29■■□□□ 1.32
HLA-B-255ENST00000498007 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
HLA-B-255ENST00000498007 COG2Q14746 738 aa23.28■■□□□ 1.32
HLA-B-255ENST00000498007 KIF22Q14807 665 aa23.28■■□□□ 1.32
HLA-B-255ENST00000498007 FAM110CQ1W6H9 321 aa23.28■■□□□ 1.32
HLA-B-255ENST00000498007 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
HLA-B-255ENST00000498007 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa23.28■■□□□ 1.32
HLA-B-255ENST00000498007 FBXO28Q9NVF7 368 aa23.28■■□□□ 1.32
HLA-B-255ENST00000498007 MGAMO43451 1857 aa23.28■■□□□ 1.32
HLA-B-255ENST00000498007 CCDC178Q5BJE1 867 aa23.27■■□□□ 1.32
HLA-B-255ENST00000498007 CHST3Q7LGC8 479 aa23.27■■□□□ 1.32
HLA-B-255ENST00000498007 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
HLA-B-255ENST00000498007 TTC14Q96N46 770 aa23.27■■□□□ 1.32
HLA-B-255ENST00000498007 TXNRD2Q9NNW7 524 aa23.27■■□□□ 1.32
HLA-B-255ENST00000498007 BMP3P12645 472 aa23.26■■□□□ 1.31
HLA-B-255ENST00000498007 MCCP23508 829 aa23.26■■□□□ 1.31
HLA-B-255ENST00000498007 SLC1A4P43007 532 aa23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.6 ms