RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494945.1

PKP4-215, Transcript of plakophilin 4, human

TSL 5

Gene PKP4, Length 522 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKP4-215	ENST00000494945	ZBTB21	Q9ULJ3	1066 aa		12.82	□□□□□ -0.36
PKP4-215	ENST00000494945	ZDHHC9	Q9Y397	364 aa		12.82	□□□□□ -0.36
PKP4-215	ENST00000494945	RBBP6	Q7Z6E9	1792 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
PKP4-215	ENST00000494945	COL11A1	P12107	1806 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
PKP4-215	ENST00000494945	PALM3	A6NDB9	673 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
PKP4-215	ENST00000494945	PHF20L1	A8MW92	1017 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PKP4-215	ENST00000494945	DEXI	O95424	95 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PKP4-215	ENST00000494945	ASNS	P08243	561 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PKP4-215	ENST00000494945	PARP1	P09874	1014 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
PKP4-215	ENST00000494945	EEF2	P13639	858 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
PKP4-215	ENST00000494945	CAP2	P40123	477 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PKP4-215	ENST00000494945	ICA1	Q05084	483 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PKP4-215	ENST00000494945	RRP1B	Q14684	758 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
PKP4-215	ENST00000494945	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PKP4-215	ENST00000494945	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
PKP4-215	ENST00000494945	MIGA2	Q7L4E1	593 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PKP4-215	ENST00000494945	PHKB	Q93100	1093 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PKP4-215	ENST00000494945	DCPS	Q96C86	337 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
PKP4-215	ENST00000494945	SLC26A6	Q9BXS9	759 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PKP4-215	ENST00000494945	ZNF341	Q9BYN7	854 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PKP4-215	ENST00000494945	RBM27	Q9P2N5	1060 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
PKP4-215	ENST00000494945	SCAF8	Q9UPN6	1271 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
PKP4-215	ENST00000494945	MTMR6	Q9Y217	621 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PKP4-215	ENST00000494945	SSC5D	A1L4H1	1573 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PKP4-215	ENST00000494945	UTRN	P46939	3433 aa		12.81	□□□□□ -0.36
PKP4-215	ENST00000494945	VPS37C	A5D8V6	355 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
PKP4-215	ENST00000494945		H3BQV1	296 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PKP4-215	ENST00000494945	PRPF3	O43395	683 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
PKP4-215	ENST00000494945	DTNB	O60941	627 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PKP4-215	ENST00000494945	SNHG28	P0DPA3	235 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PKP4-215	ENST00000494945	SMARCA1	P28370	1054 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PKP4-215	ENST00000494945	AKAP17A	Q02040	695 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
PKP4-215	ENST00000494945	FUT2	Q10981	343 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PKP4-215	ENST00000494945	ASPRV1	Q53RT3	343 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PKP4-215	ENST00000494945	IFFO2	Q5TF58	517 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PKP4-215	ENST00000494945	CLEC17A	Q6ZS10	378 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PKP4-215	ENST00000494945	PNMA8A	Q86V59	439 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
PKP4-215	ENST00000494945	CLEC10A	Q8IUN9	316 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PKP4-215	ENST00000494945	SULF1	Q8IWU6	871 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PKP4-215	ENST00000494945	LRRC47	Q8N1G4	583 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
PKP4-215	ENST00000494945	C8orf76	Q96K31	380 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PKP4-215	ENST00000494945	GBP4	Q96PP9	640 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PKP4-215	ENST00000494945	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
PKP4-215	ENST00000494945	ARHGEF10L	Q9HCE6	1279 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PKP4-215	ENST00000494945	MAD2L2	Q9UI95	211 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PKP4-215	ENST00000494945	ATP6V1D	Q9Y5K8	247 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PKP4-215	ENST00000494945	CNTNAP5	Q8WYK1	1306 aa		12.8	□□□□□ -0.36
PKP4-215	ENST00000494945	LOC285556	D6RIA3	1793 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PKP4-215	ENST00000494945	CTNND1	O60716	968 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
PKP4-215	ENST00000494945	PLEKHA8P1	O95397	391 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PKP4-215	ENST00000494945	F13A1	P00488	732 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PKP4-215	ENST00000494945	PDHB	P11177	359 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PKP4-215	ENST00000494945	JAG1	P78504	1218 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PKP4-215	ENST00000494945	ATP2B2	Q01814	1243 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PKP4-215	ENST00000494945	SHROOM1	Q2M3G4	852 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
PKP4-215	ENST00000494945	SIAH1	Q8IUQ4	282 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PKP4-215	ENST00000494945	SRBD1	Q8N5C6	995 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
PKP4-215	ENST00000494945	GMCL1P1	Q8NEA9	526 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PKP4-215	ENST00000494945	DCAF4	Q8WV16	495 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PKP4-215	ENST00000494945	ALG1	Q9BT22	464 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PKP4-215	ENST00000494945	SH2D4A	Q9H788	454 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PKP4-215	ENST00000494945	ZNF112	Q9UJU3	913 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PKP4-215	ENST00000494945	SMCHD1	A6NHR9	2005 aa		12.79	□□□□□ -0.36
PKP4-215	ENST00000494945	RLF	Q13129	1914 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PKP4-215	ENST00000494945	USP17L5	A8MUK1	530 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PKP4-215	ENST00000494945	POTEC	B2RU33	542 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PKP4-215	ENST00000494945	TRIM29	Q14134	588 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PKP4-215	ENST00000494945	GPATCH4	Q5T3I0	446 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
PKP4-215	ENST00000494945	CDC37L1	Q7L3B6	337 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PKP4-215	ENST00000494945	USP48	Q86UV5	1035 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PKP4-215	ENST00000494945	CMTR1	Q8N1G2	835 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
PKP4-215	ENST00000494945	STAG2	Q8N3U4	1231 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PKP4-215	ENST00000494945	FBXO18	Q8NFZ0	1043 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PKP4-215	ENST00000494945	SPZ1	Q9BXG8	430 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PKP4-215	ENST00000494945	MTMR7	Q9Y216	660 aa		12.78	□□□□□ -0.36
PKP4-215	ENST00000494945	KLRF2	D3W0D1	207 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PKP4-215	ENST00000494945	PPFIA3	O75145	1194 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PKP4-215	ENST00000494945	XBP1	P17861	261 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PKP4-215	ENST00000494945	ZNF543	Q08ER8	600 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PKP4-215	ENST00000494945	SLFN13	Q68D06	897 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PKP4-215	ENST00000494945	USP17L2	Q6R6M4	530 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PKP4-215	ENST00000494945	KRT26	Q7Z3Y9	468 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PKP4-215	ENST00000494945	CCDC82	Q8N4S0	544 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PKP4-215	ENST00000494945	GMCL1	Q96IK5	515 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PKP4-215	ENST00000494945	ZSCAN16	Q9H4T2	348 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.37
PKP4-215	ENST00000494945	TMX2	Q9Y320	296 aa		12.77	□□□□□ -0.37
PKP4-215	ENST00000494945		V9GY48	417 aa	Predicted RBP	12.77	□□□□□ -0.37
PKP4-215	ENST00000494945	MYH7B	A7E2Y1	1941 aa		12.76	□□□□□ -0.37
PKP4-215	ENST00000494945		F5H6K3	240 aa		12.76	□□□□□ -0.37
PKP4-215	ENST00000494945	BAG4	O95429	457 aa	Known RBP	12.76	□□□□□ -0.37
PKP4-215	ENST00000494945	KLRC3	Q07444	240 aa		12.76	□□□□□ -0.37
PKP4-215	ENST00000494945	PKN1	Q16512	942 aa		12.76	□□□□□ -0.37
PKP4-215	ENST00000494945	PFKFB3	Q16875	520 aa	Predicted RBP	12.76	□□□□□ -0.37
PKP4-215	ENST00000494945	FOXD4L5	Q5VV16	416 aa	Predicted RBP	12.76	□□□□□ -0.37
PKP4-215	ENST00000494945	SCYL3	Q8IZE3	742 aa		12.76	□□□□□ -0.37
PKP4-215	ENST00000494945	FAM177A1	Q8N128	213 aa	Predicted RBP	12.76	□□□□□ -0.37
PKP4-215	ENST00000494945	FOXD4L4	Q8WXT5	416 aa	Predicted RBP	12.76	□□□□□ -0.37
PKP4-215	ENST00000494945	GOPC	Q9HD26	462 aa		12.76	□□□□□ -0.37
PKP4-215	ENST00000494945	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		12.76	□□□□□ -0.37
PKP4-215	ENST00000494945		A0A1W2PRG0	241 aa		12.75	□□□□□ -0.37

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