RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492954.1

PTPRU-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRU, Length 625 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-207ENST00000492954 SPICE1Q8N0Z3 855 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRU-207ENST00000492954 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
PTPRU-207ENST00000492954 SOCS4Q8WXH5 440 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRU-207ENST00000492954 NUDT12Q9BQG2 462 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRU-207ENST00000492954 SH2D4AQ9H788 454 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRU-207ENST00000492954 BTBD7Q9P203 1132 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRU-207ENST00000492954 STAP2Q9UGK3 403 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRU-207ENST00000492954 ROBO3Q96MS0 1386 aa21.57■■□□□ 1.04
PTPRU-207ENST00000492954 EEF2P13639 858 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
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PTPRU-207ENST00000492954 ATP2B2Q01814 1243 aa21.56■■□□□ 1.04
PTPRU-207ENST00000492954 TRIM32Q13049 653 aa21.56■■□□□ 1.04
PTPRU-207ENST00000492954 PLEKHH3Q7Z736 793 aa21.56■■□□□ 1.04
PTPRU-207ENST00000492954 LPAR1Q92633 364 aa21.56■■□□□ 1.04
PTPRU-207ENST00000492954 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP21.56■■□□□ 1.04
PTPRU-207ENST00000492954 LNPKQ9C0E8 428 aa21.56■■□□□ 1.04
PTPRU-207ENST00000492954 VCPKMTQ9H867 229 aa21.56■■□□□ 1.04
PTPRU-207ENST00000492954 MYH8P13535 1937 aa21.56■■□□□ 1.04
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PTPRU-207ENST00000492954 TRIB2Q92519 343 aa21.55■■□□□ 1.04
PTPRU-207ENST00000492954 DEFB118Q96PH6 123 aa21.55■■□□□ 1.04
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PTPRU-207ENST00000492954 MKNK2Q9HBH9 465 aa21.55■■□□□ 1.04
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PTPRU-207ENST00000492954 USP6NLQ92738 828 aa21.54■■□□□ 1.04
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PTPRU-207ENST00000492954 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPRU-207ENST00000492954 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPRU-207ENST00000492954 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPRU-207ENST00000492954 SMC5Q8IY18 1101 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPRU-207ENST00000492954 EVI5LQ96CN4 794 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPRU-207ENST00000492954 NACAP1Q9BZK3 213 aa21.53■■□□□ 1.04
PTPRU-207ENST00000492954 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP21.53■■□□□ 1.04
PTPRU-207ENST00000492954 WDR46O15213 610 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
PTPRU-207ENST00000492954 FLOT1O75955 427 aa21.52■■□□□ 1.04
PTPRU-207ENST00000492954 IGHDP01880 384 aa21.52■■□□□ 1.04
PTPRU-207ENST00000492954 RGS2P41220 211 aa21.52■■□□□ 1.04
PTPRU-207ENST00000492954 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
PTPRU-207ENST00000492954 RAD21O60216 631 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPRU-207ENST00000492954 PRDM1O75626 825 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPRU-207ENST00000492954 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
PTPRU-207ENST00000492954 DSG3P32926 999 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPRU-207ENST00000492954 CCL14Q16627 93 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPRU-207ENST00000492954 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
PTPRU-207ENST00000492954 ATG4CQ96DT6 458 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPRU-207ENST00000492954 APBA2Q99767 749 aa21.51■■□□□ 1.03
PTPRU-207ENST00000492954 NAPBQ9H115 298 aa21.51■■□□□ 1.03
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PTPRU-207ENST00000492954 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa21.5■■□□□ 1.03
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PTPRU-207ENST00000492954 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
PTPRU-207ENST00000492954 RPTORQ8N122 1335 aa21.5■■□□□ 1.03
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PTPRU-207ENST00000492954 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa21.49■■□□□ 1.03
PTPRU-207ENST00000492954 CHD1LQ86WJ1 897 aa21.49■■□□□ 1.03
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PTPRU-207ENST00000492954 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
PTPRU-207ENST00000492954 MB21D1Q8N884 522 aa21.49■■□□□ 1.03
PTPRU-207ENST00000492954 SPATC1LQ9H0A9 340 aa21.49■■□□□ 1.03
PTPRU-207ENST00000492954 ZNF287Q9HBT7 754 aa21.49■■□□□ 1.03
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PTPRU-207ENST00000492954 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
PTPRU-207ENST00000492954 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa21.48■■□□□ 1.03
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PTPRU-207ENST00000492954 A0A0G2JMZ2 1700 aa21.47■■□□□ 1.03
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PTPRU-207ENST00000492954 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
PTPRU-207ENST00000492954 PLS1Q14651 629 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRU-207ENST00000492954 VPS53Q5VIR6 699 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRU-207ENST00000492954 FAM227BQ96M60 508 aa21.47■■□□□ 1.03
PTPRU-207ENST00000492954 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
PTPRU-207ENST00000492954 A0A0D9SFI3 127 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPRU-207ENST00000492954 ERCC3P19447 782 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPRU-207ENST00000492954 PDE4BQ07343 736 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPRU-207ENST00000492954 SHCBP1Q8NEM2 672 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPRU-207ENST00000492954 CEP95Q96GE4 821 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPRU-207ENST00000492954 HELLSQ9NRZ9 838 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPRU-207ENST00000492954 FLRT1Q9NZU1 646 aa21.46■■□□□ 1.03
PTPRU-207ENST00000492954 CLIP2Q9UDT6 1046 aa21.46■■□□□ 1.03
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